FuNGI

Q0CWP1

Protein Details

Accession

Q0CWP1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
258-284	QSDNPNARPRIPRNRPRKCPCQSEPND	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MTDRISTILSTSSDWLLWFRSIKTLALNKGVWGYINPDQPEEPILPERPAYPFPSRIQGEATSILDLSPANRELYRDLLREYELQMREFDHVNKGLTLIHMIIQNSISQQNKRAIINTNSAYQSLRILRDKLAPTNEARKRDVIGRYHQLRAQGSSVRSPNLESYISQWENLYSEAQELDISEVNPPIRALYDFLEAIHTVQPYFSTLWHDKLIEKSERNEPIPTFYEVTKRFRDHIKLSPKRNSHMANIANATFMGQSDNPNARPRIPRNRPRKCPCQSEPNDGFHDFSECLYTNQSKRPIGWSPDPEAQKRFERANQNPGFKRAYENALQKFKTSQTTNLTVTMATVALATAQTTDSRSDWAFDTASNTHVCNDLSAFKDYTPRESKVLIGDTHAEILGFGTVLMKPSNCYGKQTTFELKDCAYVPKFHINILSAMKAKKAGIFYNSRVPCLEGLDGSKVCQIYETGGISLVRWGEYSLSAHFTMGNPYKSESFGQNDLPDRFSTLELEDSRKQTNQTSQTYQIQRSDQPIISKGSIELWHQRLGHPGIKALKHLEQATSGAELTNQSEELGPCETCLVSKSKRQISRRPIGRGDQPFETIHWDLIHMKRGMRNMNYISHIYDPMTHFHMAQTLQTKEQVSRSLNSMILLVKNQYRVSPKRVHSDNDLNLSEFIDQSEGLIFNTSPPDQPEQNPFSERSGGLIIMKSRLILVDSGIPMFLWPEVVSAATHILNRTPIRALDWKTPYEALYTALPEKPGYMTSKPDISNLKRFGCRAYTRIINIPRLSELDPDLGLEVKALTDSEINDLINSIEAESDESENAEMSLDLDDSRTLEDSADVLEPLENQEKEENEEYLEDSIGQDDIVLGDLPDSPPQSPVPPAPDVVIDNSQFKFDDYDDIMKPLGLKRQRSPSPDPEPSKIPRNYAILQAFSTDLGHKKLHKNDLPPPPANWREAVNSPFRDDWIRAAEVEYQQLTNMDTWTPVSIDSIGPDQRALPLKWVFTYKFDQSGFLSKFKARICVRGDLQPISDLDTRAITLGSRTLRVVLALVAAFDLEAVQLDAVNAFLNSQLDETVYVSPPPGLGPKNRVFKLKKALYGLRRAPFLWQREIGETLKRLGLDPIPEDPCVYVNEFMILVIYGKGRKSETSPLFDLSDQGSRRNDAISEYENSSKKVEKEALDLAEGLYRKDRSPLSPDQSEASKNTAPGRKSSEGQTVDLLIKQDSAYKSKLKHVDIHRHWLRQEVQNGSIQIQWVPTNQMIADGLTKRLTYQKHQEFMKHLNMEDISELSP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.17
3	0.17
4	0.19
5	0.2
6	0.19
7	0.24
8	0.26
9	0.27
10	0.33
11	0.38
12	0.39
13	0.42
14	0.42
15	0.37
16	0.37
17	0.36
18	0.29
19	0.23
20	0.24
21	0.24
22	0.3
23	0.3
24	0.3
25	0.3
26	0.3
27	0.33
28	0.28
29	0.26
30	0.25
31	0.26
32	0.25
33	0.26
34	0.27
35	0.28
36	0.31
37	0.32
38	0.33
39	0.36
40	0.38
41	0.46
42	0.45
43	0.42
44	0.43
45	0.39
46	0.36
47	0.34
48	0.32
49	0.24
50	0.22
51	0.2
52	0.17
53	0.15
54	0.12
55	0.13
56	0.14
57	0.15
58	0.16
59	0.18
60	0.2
61	0.27
62	0.32
63	0.29
64	0.29
65	0.29
66	0.31
67	0.32
68	0.33
69	0.34
70	0.31
71	0.3
72	0.29
73	0.28
74	0.28
75	0.29
76	0.28
77	0.26
78	0.27
79	0.27
80	0.26
81	0.25
82	0.24
83	0.21
84	0.21
85	0.15
86	0.15
87	0.16
88	0.16
89	0.17
90	0.16
91	0.17
92	0.17
93	0.22
94	0.24
95	0.24
96	0.29
97	0.35
98	0.39
99	0.39
100	0.41
101	0.43
102	0.43
103	0.49
104	0.45
105	0.44
106	0.41
107	0.4
108	0.37
109	0.3
110	0.31
111	0.27
112	0.31
113	0.3
114	0.31
115	0.33
116	0.4
117	0.44
118	0.44
119	0.44
120	0.42
121	0.43
122	0.51
123	0.55
124	0.52
125	0.51
126	0.47
127	0.45
128	0.49
129	0.51
130	0.47
131	0.49
132	0.54
133	0.55
134	0.57
135	0.56
136	0.55
137	0.5
138	0.46
139	0.42
140	0.38
141	0.36
142	0.39
143	0.4
144	0.36
145	0.34
146	0.33
147	0.31
148	0.29
149	0.28
150	0.21
151	0.22
152	0.29
153	0.29
154	0.27
155	0.25
156	0.23
157	0.22
158	0.23
159	0.2
160	0.11
161	0.11
162	0.11
163	0.11
164	0.1
165	0.09
166	0.11
167	0.11
168	0.11
169	0.11
170	0.14
171	0.14
172	0.14
173	0.14
174	0.12
175	0.12
176	0.12
177	0.13
178	0.13
179	0.16
180	0.15
181	0.16
182	0.17
183	0.16
184	0.16
185	0.17
186	0.15
187	0.12
188	0.12
189	0.12
190	0.12
191	0.13
192	0.12
193	0.17
194	0.2
195	0.23
196	0.25
197	0.26
198	0.26
199	0.31
200	0.37
201	0.37
202	0.37
203	0.38
204	0.44
205	0.49
206	0.49
207	0.48
208	0.42
209	0.4
210	0.4
211	0.39
212	0.33
213	0.29
214	0.35
215	0.35
216	0.4
217	0.41
218	0.41
219	0.41
220	0.46
221	0.52
222	0.49
223	0.54
224	0.59
225	0.61
226	0.67
227	0.73
228	0.7
229	0.67
230	0.69
231	0.63
232	0.57
233	0.57
234	0.52
235	0.47
236	0.45
237	0.41
238	0.33
239	0.29
240	0.25
241	0.16
242	0.13
243	0.11
244	0.09
245	0.11
246	0.17
247	0.22
248	0.24
249	0.3
250	0.31
251	0.34
252	0.42
253	0.49
254	0.54
255	0.61
256	0.68
257	0.73
258	0.83
259	0.88
260	0.88
261	0.89
262	0.86
263	0.85
264	0.82
265	0.82
266	0.77
267	0.76
268	0.73
269	0.68
270	0.64
271	0.55
272	0.5
273	0.39
274	0.36
275	0.25
276	0.2
277	0.19
278	0.15
279	0.15
280	0.18
281	0.23
282	0.23
283	0.3
284	0.36
285	0.34
286	0.34
287	0.39
288	0.42
289	0.44
290	0.48
291	0.46
292	0.46
293	0.51
294	0.54
295	0.52
296	0.48
297	0.46
298	0.43
299	0.42
300	0.41
301	0.41
302	0.47
303	0.49
304	0.57
305	0.59
306	0.63
307	0.62
308	0.62
309	0.57
310	0.47
311	0.47
312	0.39
313	0.37
314	0.35
315	0.4
316	0.43
317	0.48
318	0.48
319	0.44
320	0.43
321	0.41
322	0.42
323	0.36
324	0.35
325	0.34
326	0.39
327	0.39
328	0.38
329	0.35
330	0.28
331	0.25
332	0.2
333	0.13
334	0.08
335	0.07
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.07
344	0.09
345	0.09
346	0.11
347	0.12
348	0.13
349	0.13
350	0.15
351	0.14
352	0.13
353	0.17
354	0.15
355	0.17
356	0.16
357	0.15
358	0.14
359	0.15
360	0.15
361	0.11
362	0.12
363	0.13
364	0.15
365	0.17
366	0.17
367	0.16
368	0.23
369	0.23
370	0.3
371	0.32
372	0.31
373	0.31
374	0.31
375	0.32
376	0.29
377	0.32
378	0.24
379	0.2
380	0.2
381	0.19
382	0.19
383	0.17
384	0.12
385	0.09
386	0.09
387	0.07
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.06
393	0.07
394	0.06
395	0.07
396	0.11
397	0.18
398	0.17
399	0.22
400	0.25
401	0.28
402	0.31
403	0.35
404	0.39
405	0.36
406	0.37
407	0.35
408	0.31
409	0.29
410	0.27
411	0.28
412	0.23
413	0.21
414	0.22
415	0.28
416	0.28
417	0.26
418	0.27
419	0.23
420	0.25
421	0.25
422	0.25
423	0.2
424	0.2
425	0.2
426	0.19
427	0.18
428	0.18
429	0.18
430	0.18
431	0.2
432	0.24
433	0.26
434	0.34
435	0.35
436	0.33
437	0.3
438	0.29
439	0.25
440	0.22
441	0.2
442	0.11
443	0.12
444	0.15
445	0.14
446	0.14
447	0.15
448	0.13
449	0.12
450	0.12
451	0.11
452	0.09
453	0.11
454	0.11
455	0.09
456	0.1
457	0.11
458	0.1
459	0.11
460	0.1
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.06
465	0.07
466	0.09
467	0.08
468	0.11
469	0.11
470	0.11
471	0.11
472	0.11
473	0.16
474	0.19
475	0.2
476	0.17
477	0.19
478	0.2
479	0.21
480	0.22
481	0.19
482	0.18
483	0.19
484	0.2
485	0.21
486	0.25
487	0.24
488	0.24
489	0.21
490	0.19
491	0.18
492	0.17
493	0.15
494	0.12
495	0.15
496	0.15
497	0.2
498	0.21
499	0.23
500	0.24
501	0.24
502	0.25
503	0.24
504	0.3
505	0.32
506	0.34
507	0.35
508	0.38
509	0.44
510	0.47
511	0.46
512	0.42
513	0.37
514	0.35
515	0.34
516	0.34
517	0.28
518	0.26
519	0.26
520	0.25
521	0.23
522	0.21
523	0.17
524	0.16
525	0.16
526	0.16
527	0.19
528	0.19
529	0.22
530	0.23
531	0.23
532	0.25
533	0.27
534	0.28
535	0.23
536	0.24
537	0.24
538	0.25
539	0.26
540	0.24
541	0.23
542	0.23
543	0.23
544	0.2
545	0.17
546	0.17
547	0.16
548	0.14
549	0.11
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.06
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.08
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.07
566	0.08
567	0.11
568	0.12
569	0.17
570	0.24
571	0.31
572	0.39
573	0.45
574	0.53
575	0.58
576	0.65
577	0.68
578	0.67
579	0.62
580	0.59
581	0.61
582	0.56
583	0.5
584	0.42
585	0.37
586	0.31
587	0.28
588	0.29
589	0.21
590	0.17
591	0.14
592	0.13
593	0.14
594	0.15
595	0.2
596	0.17
597	0.18
598	0.2
599	0.23
600	0.27
601	0.25
602	0.28
603	0.25
604	0.26
605	0.28
606	0.26
607	0.23
608	0.2
609	0.19
610	0.15
611	0.16
612	0.14
613	0.13
614	0.15
615	0.14
616	0.13
617	0.13
618	0.15
619	0.12
620	0.13
621	0.16
622	0.14
623	0.14
624	0.16
625	0.17
626	0.16
627	0.17
628	0.2
629	0.17
630	0.17
631	0.19
632	0.18
633	0.18
634	0.17
635	0.16
636	0.13
637	0.11
638	0.11
639	0.1
640	0.1
641	0.12
642	0.12
643	0.13
644	0.19
645	0.22
646	0.28
647	0.35
648	0.36
649	0.42
650	0.45
651	0.44
652	0.44
653	0.49
654	0.45
655	0.42
656	0.39
657	0.32
658	0.29
659	0.27
660	0.21
661	0.14
662	0.11
663	0.06
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.05
670	0.05
671	0.05
672	0.07
673	0.08
674	0.08
675	0.09
676	0.12
677	0.13
678	0.16
679	0.22
680	0.23
681	0.24
682	0.26
683	0.25
684	0.23
685	0.24
686	0.22
687	0.17
688	0.14
689	0.13
690	0.12
691	0.12
692	0.1
693	0.1
694	0.1
695	0.08
696	0.07
697	0.07
698	0.07
699	0.06
700	0.06
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.08
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.06
709	0.04
710	0.03
711	0.04
712	0.04
713	0.05
714	0.05
715	0.05
716	0.06
717	0.07
718	0.07
719	0.07
720	0.08
721	0.11
722	0.12
723	0.13
724	0.12
725	0.12
726	0.15
727	0.21
728	0.23
729	0.27
730	0.3
731	0.3
732	0.3
733	0.3
734	0.27
735	0.23
736	0.2
737	0.14
738	0.11
739	0.12
740	0.12
741	0.12
742	0.13
743	0.11
744	0.11
745	0.1
746	0.11
747	0.14
748	0.14
749	0.16
750	0.17
751	0.23
752	0.23
753	0.25
754	0.3
755	0.31
756	0.37
757	0.39
758	0.41
759	0.38
760	0.39
761	0.38
762	0.38
763	0.36
764	0.3
765	0.29
766	0.29
767	0.29
768	0.35
769	0.37
770	0.35
771	0.33
772	0.32
773	0.28
774	0.27
775	0.26
776	0.2
777	0.18
778	0.14
779	0.13
780	0.12
781	0.11
782	0.09
783	0.08
784	0.07
785	0.05
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.04
790	0.05
791	0.05
792	0.07
793	0.08
794	0.08
795	0.08
796	0.08
797	0.08
798	0.07
799	0.07
800	0.05
801	0.04
802	0.04
803	0.05
804	0.06
805	0.07
806	0.06
807	0.06
808	0.06
809	0.06
810	0.06
811	0.05
812	0.04
813	0.04
814	0.05
815	0.05
816	0.05
817	0.05
818	0.05
819	0.05
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.06
826	0.07
827	0.07
828	0.07
829	0.06
830	0.06
831	0.06
832	0.09
833	0.13
834	0.12
835	0.13
836	0.15
837	0.15
838	0.19
839	0.21
840	0.18
841	0.14
842	0.15
843	0.14
844	0.13
845	0.12
846	0.08
847	0.07
848	0.07
849	0.06
850	0.05
851	0.04
852	0.04
853	0.04
854	0.04
855	0.04
856	0.03
857	0.04
858	0.05
859	0.06
860	0.07
861	0.08
862	0.08
863	0.1
864	0.11
865	0.12
866	0.14
867	0.15
868	0.18
869	0.19
870	0.19
871	0.18
872	0.18
873	0.18
874	0.18
875	0.19
876	0.16
877	0.17
878	0.17
879	0.17
880	0.16
881	0.16
882	0.15
883	0.12
884	0.15
885	0.15
886	0.19
887	0.19
888	0.2
889	0.19
890	0.18
891	0.18
892	0.16
893	0.22
894	0.23
895	0.27
896	0.32
897	0.42
898	0.47
899	0.53
900	0.58
901	0.6
902	0.64
903	0.68
904	0.67
905	0.61
906	0.61
907	0.58
908	0.6
909	0.53
910	0.47
911	0.42
912	0.43
913	0.41
914	0.42
915	0.41
916	0.32
917	0.3
918	0.28
919	0.24
920	0.19
921	0.18
922	0.13
923	0.13
924	0.15
925	0.17
926	0.21
927	0.28
928	0.35
929	0.44
930	0.47
931	0.51
932	0.57
933	0.65
934	0.67
935	0.61
936	0.57
937	0.56
938	0.55
939	0.5
940	0.42
941	0.34
942	0.31
943	0.33
944	0.34
945	0.32
946	0.31
947	0.32
948	0.31
949	0.31
950	0.29
951	0.26
952	0.26
953	0.23
954	0.22
955	0.19
956	0.2
957	0.23
958	0.21
959	0.23
960	0.2
961	0.16
962	0.15
963	0.15
964	0.15
965	0.11
966	0.11
967	0.09
968	0.08
969	0.09
970	0.09
971	0.09
972	0.08
973	0.09
974	0.09
975	0.09
976	0.1
977	0.13
978	0.14
979	0.14
980	0.14
981	0.13
982	0.16
983	0.22
984	0.21
985	0.23
986	0.24
987	0.25
988	0.27
989	0.31
990	0.28
991	0.27
992	0.32
993	0.28
994	0.32
995	0.31
996	0.31
997	0.29
998	0.36
999	0.35
1000	0.32
1001	0.32
1002	0.28
1003	0.33
1004	0.32
1005	0.39
1006	0.32
1007	0.37
1008	0.39
1009	0.44
1010	0.45
1011	0.46
1012	0.49
1013	0.41
1014	0.4
1015	0.35
1016	0.3
1017	0.28
1018	0.28
1019	0.22
1020	0.19
1021	0.17
1022	0.17
1023	0.15
1024	0.15
1025	0.09
1026	0.08
1027	0.13
1028	0.13
1029	0.14
1030	0.14
1031	0.15
1032	0.15
1033	0.15
1034	0.15
1035	0.1
1036	0.1
1037	0.09
1038	0.08
1039	0.07
1040	0.06
1041	0.06
1042	0.05
1043	0.05
1044	0.03
1045	0.03
1046	0.03
1047	0.03
1048	0.04
1049	0.04
1050	0.04
1051	0.04
1052	0.05
1053	0.04
1054	0.04
1055	0.05
1056	0.06
1057	0.06
1058	0.07
1059	0.07
1060	0.07
1061	0.08
1062	0.09
1063	0.11
1064	0.11
1065	0.11
1066	0.11
1067	0.11
1068	0.11
1069	0.12
1070	0.15
1071	0.16
1072	0.2
1073	0.28
1074	0.36
1075	0.45
1076	0.47
1077	0.55
1078	0.54
1079	0.59
1080	0.65
1081	0.64
1082	0.61
1083	0.6
1084	0.66
1085	0.63
1086	0.69
1087	0.69
1088	0.62
1089	0.57
1090	0.52
1091	0.52
1092	0.51
1093	0.49
1094	0.46
1095	0.41
1096	0.4
1097	0.41
1098	0.44
1099	0.39
1100	0.37
1101	0.33
1102	0.29
1103	0.28
1104	0.26
1105	0.23
1106	0.23
1107	0.23
1108	0.21
1109	0.22
1110	0.26
1111	0.26
1112	0.26
1113	0.26
1114	0.23
1115	0.22
1116	0.21
1117	0.21
1118	0.15
1119	0.13
1120	0.14
1121	0.14
1122	0.13
1123	0.12
1124	0.09
1125	0.08
1126	0.08
1127	0.1
1128	0.11
1129	0.12
1130	0.15
1131	0.16
1132	0.18
1133	0.22
1134	0.31
1135	0.36
1136	0.4
1137	0.42
1138	0.42
1139	0.43
1140	0.41
1141	0.38
1142	0.3
1143	0.31
1144	0.25
1145	0.28
1146	0.27
1147	0.27
1148	0.28
1149	0.27
1150	0.25
1151	0.21
1152	0.25
1153	0.24
1154	0.25
1155	0.27
1156	0.33
1157	0.33
1158	0.35
1159	0.35
1160	0.35
1161	0.33
1162	0.36
1163	0.38
1164	0.34
1165	0.37
1166	0.41
1167	0.4
1168	0.36
1169	0.34
1170	0.28
1171	0.26
1172	0.24
1173	0.2
1174	0.2
1175	0.2
1176	0.19
1177	0.25
1178	0.27
1179	0.28
1180	0.35
1181	0.44
1182	0.46
1183	0.48
1184	0.48
1185	0.46
1186	0.47
1187	0.45
1188	0.4
1189	0.37
1190	0.31
1191	0.3
1192	0.37
1193	0.4
1194	0.38
1195	0.4
1196	0.47
1197	0.45
1198	0.46
1199	0.49
1200	0.5
1201	0.47
1202	0.47
1203	0.43
1204	0.37
1205	0.34
1206	0.33
1207	0.29
1208	0.2
1209	0.18
1210	0.16
1211	0.21
1212	0.21
1213	0.24
1214	0.27
1215	0.31
1216	0.34
1217	0.42
1218	0.5
1219	0.48
1220	0.54
1221	0.59
1222	0.66
1223	0.66
1224	0.74
1225	0.73
1226	0.71
1227	0.67
1228	0.66
1229	0.63
1230	0.59
1231	0.6
1232	0.55
1233	0.5
1234	0.49
1235	0.5
1236	0.43
1237	0.39
1238	0.32
1239	0.25
1240	0.22
1241	0.21
1242	0.18
1243	0.21
1244	0.2
1245	0.2
1246	0.19
1247	0.2
1248	0.18
1249	0.17
1250	0.21
1251	0.18
1252	0.2
1253	0.2
1254	0.2
1255	0.21
1256	0.27
1257	0.31
1258	0.33
1259	0.43
1260	0.5
1261	0.55
1262	0.59
1263	0.64
1264	0.64
1265	0.66
1266	0.67
1267	0.59
1268	0.5
1269	0.48
1270	0.45
1271	0.4
1272	0.35

Q0CWP1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer