FuNGI

Q0C9Z8

Protein Details

Accession

Q0C9Z8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-36	YKDARNHKTRLVRKILRNGHRQRVQE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, cyto 7.5, mito 5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR000477 RT_dom
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MPWEDLIDRAYKDARNHKTRLVRKILRNGHRQRVQEMTEDDRGLWKLSKWARNRSTGPATTPTLESQGQSMRTPKAKAAAFRETFFPRPPPADLSDIETFLYPEGLPFPPVTVEEVRHAIKRAPADKAPGDDGIPNRVLHWVLPVIDIYLTNLFNACLHAGYNPRHFQVSVTTVLRKPGKSKYTEPKAFRPVALLNTIGKALESVVAQRLSYAVERFRLLPKNHLGGRKGISCEHVLQIVVDRITKAWRKGRSVSLLLLDVSGAYDNVSHRRLLHNLRKRKLGHFVPWIASFLSNRYTRIRMPEHVTELFPTTTGIPQGFPLSLILYLLYNADLISICNSPTQGLTVTEAYGYVDDVALLAEAFSIRSATRALQAVYPHARQWASQHGSVFAPAKYELVHFPRPVGGESQLCENALYLDEEDITVQPSSAARYLGAWLDSRLDFTVHCTKMLHRAEACLEALRGIAGSTWGTSLEDLRRVYQAMVVPTMLYCSSMWYNPWRLTALAAAKQARQRAVMRFTNIQKRAAILISGSFRVVAAEALNIELFLTPIPLLLEQRAEEAGIRIATGPRIGRPRTVVGASPRRRKAFAERTFMEAFAATMGRLGHHSWEPRVSFIRDPWQPRPNTVVEDREQALQSHQEMRSAYLGVETKQTVYAAELRGLAEGAQLARPTARPLSPPFEAGGGPLAKFISYMPWRGSNDSANWRTLRSRFGGIPAHARVPGNEVADQLARQAALRGLDPAQSGADYLLASAAKSATRQRIMDKWLRQWRLLSVANTARPTKRLLPGSGWQSLRLYQNLTKLQSSALVQMRTMRIGLNHYLFKIKQVESDRCSCEEGSQTPKHVLTVPSLVRSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.55
3	0.59
4	0.64
5	0.7
6	0.74
7	0.76
8	0.77
9	0.76
10	0.77
11	0.84
12	0.86
13	0.84
14	0.87
15	0.86
16	0.86
17	0.84
18	0.78
19	0.72
20	0.69
21	0.63
22	0.59
23	0.54
24	0.5
25	0.47
26	0.45
27	0.4
28	0.36
29	0.35
30	0.3
31	0.28
32	0.23
33	0.27
34	0.35
35	0.43
36	0.47
37	0.56
38	0.6
39	0.67
40	0.7
41	0.7
42	0.7
43	0.65
44	0.62
45	0.57
46	0.54
47	0.48
48	0.46
49	0.38
50	0.33
51	0.31
52	0.26
53	0.24
54	0.26
55	0.26
56	0.27
57	0.3
58	0.33
59	0.37
60	0.39
61	0.38
62	0.4
63	0.42
64	0.45
65	0.48
66	0.51
67	0.49
68	0.48
69	0.51
70	0.49
71	0.49
72	0.46
73	0.43
74	0.38
75	0.38
76	0.4
77	0.39
78	0.37
79	0.38
80	0.35
81	0.36
82	0.34
83	0.31
84	0.28
85	0.24
86	0.2
87	0.16
88	0.16
89	0.1
90	0.08
91	0.1
92	0.11
93	0.12
94	0.12
95	0.12
96	0.12
97	0.13
98	0.17
99	0.16
100	0.18
101	0.2
102	0.24
103	0.25
104	0.27
105	0.28
106	0.26
107	0.28
108	0.34
109	0.35
110	0.36
111	0.37
112	0.41
113	0.42
114	0.43
115	0.41
116	0.35
117	0.31
118	0.3
119	0.28
120	0.27
121	0.26
122	0.23
123	0.21
124	0.22
125	0.21
126	0.17
127	0.18
128	0.16
129	0.14
130	0.15
131	0.14
132	0.13
133	0.13
134	0.13
135	0.11
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.11
140	0.11
141	0.1
142	0.12
143	0.1
144	0.07
145	0.08
146	0.1
147	0.16
148	0.2
149	0.28
150	0.3
151	0.3
152	0.32
153	0.31
154	0.3
155	0.3
156	0.29
157	0.27
158	0.27
159	0.29
160	0.29
161	0.36
162	0.39
163	0.35
164	0.36
165	0.4
166	0.44
167	0.46
168	0.54
169	0.58
170	0.65
171	0.71
172	0.72
173	0.72
174	0.73
175	0.69
176	0.6
177	0.54
178	0.46
179	0.4
180	0.37
181	0.3
182	0.22
183	0.21
184	0.21
185	0.16
186	0.13
187	0.1
188	0.08
189	0.08
190	0.07
191	0.08
192	0.12
193	0.12
194	0.12
195	0.12
196	0.12
197	0.12
198	0.14
199	0.15
200	0.13
201	0.15
202	0.16
203	0.18
204	0.25
205	0.31
206	0.31
207	0.36
208	0.39
209	0.44
210	0.48
211	0.51
212	0.46
213	0.43
214	0.46
215	0.43
216	0.4
217	0.34
218	0.32
219	0.29
220	0.29
221	0.25
222	0.22
223	0.17
224	0.15
225	0.16
226	0.16
227	0.14
228	0.12
229	0.11
230	0.11
231	0.17
232	0.22
233	0.26
234	0.31
235	0.36
236	0.41
237	0.45
238	0.52
239	0.52
240	0.5
241	0.45
242	0.4
243	0.35
244	0.3
245	0.25
246	0.18
247	0.11
248	0.09
249	0.07
250	0.05
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.1
255	0.12
256	0.12
257	0.13
258	0.17
259	0.22
260	0.31
261	0.4
262	0.46
263	0.55
264	0.58
265	0.65
266	0.65
267	0.64
268	0.63
269	0.59
270	0.56
271	0.54
272	0.53
273	0.48
274	0.45
275	0.42
276	0.33
277	0.29
278	0.22
279	0.16
280	0.18
281	0.16
282	0.18
283	0.2
284	0.22
285	0.23
286	0.3
287	0.33
288	0.31
289	0.36
290	0.38
291	0.39
292	0.38
293	0.37
294	0.31
295	0.29
296	0.24
297	0.18
298	0.15
299	0.11
300	0.1
301	0.11
302	0.1
303	0.08
304	0.09
305	0.1
306	0.09
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.06
323	0.06
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.08
338	0.07
339	0.06
340	0.04
341	0.04
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.02
348	0.02
349	0.02
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.04
355	0.05
356	0.06
357	0.08
358	0.1
359	0.11
360	0.12
361	0.13
362	0.17
363	0.2
364	0.2
365	0.18
366	0.19
367	0.19
368	0.17
369	0.19
370	0.24
371	0.23
372	0.24
373	0.24
374	0.23
375	0.23
376	0.24
377	0.23
378	0.14
379	0.12
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.1
384	0.12
385	0.15
386	0.19
387	0.18
388	0.18
389	0.19
390	0.2
391	0.19
392	0.18
393	0.15
394	0.12
395	0.13
396	0.15
397	0.13
398	0.12
399	0.12
400	0.1
401	0.08
402	0.07
403	0.07
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.07
417	0.07
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.08
422	0.08
423	0.07
424	0.07
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.07
431	0.12
432	0.2
433	0.18
434	0.19
435	0.19
436	0.19
437	0.28
438	0.3
439	0.28
440	0.2
441	0.21
442	0.22
443	0.23
444	0.23
445	0.14
446	0.12
447	0.09
448	0.09
449	0.07
450	0.06
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.05
460	0.07
461	0.08
462	0.12
463	0.12
464	0.13
465	0.13
466	0.14
467	0.14
468	0.15
469	0.16
470	0.13
471	0.13
472	0.12
473	0.11
474	0.1
475	0.11
476	0.08
477	0.07
478	0.06
479	0.07
480	0.08
481	0.09
482	0.11
483	0.14
484	0.18
485	0.18
486	0.2
487	0.18
488	0.17
489	0.17
490	0.2
491	0.19
492	0.18
493	0.2
494	0.2
495	0.22
496	0.25
497	0.27
498	0.24
499	0.24
500	0.25
501	0.26
502	0.32
503	0.33
504	0.33
505	0.37
506	0.42
507	0.48
508	0.47
509	0.43
510	0.37
511	0.34
512	0.33
513	0.27
514	0.21
515	0.12
516	0.12
517	0.12
518	0.12
519	0.11
520	0.09
521	0.09
522	0.08
523	0.08
524	0.06
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.05
539	0.05
540	0.06
541	0.07
542	0.08
543	0.08
544	0.09
545	0.09
546	0.08
547	0.08
548	0.08
549	0.09
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.08
554	0.08
555	0.1
556	0.1
557	0.13
558	0.2
559	0.21
560	0.22
561	0.25
562	0.27
563	0.28
564	0.29
565	0.28
566	0.3
567	0.4
568	0.46
569	0.52
570	0.55
571	0.55
572	0.55
573	0.55
574	0.57
575	0.58
576	0.58
577	0.57
578	0.52
579	0.56
580	0.55
581	0.51
582	0.41
583	0.3
584	0.21
585	0.13
586	0.12
587	0.06
588	0.07
589	0.06
590	0.06
591	0.08
592	0.08
593	0.1
594	0.14
595	0.17
596	0.17
597	0.23
598	0.23
599	0.25
600	0.28
601	0.28
602	0.27
603	0.28
604	0.34
605	0.35
606	0.41
607	0.46
608	0.5
609	0.48
610	0.48
611	0.5
612	0.44
613	0.43
614	0.41
615	0.38
616	0.32
617	0.35
618	0.34
619	0.32
620	0.3
621	0.25
622	0.23
623	0.21
624	0.21
625	0.23
626	0.22
627	0.22
628	0.22
629	0.23
630	0.23
631	0.21
632	0.19
633	0.16
634	0.17
635	0.15
636	0.17
637	0.16
638	0.15
639	0.15
640	0.15
641	0.11
642	0.12
643	0.16
644	0.14
645	0.15
646	0.15
647	0.15
648	0.15
649	0.15
650	0.12
651	0.08
652	0.08
653	0.07
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.09
658	0.1
659	0.13
660	0.15
661	0.16
662	0.19
663	0.24
664	0.29
665	0.29
666	0.3
667	0.28
668	0.26
669	0.24
670	0.2
671	0.2
672	0.16
673	0.14
674	0.14
675	0.13
676	0.11
677	0.12
678	0.11
679	0.15
680	0.16
681	0.2
682	0.22
683	0.28
684	0.3
685	0.33
686	0.36
687	0.32
688	0.35
689	0.42
690	0.42
691	0.4
692	0.39
693	0.38
694	0.4
695	0.39
696	0.38
697	0.31
698	0.33
699	0.3
700	0.35
701	0.39
702	0.36
703	0.4
704	0.38
705	0.37
706	0.35
707	0.34
708	0.29
709	0.27
710	0.29
711	0.24
712	0.22
713	0.2
714	0.2
715	0.21
716	0.2
717	0.16
718	0.13
719	0.11
720	0.1
721	0.11
722	0.11
723	0.11
724	0.12
725	0.14
726	0.14
727	0.16
728	0.16
729	0.15
730	0.14
731	0.12
732	0.12
733	0.1
734	0.1
735	0.07
736	0.07
737	0.08
738	0.07
739	0.07
740	0.08
741	0.09
742	0.08
743	0.11
744	0.18
745	0.24
746	0.29
747	0.31
748	0.35
749	0.41
750	0.48
751	0.55
752	0.56
753	0.58
754	0.63
755	0.65
756	0.63
757	0.59
758	0.55
759	0.53
760	0.52
761	0.43
762	0.41
763	0.43
764	0.45
765	0.47
766	0.48
767	0.43
768	0.39
769	0.43
770	0.42
771	0.44
772	0.45
773	0.45
774	0.46
775	0.51
776	0.55
777	0.57
778	0.51
779	0.44
780	0.4
781	0.41
782	0.39
783	0.34
784	0.34
785	0.3
786	0.38
787	0.42
788	0.44
789	0.41
790	0.37
791	0.35
792	0.33
793	0.31
794	0.31
795	0.3
796	0.28
797	0.27
798	0.33
799	0.34
800	0.31
801	0.3
802	0.24
803	0.2
804	0.24
805	0.3
806	0.3
807	0.3
808	0.31
809	0.36
810	0.35
811	0.39
812	0.4
813	0.35
814	0.37
815	0.42
816	0.49
817	0.49
818	0.57
819	0.55
820	0.51
821	0.53
822	0.46
823	0.41
824	0.39
825	0.38
826	0.39
827	0.4
828	0.41
829	0.42
830	0.42
831	0.41
832	0.39
833	0.36
834	0.32
835	0.36
836	0.36

Q0C9Z8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer