FuNGI

Q0CPF0

Protein Details

Accession

Q0CPF0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-55	ENGVYHGYKPRKRARQNATDLKEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
556-595	PQGRGRGQAAGRGQAPGRGGARGNSQRGGAPRGRGQPSNR

Subcellular Location(s)

cyto 14, cyto_nucl 10.5, nucl 5, cysk 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0055087 C:Ski complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0030968 P:endoplasmic reticulum unfolded protein response GO:0070478 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay GO:0070481 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MAEALASTLAELSLSTQHLSGAEFDARITDEENGVYHGYKPRKRARQNATDLKEELEAEFLTPSAQFSPEWLNRLQRRWDVSADYTDLFEVAGTQTRTIVRFDREGLEGRVTGYHEVTVPASSANAKNSTSLLRRPAGRADFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAEMESEAQTAEQQRPGGKQAGLDRIINFGAEGGLLEVAPGFTRGLRFEEAKSKEAAEGDQEVEHALQQEESQLSVERDEATSDIEGGVKIEDEDELSGDEEDIDALLPVEFPALEPRAPLLSGIQKKGGREWAHVVDVNKDIPNFGELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLESGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFDDVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTAKRPVPLEHYLWAGKDKFKIVDSNKRFLENGWKEADNVISGRDKIKAQKAAEAQAQSQAQRGGPQGRGRGQAAGRGQAPGRGGARGNSQRGGAPRGRGQPSNRGTGNIARTGRGGGRTTAAQDKTIWVQLVQHLRKENLLPGCIFVFSKKRCEENADSLSNQDFCNASEKSLIHMFIEKSLTRLKPEDRDLPQIRRLRDLLSRGIAVHHGGLLPIMKEIVEILFAKSLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGKGFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGYVIIVSVGKDEAPPAAALRRMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQVQLSEASLEKIKREACDICDVDLTACHDAAIEYEKLTSELHVGLVSSPIGKRLFSPKRLIVYRKDGYRTAGIIVREGVGGGPTPNIQVLEIGKLGSRRHPSDILPFLPEFRKLMQPLPTRAADMTLKVCKIPLSDLECITNTLVKLSGPTWYLNIKKEAIKFADKELSKLCGSWATPVWDEMDWSRIKELQVRDILEKRRAQAKIAQSCRSVQCPDFLKHFEMQHDEWQVKENISQLKQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLRELGFIDEQSRVQLKGKVACEIHSADELVLTELILENVLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTENVPTLTPRLEKGKEAIVRISDKVNDFQVQYQVIQSSEDSNDFASQPRFGLAEVVYEWAKGMSFNRITDLTDVMEGTIVRTITRLDETCREVKNAAKLVGDPTLYTKMQQAQELIKRDVIFAASLYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.12
3	0.12
4	0.13
5	0.13
6	0.14
7	0.14
8	0.15
9	0.15
10	0.15
11	0.14
12	0.15
13	0.16
14	0.16
15	0.16
16	0.13
17	0.13
18	0.13
19	0.14
20	0.15
21	0.15
22	0.15
23	0.17
24	0.24
25	0.33
26	0.37
27	0.46
28	0.55
29	0.64
30	0.73
31	0.8
32	0.82
33	0.83
34	0.89
35	0.9
36	0.84
37	0.79
38	0.71
39	0.62
40	0.54
41	0.44
42	0.33
43	0.25
44	0.2
45	0.15
46	0.14
47	0.12
48	0.1
49	0.09
50	0.1
51	0.09
52	0.1
53	0.09
54	0.12
55	0.22
56	0.25
57	0.28
58	0.3
59	0.39
60	0.44
61	0.51
62	0.56
63	0.53
64	0.56
65	0.57
66	0.57
67	0.53
68	0.5
69	0.49
70	0.44
71	0.38
72	0.32
73	0.28
74	0.23
75	0.18
76	0.13
77	0.1
78	0.08
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.16
83	0.19
84	0.2
85	0.23
86	0.26
87	0.25
88	0.27
89	0.3
90	0.31
91	0.31
92	0.34
93	0.34
94	0.32
95	0.28
96	0.25
97	0.25
98	0.23
99	0.22
100	0.19
101	0.17
102	0.14
103	0.15
104	0.15
105	0.13
106	0.12
107	0.1
108	0.11
109	0.14
110	0.15
111	0.18
112	0.2
113	0.2
114	0.21
115	0.23
116	0.29
117	0.29
118	0.32
119	0.35
120	0.37
121	0.4
122	0.42
123	0.48
124	0.46
125	0.47
126	0.44
127	0.45
128	0.44
129	0.41
130	0.4
131	0.32
132	0.29
133	0.23
134	0.21
135	0.15
136	0.11
137	0.12
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.09
142	0.09
143	0.08
144	0.09
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.05
149	0.05
150	0.04
151	0.03
152	0.03
153	0.04
154	0.04
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.08
159	0.11
160	0.14
161	0.16
162	0.18
163	0.21
164	0.24
165	0.28
166	0.3
167	0.28
168	0.29
169	0.32
170	0.39
171	0.38
172	0.38
173	0.34
174	0.32
175	0.31
176	0.27
177	0.2
178	0.12
179	0.1
180	0.07
181	0.07
182	0.05
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.06
192	0.08
193	0.1
194	0.13
195	0.17
196	0.19
197	0.21
198	0.3
199	0.34
200	0.34
201	0.34
202	0.31
203	0.3
204	0.29
205	0.26
206	0.2
207	0.18
208	0.18
209	0.16
210	0.15
211	0.14
212	0.13
213	0.13
214	0.11
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.11
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.13
226	0.11
227	0.11
228	0.12
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.1
234	0.09
235	0.09
236	0.08
237	0.08
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.06
251	0.06
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.05
262	0.09
263	0.11
264	0.11
265	0.11
266	0.12
267	0.13
268	0.14
269	0.13
270	0.12
271	0.2
272	0.25
273	0.26
274	0.32
275	0.33
276	0.33
277	0.37
278	0.42
279	0.36
280	0.34
281	0.38
282	0.35
283	0.37
284	0.39
285	0.36
286	0.31
287	0.3
288	0.29
289	0.24
290	0.21
291	0.17
292	0.15
293	0.15
294	0.13
295	0.11
296	0.11
297	0.1
298	0.12
299	0.12
300	0.12
301	0.12
302	0.13
303	0.14
304	0.12
305	0.13
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.14
310	0.15
311	0.17
312	0.19
313	0.17
314	0.17
315	0.17
316	0.17
317	0.19
318	0.18
319	0.15
320	0.13
321	0.13
322	0.12
323	0.13
324	0.12
325	0.08
326	0.06
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.05
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.05
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.07
353	0.08
354	0.1
355	0.11
356	0.18
357	0.19
358	0.21
359	0.23
360	0.26
361	0.26
362	0.3
363	0.38
364	0.38
365	0.47
366	0.47
367	0.52
368	0.54
369	0.55
370	0.61
371	0.53
372	0.48
373	0.45
374	0.46
375	0.4
376	0.35
377	0.33
378	0.22
379	0.21
380	0.17
381	0.1
382	0.06
383	0.07
384	0.07
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.08
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.11
406	0.1
407	0.09
408	0.1
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.11
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.09
420	0.07
421	0.06
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.09
426	0.09
427	0.07
428	0.09
429	0.09
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.09
434	0.08
435	0.08
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.06
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.09
463	0.1
464	0.1
465	0.16
466	0.22
467	0.26
468	0.29
469	0.34
470	0.37
471	0.39
472	0.45
473	0.41
474	0.41
475	0.44
476	0.47
477	0.44
478	0.43
479	0.41
480	0.37
481	0.37
482	0.31
483	0.25
484	0.25
485	0.27
486	0.25
487	0.24
488	0.26
489	0.24
490	0.24
491	0.25
492	0.21
493	0.19
494	0.19
495	0.19
496	0.18
497	0.18
498	0.25
499	0.27
500	0.36
501	0.39
502	0.44
503	0.43
504	0.43
505	0.42
506	0.35
507	0.41
508	0.33
509	0.32
510	0.29
511	0.28
512	0.27
513	0.28
514	0.27
515	0.17
516	0.14
517	0.12
518	0.1
519	0.1
520	0.11
521	0.13
522	0.14
523	0.18
524	0.24
525	0.29
526	0.28
527	0.33
528	0.34
529	0.36
530	0.38
531	0.34
532	0.28
533	0.26
534	0.26
535	0.21
536	0.2
537	0.17
538	0.14
539	0.15
540	0.17
541	0.16
542	0.19
543	0.22
544	0.25
545	0.27
546	0.29
547	0.28
548	0.29
549	0.26
550	0.27
551	0.25
552	0.23
553	0.2
554	0.19
555	0.18
556	0.17
557	0.17
558	0.14
559	0.14
560	0.12
561	0.12
562	0.12
563	0.19
564	0.22
565	0.23
566	0.22
567	0.22
568	0.22
569	0.24
570	0.27
571	0.22
572	0.2
573	0.24
574	0.3
575	0.32
576	0.34
577	0.35
578	0.4
579	0.4
580	0.43
581	0.38
582	0.33
583	0.32
584	0.32
585	0.32
586	0.28
587	0.26
588	0.21
589	0.21
590	0.21
591	0.2
592	0.18
593	0.17
594	0.11
595	0.12
596	0.12
597	0.14
598	0.18
599	0.17
600	0.16
601	0.15
602	0.16
603	0.16
604	0.17
605	0.15
606	0.09
607	0.1
608	0.14
609	0.23
610	0.22
611	0.24
612	0.24
613	0.24
614	0.26
615	0.25
616	0.26
617	0.18
618	0.18
619	0.16
620	0.15
621	0.15
622	0.14
623	0.13
624	0.1
625	0.16
626	0.16
627	0.23
628	0.24
629	0.26
630	0.26
631	0.33
632	0.35
633	0.36
634	0.4
635	0.35
636	0.33
637	0.32
638	0.31
639	0.26
640	0.21
641	0.14
642	0.09
643	0.08
644	0.13
645	0.12
646	0.12
647	0.13
648	0.14
649	0.15
650	0.16
651	0.16
652	0.12
653	0.14
654	0.14
655	0.13
656	0.15
657	0.13
658	0.13
659	0.18
660	0.18
661	0.17
662	0.2
663	0.21
664	0.23
665	0.28
666	0.34
667	0.32
668	0.41
669	0.43
670	0.44
671	0.49
672	0.49
673	0.45
674	0.41
675	0.39
676	0.32
677	0.32
678	0.31
679	0.26
680	0.23
681	0.23
682	0.19
683	0.19
684	0.17
685	0.13
686	0.1
687	0.07
688	0.06
689	0.05
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.04
694	0.04
695	0.04
696	0.04
697	0.04
698	0.04
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.06
703	0.06
704	0.07
705	0.06
706	0.08
707	0.07
708	0.07
709	0.06
710	0.06
711	0.08
712	0.08
713	0.09
714	0.08
715	0.08
716	0.08
717	0.08
718	0.07
719	0.06
720	0.07
721	0.07
722	0.07
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.08
729	0.1
730	0.12
731	0.18
732	0.19
733	0.24
734	0.25
735	0.25
736	0.28
737	0.31
738	0.31
739	0.34
740	0.35
741	0.32
742	0.33
743	0.33
744	0.29
745	0.26
746	0.23
747	0.17
748	0.14
749	0.13
750	0.1
751	0.11
752	0.09
753	0.08
754	0.09
755	0.11
756	0.11
757	0.12
758	0.12
759	0.12
760	0.12
761	0.12
762	0.11
763	0.09
764	0.09
765	0.08
766	0.07
767	0.06
768	0.06
769	0.05
770	0.04
771	0.04
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.05
776	0.04
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.07
781	0.08
782	0.08
783	0.09
784	0.09
785	0.09
786	0.09
787	0.12
788	0.13
789	0.15
790	0.17
791	0.19
792	0.21
793	0.24
794	0.25
795	0.24
796	0.28
797	0.32
798	0.33
799	0.37
800	0.36
801	0.38
802	0.38
803	0.36
804	0.32
805	0.25
806	0.22
807	0.15
808	0.13
809	0.09
810	0.07
811	0.06
812	0.05
813	0.06
814	0.06
815	0.07
816	0.09
817	0.11
818	0.13
819	0.14
820	0.14
821	0.15
822	0.16
823	0.18
824	0.17
825	0.2
826	0.2
827	0.2
828	0.21
829	0.2
830	0.19
831	0.17
832	0.17
833	0.15
834	0.15
835	0.15
836	0.16
837	0.16
838	0.16
839	0.17
840	0.17
841	0.14
842	0.12
843	0.12
844	0.1
845	0.11
846	0.14
847	0.13
848	0.12
849	0.16
850	0.17
851	0.16
852	0.19
853	0.2
854	0.2
855	0.28
856	0.28
857	0.25
858	0.24
859	0.24
860	0.2
861	0.19
862	0.18
863	0.11
864	0.1
865	0.09
866	0.08
867	0.08
868	0.08
869	0.11
870	0.09
871	0.08
872	0.08
873	0.09
874	0.09
875	0.1
876	0.09
877	0.08
878	0.08
879	0.08
880	0.07
881	0.08
882	0.07
883	0.07
884	0.07
885	0.07
886	0.07
887	0.1
888	0.11
889	0.11
890	0.13
891	0.23
892	0.3
893	0.34
894	0.41
895	0.41
896	0.48
897	0.54
898	0.57
899	0.53
900	0.54
901	0.54
902	0.53
903	0.52
904	0.46
905	0.44
906	0.42
907	0.36
908	0.29
909	0.27
910	0.22
911	0.19
912	0.18
913	0.16
914	0.13
915	0.12
916	0.09
917	0.06
918	0.06
919	0.06
920	0.06
921	0.06
922	0.06
923	0.07
924	0.07
925	0.07
926	0.08
927	0.09
928	0.1
929	0.1
930	0.1
931	0.1
932	0.13
933	0.14
934	0.19
935	0.25
936	0.25
937	0.3
938	0.32
939	0.33
940	0.38
941	0.43
942	0.37
943	0.35
944	0.32
945	0.31
946	0.29
947	0.29
948	0.22
949	0.19
950	0.24
951	0.23
952	0.27
953	0.33
954	0.37
955	0.4
956	0.43
957	0.42
958	0.37
959	0.35
960	0.34
961	0.26
962	0.23
963	0.23
964	0.22
965	0.22
966	0.21
967	0.21
968	0.19
969	0.19
970	0.19
971	0.2
972	0.22
973	0.24
974	0.25
975	0.27
976	0.26
977	0.27
978	0.25
979	0.2
980	0.15
981	0.13
982	0.12
983	0.1
984	0.11
985	0.1
986	0.12
987	0.12
988	0.13
989	0.14
990	0.19
991	0.23
992	0.25
993	0.29
994	0.29
995	0.32
996	0.34
997	0.38
998	0.37
999	0.39
1000	0.37
1001	0.38
1002	0.43
1003	0.38
1004	0.38
1005	0.34
1006	0.34
1007	0.28
1008	0.27
1009	0.23
1010	0.19
1011	0.2
1012	0.21
1013	0.22
1014	0.22
1015	0.22
1016	0.23
1017	0.24
1018	0.19
1019	0.2
1020	0.17
1021	0.2
1022	0.16
1023	0.17
1024	0.18
1025	0.19
1026	0.2
1027	0.25
1028	0.27
1029	0.29
1030	0.33
1031	0.34
1032	0.38
1033	0.43
1034	0.47
1035	0.48
1036	0.49
1037	0.45
1038	0.48
1039	0.47
1040	0.44
1041	0.44
1042	0.49
1043	0.51
1044	0.55
1045	0.55
1046	0.49
1047	0.54
1048	0.54
1049	0.51
1050	0.46
1051	0.36
1052	0.36
1053	0.38
1054	0.39
1055	0.39
1056	0.39
1057	0.38
1058	0.38
1059	0.39
1060	0.36
1061	0.37
1062	0.36
1063	0.37
1064	0.39
1065	0.35
1066	0.31
1067	0.34
1068	0.32
1069	0.27
1070	0.25
1071	0.24
1072	0.27
1073	0.28
1074	0.31
1075	0.27
1076	0.28
1077	0.28
1078	0.3
1079	0.3
1080	0.26
1081	0.3
1082	0.27
1083	0.31
1084	0.29
1085	0.28
1086	0.26
1087	0.22
1088	0.21
1089	0.21
1090	0.25
1091	0.21
1092	0.23
1093	0.24
1094	0.25
1095	0.25
1096	0.26
1097	0.24
1098	0.2
1099	0.21
1100	0.2
1101	0.2
1102	0.18
1103	0.17
1104	0.16
1105	0.13
1106	0.13
1107	0.15
1108	0.16
1109	0.16
1110	0.18
1111	0.23
1112	0.26
1113	0.32
1114	0.33
1115	0.36
1116	0.35
1117	0.35
1118	0.36
1119	0.33
1120	0.31
1121	0.25
1122	0.24
1123	0.17
1124	0.17
1125	0.16
1126	0.13
1127	0.11
1128	0.09
1129	0.07
1130	0.07
1131	0.07
1132	0.06
1133	0.05
1134	0.04
1135	0.04
1136	0.05
1137	0.04
1138	0.04
1139	0.05
1140	0.06
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.06
1144	0.06
1145	0.06
1146	0.06
1147	0.06
1148	0.04
1149	0.04
1150	0.05
1151	0.05
1152	0.05
1153	0.06
1154	0.05
1155	0.09
1156	0.1
1157	0.14
1158	0.17
1159	0.19
1160	0.2
1161	0.23
1162	0.26
1163	0.27
1164	0.3
1165	0.28
1166	0.28
1167	0.35
1168	0.36
1169	0.35
1170	0.35
1171	0.39
1172	0.39
1173	0.4
1174	0.41
1175	0.38
1176	0.39
1177	0.38
1178	0.39
1179	0.35
1180	0.33
1181	0.33
1182	0.33
1183	0.31
1184	0.29
1185	0.3
1186	0.31
1187	0.29
1188	0.27
1189	0.26
1190	0.24
1191	0.21
1192	0.21
1193	0.18
1194	0.17
1195	0.17
1196	0.18
1197	0.16
1198	0.16
1199	0.18
1200	0.17
1201	0.2
1202	0.19
1203	0.18
1204	0.17
1205	0.18
1206	0.17
1207	0.15
1208	0.18
1209	0.14
1210	0.15
1211	0.14
1212	0.17
1213	0.15
1214	0.15
1215	0.15
1216	0.12
1217	0.12
1218	0.1
1219	0.12
1220	0.18
1221	0.21
1222	0.22
1223	0.25
1224	0.26
1225	0.28
1226	0.28
1227	0.28
1228	0.2
1229	0.18
1230	0.17
1231	0.14
1232	0.14
1233	0.12
1234	0.11
1235	0.13
1236	0.11
1237	0.1
1238	0.11
1239	0.12
1240	0.13
1241	0.19
1242	0.2
1243	0.22
1244	0.28
1245	0.34
1246	0.4
1247	0.42
1248	0.42
1249	0.39
1250	0.42
1251	0.46
1252	0.46
1253	0.43
1254	0.37
1255	0.36
1256	0.37
1257	0.39
1258	0.34
1259	0.26
1260	0.24
1261	0.27
1262	0.26
1263	0.26
1264	0.27
1265	0.3
1266	0.33
1267	0.36
1268	0.35
1269	0.38
1270	0.45
1271	0.51
1272	0.48
1273	0.45
1274	0.42
1275	0.4
1276	0.38
1277	0.3
1278	0.23

Q0CPF0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer