FuNGI

Q0CAA9

Protein Details

Accession

Q0CAA9

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
330-349	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
441-463	TSAQVKRKGAKAKRGKNGNEVIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
334-339	RRKKRK
446-456	KRKGAKAKRGK

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRSQHDPAIHDPDADDRVLHQVSGPAAPAPSSAASVTSSRSAKRAENLSDLASQFGSDRVRKNEGEAANYGIYYDDTEYDYMQHLRELGTGGGNSYFVEAKAKGKERKVKLEDALRGVTLNDSASEFGGAGGSIYGSEMRSTTTSYSRQPTYQDQQNVPDAIAGFQPNMDPRLREVLEALEDEEFVDEDAEDDVFGKLTAQAEEMDPGDWEDTLFDEEDEDEGWESDATEKAPEQPSTVQVEKKEVAPGELPDHDEPAPDMHPEDQGWMREFAKFKKESKGKAAAAPAAPPSIVPSEQRSTLASTVFTAGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFDRVEALYALDEEDEYDDSMSMVSGMTGMTGMTDMSTASSQAPSLIDANGQAVAPRHNFNNIMDDFLSSWDDNTSAQVKRKGAKAKRGKNGNEVIGMRMLDEVRQGLGPAKVSGRVPGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.62
4	0.63
5	0.57
6	0.5
7	0.5
8	0.49
9	0.48
10	0.53
11	0.46
12	0.39
13	0.43
14	0.48
15	0.42
16	0.39
17	0.36
18	0.32
19	0.31
20	0.27
21	0.22
22	0.14
23	0.2
24	0.2
25	0.19
26	0.15
27	0.16
28	0.17
29	0.18
30	0.18
31	0.13
32	0.13
33	0.13
34	0.13
35	0.12
36	0.11
37	0.11
38	0.11
39	0.11
40	0.12
41	0.13
42	0.15
43	0.19
44	0.21
45	0.21
46	0.25
47	0.27
48	0.29
49	0.35
50	0.4
51	0.38
52	0.41
53	0.42
54	0.41
55	0.42
56	0.38
57	0.32
58	0.25
59	0.21
60	0.15
61	0.17
62	0.19
63	0.2
64	0.25
65	0.29
66	0.35
67	0.35
68	0.39
69	0.43
70	0.4
71	0.4
72	0.35
73	0.34
74	0.28
75	0.28
76	0.24
77	0.16
78	0.14
79	0.11
80	0.11
81	0.08
82	0.09
83	0.1
84	0.1
85	0.11
86	0.13
87	0.14
88	0.13
89	0.12
90	0.12
91	0.12
92	0.12
93	0.13
94	0.11
95	0.11
96	0.1
97	0.11
98	0.1
99	0.1
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.07
104	0.1
105	0.11
106	0.14
107	0.21
108	0.3
109	0.34
110	0.42
111	0.52
112	0.55
113	0.65
114	0.66
115	0.65
116	0.63
117	0.65
118	0.62
119	0.56
120	0.51
121	0.4
122	0.35
123	0.29
124	0.23
125	0.16
126	0.11
127	0.08
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.06
134	0.06
135	0.05
136	0.04
137	0.04
138	0.03
139	0.03
140	0.03
141	0.04
142	0.04
143	0.05
144	0.05
145	0.06
146	0.07
147	0.08
148	0.1
149	0.14
150	0.17
151	0.21
152	0.26
153	0.27
154	0.28
155	0.31
156	0.36
157	0.38
158	0.43
159	0.44
160	0.41
161	0.43
162	0.44
163	0.4
164	0.33
165	0.27
166	0.2
167	0.15
168	0.14
169	0.11
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.11
175	0.11
176	0.1
177	0.11
178	0.18
179	0.18
180	0.17
181	0.17
182	0.16
183	0.16
184	0.16
185	0.15
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.07
190	0.06
191	0.04
192	0.04
193	0.03
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.08
211	0.07
212	0.06
213	0.07
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.05
220	0.05
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.06
237	0.1
238	0.12
239	0.12
240	0.13
241	0.14
242	0.17
243	0.21
244	0.23
245	0.21
246	0.19
247	0.23
248	0.22
249	0.22
250	0.22
251	0.17
252	0.16
253	0.15
254	0.15
255	0.14
256	0.15
257	0.17
258	0.14
259	0.16
260	0.15
261	0.14
262	0.13
263	0.12
264	0.12
265	0.09
266	0.1
267	0.08
268	0.09
269	0.09
270	0.11
271	0.11
272	0.13
273	0.14
274	0.15
275	0.15
276	0.17
277	0.2
278	0.2
279	0.26
280	0.29
281	0.3
282	0.38
283	0.43
284	0.44
285	0.49
286	0.55
287	0.49
288	0.49
289	0.49
290	0.42
291	0.37
292	0.34
293	0.28
294	0.19
295	0.17
296	0.13
297	0.12
298	0.11
299	0.11
300	0.11
301	0.15
302	0.17
303	0.18
304	0.19
305	0.18
306	0.19
307	0.19
308	0.19
309	0.14
310	0.13
311	0.13
312	0.12
313	0.11
314	0.09
315	0.08
316	0.11
317	0.13
318	0.18
319	0.25
320	0.36
321	0.43
322	0.47
323	0.56
324	0.63
325	0.71
326	0.75
327	0.78
328	0.78
329	0.8
330	0.81
331	0.72
332	0.64
333	0.54
334	0.43
335	0.35
336	0.25
337	0.18
338	0.14
339	0.13
340	0.12
341	0.12
342	0.14
343	0.13
344	0.14
345	0.19
346	0.2
347	0.22
348	0.23
349	0.23
350	0.24
351	0.31
352	0.3
353	0.27
354	0.24
355	0.23
356	0.22
357	0.21
358	0.21
359	0.13
360	0.14
361	0.11
362	0.1
363	0.1
364	0.09
365	0.09
366	0.07
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.06
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.04
388	0.04
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.09
396	0.1
397	0.1
398	0.11
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.11
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.1
407	0.14
408	0.16
409	0.19
410	0.19
411	0.22
412	0.25
413	0.25
414	0.32
415	0.27
416	0.28
417	0.26
418	0.26
419	0.23
420	0.22
421	0.24
422	0.16
423	0.16
424	0.13
425	0.13
426	0.12
427	0.15
428	0.19
429	0.2
430	0.27
431	0.33
432	0.37
433	0.41
434	0.49
435	0.56
436	0.59
437	0.66
438	0.7
439	0.74
440	0.79
441	0.84
442	0.82
443	0.81
444	0.8
445	0.74
446	0.7
447	0.61
448	0.53
449	0.46
450	0.4
451	0.31
452	0.26
453	0.22
454	0.15
455	0.16
456	0.14
457	0.12
458	0.13
459	0.13
460	0.14
461	0.17
462	0.18
463	0.18
464	0.2
465	0.22
466	0.22
467	0.29

Q0CAA9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer