FuNGI

Q0UD35

Protein Details

Accession

Q0UD35

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
170-195	VKEKGTTDRSKRNTQKSKKTARVYNS	Hydrophilic
326-345	DPPPAVPKSRSKKRRQQAEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
333-340	KSRSKKRR
358-364	KKARKAP

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR029060 PIN-like_dom_sf IPR006086 XPG-I_dom IPR006084 XPG/Rad2 IPR006085 XPG_DNA_repair_N
Gene Ontology	GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006974 P:DNA damage response
KEGG	pno:SNOG_10329 -
Pfam	View protein in Pfam PF00867 XPG_I PF00752 XPG_N
CDD	cd09870 PIN_YEN1

Amino Acid Sequences

MGIPQLFDVIKDHEEVVPIAQLAEDHHRRYGRPLRIAIDEADWRFNNLTQAQVYAIRDTSDMAYQGQEKTMFYRICRFLTLNIQLIFVFDGPSRPWKNGKRGQGKIDYRERDLLKEVLRCFGIAFHEAPGEAEAECARLQILGLVDAVWSQDSDSIMFGCTLWIRDDRVVKEKGTTDRSKRNTQKSKKTARVYNSPKVSADEVLQKNAKLNLDYLRPIDELKLLEVTSSRFNIWGRLYSSVAPEVVNSIRMVKQKAGQTDRGPVFERKLSFSPFGVTTLRREDFEGDRFGYWNGDRTTLFDPEHRVEKCEMPNYWLQKALPPDVLDPPPAVPKSRSKKRRQQAEASSEPAETVGAIIKKARKAPRSNATGRQSSPTKTSAPPYVTPTRQSRPKRPIDRTEDVVEISDSDEELRLPPSRRLQKSLARSDVSRVVDLGSPSSSDEAADIIARRMSQKAAGLQRPDRVDHTRPVSPIGLHDIEDVRDFQFALRMSVRERNAAPSIPGERCLNSSSNPGMPTYNDSIPEQPFRVSRGERQSMSFNVHAEPLSGGNEDLTETLREHATFGAYNSPAARIEFLSTASRKQADTMHSSSHVSQKNSASLEPAIAHNAHLTSPTLDNIRAARLKHFQSSGAVTPTNDDQPGITQPNMTPRRPVPSAFFGLAGTDCIDLTDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.19
3	0.18
4	0.15
5	0.14
6	0.13
7	0.11
8	0.1
9	0.12
10	0.21
11	0.25
12	0.26
13	0.32
14	0.34
15	0.36
16	0.45
17	0.52
18	0.51
19	0.54
20	0.57
21	0.55
22	0.57
23	0.58
24	0.5
25	0.45
26	0.42
27	0.36
28	0.37
29	0.33
30	0.31
31	0.3
32	0.3
33	0.31
34	0.26
35	0.28
36	0.22
37	0.23
38	0.23
39	0.26
40	0.26
41	0.22
42	0.21
43	0.18
44	0.18
45	0.18
46	0.18
47	0.16
48	0.15
49	0.14
50	0.16
51	0.18
52	0.18
53	0.2
54	0.19
55	0.18
56	0.2
57	0.27
58	0.27
59	0.26
60	0.35
61	0.36
62	0.37
63	0.4
64	0.38
65	0.34
66	0.41
67	0.44
68	0.41
69	0.37
70	0.36
71	0.32
72	0.31
73	0.28
74	0.19
75	0.16
76	0.1
77	0.11
78	0.12
79	0.22
80	0.24
81	0.26
82	0.35
83	0.42
84	0.52
85	0.58
86	0.67
87	0.68
88	0.72
89	0.77
90	0.78
91	0.77
92	0.76
93	0.78
94	0.71
95	0.65
96	0.66
97	0.59
98	0.52
99	0.48
100	0.44
101	0.39
102	0.41
103	0.38
104	0.33
105	0.32
106	0.29
107	0.25
108	0.23
109	0.21
110	0.17
111	0.17
112	0.15
113	0.15
114	0.15
115	0.15
116	0.13
117	0.11
118	0.08
119	0.08
120	0.07
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.07
125	0.06
126	0.06
127	0.08
128	0.08
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.08
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.06
139	0.07
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.08
146	0.07
147	0.08
148	0.09
149	0.1
150	0.12
151	0.13
152	0.18
153	0.23
154	0.26
155	0.32
156	0.33
157	0.31
158	0.34
159	0.37
160	0.39
161	0.42
162	0.46
163	0.47
164	0.54
165	0.6
166	0.67
167	0.7
168	0.75
169	0.78
170	0.8
171	0.84
172	0.84
173	0.89
174	0.88
175	0.87
176	0.83
177	0.79
178	0.8
179	0.77
180	0.76
181	0.7
182	0.63
183	0.55
184	0.5
185	0.45
186	0.35
187	0.29
188	0.3
189	0.26
190	0.29
191	0.29
192	0.27
193	0.27
194	0.29
195	0.28
196	0.19
197	0.2
198	0.19
199	0.21
200	0.23
201	0.21
202	0.21
203	0.2
204	0.19
205	0.18
206	0.17
207	0.14
208	0.13
209	0.14
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.12
214	0.12
215	0.13
216	0.12
217	0.13
218	0.13
219	0.17
220	0.18
221	0.2
222	0.19
223	0.2
224	0.22
225	0.21
226	0.22
227	0.19
228	0.18
229	0.13
230	0.12
231	0.12
232	0.11
233	0.1
234	0.09
235	0.1
236	0.14
237	0.16
238	0.18
239	0.18
240	0.22
241	0.25
242	0.32
243	0.35
244	0.36
245	0.35
246	0.42
247	0.41
248	0.39
249	0.38
250	0.33
251	0.31
252	0.3
253	0.29
254	0.25
255	0.26
256	0.26
257	0.24
258	0.23
259	0.23
260	0.19
261	0.2
262	0.18
263	0.17
264	0.16
265	0.21
266	0.21
267	0.19
268	0.2
269	0.21
270	0.22
271	0.24
272	0.24
273	0.19
274	0.19
275	0.19
276	0.18
277	0.17
278	0.14
279	0.17
280	0.15
281	0.16
282	0.15
283	0.18
284	0.2
285	0.21
286	0.21
287	0.17
288	0.21
289	0.21
290	0.27
291	0.24
292	0.23
293	0.23
294	0.27
295	0.28
296	0.29
297	0.27
298	0.24
299	0.29
300	0.3
301	0.29
302	0.26
303	0.22
304	0.21
305	0.24
306	0.22
307	0.2
308	0.17
309	0.18
310	0.19
311	0.2
312	0.17
313	0.15
314	0.14
315	0.16
316	0.15
317	0.15
318	0.14
319	0.23
320	0.32
321	0.41
322	0.5
323	0.56
324	0.66
325	0.73
326	0.81
327	0.78
328	0.78
329	0.77
330	0.75
331	0.69
332	0.62
333	0.54
334	0.43
335	0.37
336	0.27
337	0.18
338	0.1
339	0.07
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.08
344	0.11
345	0.14
346	0.21
347	0.27
348	0.32
349	0.37
350	0.46
351	0.52
352	0.57
353	0.6
354	0.62
355	0.61
356	0.57
357	0.52
358	0.49
359	0.43
360	0.37
361	0.35
362	0.29
363	0.27
364	0.25
365	0.27
366	0.27
367	0.28
368	0.28
369	0.31
370	0.35
371	0.34
372	0.37
373	0.4
374	0.41
375	0.47
376	0.52
377	0.55
378	0.58
379	0.67
380	0.72
381	0.74
382	0.77
383	0.77
384	0.74
385	0.69
386	0.62
387	0.53
388	0.43
389	0.36
390	0.26
391	0.17
392	0.13
393	0.09
394	0.06
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.07
400	0.11
401	0.13
402	0.17
403	0.26
404	0.35
405	0.38
406	0.43
407	0.47
408	0.51
409	0.58
410	0.62
411	0.59
412	0.51
413	0.49
414	0.47
415	0.47
416	0.41
417	0.32
418	0.24
419	0.2
420	0.2
421	0.19
422	0.17
423	0.11
424	0.09
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.07
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.09
438	0.1
439	0.1
440	0.11
441	0.13
442	0.19
443	0.26
444	0.3
445	0.34
446	0.36
447	0.41
448	0.41
449	0.4
450	0.38
451	0.37
452	0.36
453	0.37
454	0.39
455	0.38
456	0.36
457	0.38
458	0.35
459	0.29
460	0.26
461	0.26
462	0.22
463	0.18
464	0.2
465	0.17
466	0.16
467	0.17
468	0.17
469	0.11
470	0.11
471	0.1
472	0.09
473	0.12
474	0.11
475	0.14
476	0.14
477	0.15
478	0.18
479	0.25
480	0.26
481	0.26
482	0.27
483	0.28
484	0.29
485	0.29
486	0.27
487	0.24
488	0.28
489	0.25
490	0.26
491	0.23
492	0.21
493	0.23
494	0.24
495	0.22
496	0.19
497	0.23
498	0.23
499	0.24
500	0.24
501	0.23
502	0.21
503	0.2
504	0.24
505	0.24
506	0.23
507	0.22
508	0.23
509	0.26
510	0.28
511	0.3
512	0.26
513	0.24
514	0.23
515	0.24
516	0.29
517	0.28
518	0.33
519	0.39
520	0.45
521	0.44
522	0.45
523	0.47
524	0.43
525	0.45
526	0.39
527	0.31
528	0.25
529	0.25
530	0.23
531	0.19
532	0.17
533	0.13
534	0.13
535	0.12
536	0.11
537	0.09
538	0.09
539	0.09
540	0.08
541	0.09
542	0.08
543	0.09
544	0.11
545	0.12
546	0.12
547	0.12
548	0.12
549	0.13
550	0.13
551	0.13
552	0.18
553	0.17
554	0.18
555	0.17
556	0.18
557	0.17
558	0.17
559	0.18
560	0.12
561	0.15
562	0.14
563	0.16
564	0.21
565	0.21
566	0.23
567	0.26
568	0.27
569	0.25
570	0.27
571	0.3
572	0.28
573	0.34
574	0.35
575	0.34
576	0.34
577	0.37
578	0.37
579	0.4
580	0.41
581	0.37
582	0.39
583	0.39
584	0.42
585	0.42
586	0.4
587	0.34
588	0.29
589	0.29
590	0.24
591	0.22
592	0.19
593	0.17
594	0.17
595	0.16
596	0.16
597	0.14
598	0.14
599	0.14
600	0.14
601	0.15
602	0.17
603	0.18
604	0.17
605	0.2
606	0.2
607	0.26
608	0.27
609	0.27
610	0.31
611	0.36
612	0.39
613	0.43
614	0.43
615	0.38
616	0.38
617	0.42
618	0.4
619	0.37
620	0.35
621	0.29
622	0.3
623	0.32
624	0.31
625	0.26
626	0.22
627	0.18
628	0.19
629	0.26
630	0.27
631	0.24
632	0.23
633	0.24
634	0.35
635	0.41
636	0.39
637	0.4
638	0.4
639	0.47
640	0.48
641	0.49
642	0.46
643	0.47
644	0.51
645	0.45
646	0.42
647	0.33
648	0.32
649	0.29
650	0.23
651	0.17
652	0.11
653	0.1

Q0UD35

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer