FuNGI

Q0CLP8

Protein Details

Accession

Q0CLP8

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
80-105	EDSISTRSTRRTSRRRKSTSATTTTN	Hydrophilic
367-391	QNGTSRSQSRGRKRTRRSSRGSSTG	Hydrophilic
511-534	EPLPLPPQRKRSRSRAASPREEST	Hydrophilic
541-573	EPESVANKRPRGRPKGKGGRPKRENENDRPKGK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
371-402	SRSQSRGRKRTRRSSRGSSTGPRSRSAHSSRR
519-526	RKRSRSRA
547-578	NKRPRGRPKGKGGRPKRENENDRPKGKGEHRK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000637 HMGI/Y_DNA-bd_CS IPR019622 Rrn9_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF10680 RRN9
PROSITE	View protein in PROSITE PS00354 HMGI_Y

Amino Acid Sequences

MSHPSSSQFVPPQSAQPYRSIFGGSSSQNVPDSEPPHVFEDGNHEENELDVLMGDQPLVPNGSDDDDTYEESNAEESGSEDSISTRSTRRTSRRRKSTSATTTTNQRIIESPSPSPPSYRPNRFHGPEPTWRKLTLEDRQNAEALEDLRAKDLAAHLYNAYALRARAREIAKRAAERDVGVADAEPFLPPKRWAAWPVPANEVPRGDEYRRDDETWTLKMPADPRPSADLEESIMALMLRHAKERFNARPWRSTRPTSPNPFDPASQAETQDDSAATEDAVKIESGFMDASIPLRPVVQADDDQSRKQLRPITRNIITEFDRLLLGLHHARKNVTAGDDSSASEWQTDTESITSGSSVSVRRQRRSQNGTSRSQSRGRKRTRRSSRGSSTGPRSRSAHSSRRASSASQSTYQPSRSSRSRGRSAGSDRRQPATRKLRMGLRDWSEILGVASMVGWPPAVVMRTAQRCGALFREDMAYRTFKEGKLQQTEDGDPAAWEYAESDTGLSEASVEPLPLPPQRKRSRSRAASPREESTSRPVSTEPESVANKRPRGRPKGKGGRPKRENENDRPKGKGEHRKQDLVCPVRSCSRHMNGFSRTWNLNIHLKRMHPGYAARDGAKSPAVVVEDDTDDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.44
3	0.45
4	0.47
5	0.42
6	0.42
7	0.36
8	0.29
9	0.27
10	0.31
11	0.25
12	0.25
13	0.25
14	0.26
15	0.26
16	0.26
17	0.26
18	0.27
19	0.28
20	0.29
21	0.3
22	0.3
23	0.32
24	0.33
25	0.29
26	0.24
27	0.3
28	0.31
29	0.32
30	0.3
31	0.27
32	0.25
33	0.25
34	0.25
35	0.16
36	0.09
37	0.06
38	0.06
39	0.07
40	0.07
41	0.07
42	0.06
43	0.07
44	0.08
45	0.09
46	0.08
47	0.08
48	0.1
49	0.13
50	0.13
51	0.13
52	0.16
53	0.16
54	0.18
55	0.19
56	0.18
57	0.15
58	0.15
59	0.15
60	0.1
61	0.09
62	0.07
63	0.07
64	0.09
65	0.09
66	0.09
67	0.08
68	0.09
69	0.1
70	0.12
71	0.13
72	0.14
73	0.19
74	0.25
75	0.35
76	0.45
77	0.55
78	0.65
79	0.74
80	0.82
81	0.84
82	0.86
83	0.85
84	0.86
85	0.84
86	0.81
87	0.76
88	0.68
89	0.69
90	0.66
91	0.62
92	0.51
93	0.42
94	0.37
95	0.38
96	0.4
97	0.35
98	0.33
99	0.35
100	0.4
101	0.39
102	0.4
103	0.37
104	0.41
105	0.46
106	0.53
107	0.52
108	0.55
109	0.64
110	0.64
111	0.67
112	0.66
113	0.63
114	0.63
115	0.67
116	0.65
117	0.59
118	0.56
119	0.5
120	0.48
121	0.49
122	0.48
123	0.48
124	0.48
125	0.49
126	0.5
127	0.49
128	0.43
129	0.35
130	0.29
131	0.2
132	0.18
133	0.16
134	0.15
135	0.16
136	0.16
137	0.15
138	0.14
139	0.15
140	0.16
141	0.15
142	0.16
143	0.14
144	0.15
145	0.16
146	0.15
147	0.14
148	0.11
149	0.1
150	0.13
151	0.14
152	0.15
153	0.2
154	0.23
155	0.29
156	0.32
157	0.4
158	0.41
159	0.44
160	0.44
161	0.41
162	0.39
163	0.33
164	0.3
165	0.22
166	0.18
167	0.14
168	0.12
169	0.09
170	0.08
171	0.08
172	0.06
173	0.07
174	0.08
175	0.1
176	0.11
177	0.13
178	0.16
179	0.19
180	0.23
181	0.27
182	0.34
183	0.37
184	0.38
185	0.41
186	0.4
187	0.39
188	0.37
189	0.34
190	0.27
191	0.26
192	0.28
193	0.23
194	0.27
195	0.3
196	0.33
197	0.36
198	0.35
199	0.32
200	0.33
201	0.36
202	0.32
203	0.28
204	0.24
205	0.21
206	0.22
207	0.24
208	0.28
209	0.3
210	0.27
211	0.28
212	0.3
213	0.31
214	0.3
215	0.28
216	0.21
217	0.15
218	0.15
219	0.13
220	0.09
221	0.08
222	0.06
223	0.05
224	0.06
225	0.09
226	0.09
227	0.12
228	0.14
229	0.15
230	0.19
231	0.27
232	0.31
233	0.35
234	0.44
235	0.45
236	0.53
237	0.56
238	0.62
239	0.59
240	0.59
241	0.58
242	0.58
243	0.64
244	0.63
245	0.64
246	0.58
247	0.57
248	0.54
249	0.46
250	0.39
251	0.32
252	0.28
253	0.24
254	0.21
255	0.17
256	0.16
257	0.16
258	0.14
259	0.12
260	0.08
261	0.08
262	0.07
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.05
267	0.06
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.1
288	0.15
289	0.17
290	0.17
291	0.2
292	0.21
293	0.2
294	0.23
295	0.27
296	0.27
297	0.33
298	0.39
299	0.43
300	0.45
301	0.47
302	0.45
303	0.42
304	0.37
305	0.31
306	0.25
307	0.18
308	0.14
309	0.12
310	0.11
311	0.07
312	0.08
313	0.11
314	0.15
315	0.16
316	0.17
317	0.17
318	0.18
319	0.19
320	0.18
321	0.15
322	0.12
323	0.11
324	0.12
325	0.12
326	0.12
327	0.11
328	0.11
329	0.09
330	0.08
331	0.07
332	0.06
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.12
346	0.2
347	0.25
348	0.28
349	0.35
350	0.42
351	0.5
352	0.57
353	0.62
354	0.64
355	0.66
356	0.68
357	0.67
358	0.63
359	0.58
360	0.58
361	0.57
362	0.57
363	0.6
364	0.65
365	0.71
366	0.75
367	0.82
368	0.85
369	0.87
370	0.85
371	0.85
372	0.81
373	0.79
374	0.75
375	0.7
376	0.68
377	0.65
378	0.59
379	0.53
380	0.48
381	0.43
382	0.46
383	0.47
384	0.46
385	0.47
386	0.52
387	0.51
388	0.53
389	0.51
390	0.44
391	0.42
392	0.4
393	0.36
394	0.31
395	0.31
396	0.3
397	0.31
398	0.32
399	0.3
400	0.25
401	0.28
402	0.31
403	0.37
404	0.42
405	0.46
406	0.52
407	0.52
408	0.52
409	0.53
410	0.57
411	0.6
412	0.58
413	0.59
414	0.55
415	0.56
416	0.59
417	0.55
418	0.57
419	0.57
420	0.57
421	0.53
422	0.55
423	0.57
424	0.55
425	0.56
426	0.54
427	0.47
428	0.44
429	0.4
430	0.36
431	0.29
432	0.25
433	0.21
434	0.13
435	0.08
436	0.05
437	0.05
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.03
442	0.03
443	0.04
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.07
448	0.14
449	0.18
450	0.2
451	0.2
452	0.21
453	0.21
454	0.23
455	0.24
456	0.2
457	0.17
458	0.17
459	0.21
460	0.19
461	0.2
462	0.21
463	0.2
464	0.18
465	0.24
466	0.26
467	0.22
468	0.29
469	0.33
470	0.39
471	0.44
472	0.45
473	0.42
474	0.44
475	0.45
476	0.38
477	0.33
478	0.25
479	0.17
480	0.16
481	0.13
482	0.09
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.08
488	0.07
489	0.06
490	0.07
491	0.07
492	0.05
493	0.06
494	0.05
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.08
499	0.09
500	0.13
501	0.17
502	0.23
503	0.27
504	0.38
505	0.47
506	0.56
507	0.62
508	0.69
509	0.75
510	0.78
511	0.83
512	0.83
513	0.82
514	0.83
515	0.8
516	0.75
517	0.7
518	0.63
519	0.55
520	0.53
521	0.51
522	0.41
523	0.38
524	0.34
525	0.31
526	0.34
527	0.34
528	0.28
529	0.28
530	0.31
531	0.33
532	0.42
533	0.46
534	0.48
535	0.53
536	0.6
537	0.63
538	0.7
539	0.76
540	0.77
541	0.8
542	0.84
543	0.87
544	0.89
545	0.89
546	0.9
547	0.89
548	0.87
549	0.87
550	0.87
551	0.86
552	0.86
553	0.87
554	0.85
555	0.8
556	0.75
557	0.68
558	0.66
559	0.67
560	0.67
561	0.66
562	0.67
563	0.71
564	0.77
565	0.75
566	0.74
567	0.75
568	0.7
569	0.65
570	0.57
571	0.54
572	0.53
573	0.53
574	0.5
575	0.49
576	0.5
577	0.53
578	0.56
579	0.59
580	0.56
581	0.6
582	0.59
583	0.56
584	0.5
585	0.44
586	0.42
587	0.39
588	0.43
589	0.4
590	0.43
591	0.42
592	0.42
593	0.46
594	0.45
595	0.44
596	0.39
597	0.41
598	0.41
599	0.44
600	0.46
601	0.42
602	0.41
603	0.38
604	0.37
605	0.34
606	0.28
607	0.2
608	0.19
609	0.19
610	0.17
611	0.18
612	0.18

Q0CLP8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer