Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H9CP13

Protein Details
Accession H9CP13    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-25LNIIKSKLNNTYKKKSLNNENVTIHydrophilic
72-98LFIEKNLRKERLRRRLRKLSTNRIFVSHydrophilic
123-145YLLKLRKRYTRLFKKARFVRKLQHydrophilic
250-272AQPLVLKLRKKRKLLRYLKALVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-89RKERLRRRLRK
256-279KLRKKRKLLRYLKALVRKAKIKDI
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007980  Ribosomal_VAR1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05316  VAR1  
Amino Acid Sequences MLNIIKSKLNNTYKKKSLNNENVTIRNKDFVPAVRDWKNSIYVYNKNTLSLIPVASRLVMKLIKGYLNSYNLFIEKNLRKERLRRRLRKLSTNRIFVSDGEFKHTNDNVNITLYVYNRQKLNYLLKLRKRYTRLFKKARFVRKLQLIRNVGLNILKQQEQKSKILTNVLPNYSSKLYSVQNVYYRNFIRKSIRRLKYYMYYKQLLYINKAKFENSYLQGLINLLRKIYNKNVEFNIINLKYFYFNSDIFAQPLVLKLRKKRKLLRYLKALVRKAKIKDIKLNERPKYFFELDNLFTVNNLDTTNNLLNNLMQHNKISSEYLKKVVLSDIKYKRVSGVRIEAAGRLTKRYTASRSQHKVRYKGNLVNAYSSIKGYPSSVIRGNYKPNLEYTKLNSKSRIGSFGVKGWVSGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.8
3 0.8
4 0.81
5 0.82
6 0.81
7 0.79
8 0.78
9 0.77
10 0.73
11 0.69
12 0.59
13 0.52
14 0.44
15 0.38
16 0.35
17 0.33
18 0.34
19 0.34
20 0.41
21 0.44
22 0.45
23 0.46
24 0.45
25 0.46
26 0.4
27 0.4
28 0.39
29 0.4
30 0.43
31 0.47
32 0.44
33 0.39
34 0.39
35 0.34
36 0.3
37 0.25
38 0.22
39 0.16
40 0.17
41 0.16
42 0.16
43 0.17
44 0.13
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.16
49 0.19
50 0.2
51 0.21
52 0.24
53 0.25
54 0.28
55 0.29
56 0.27
57 0.26
58 0.24
59 0.24
60 0.21
61 0.25
62 0.26
63 0.35
64 0.41
65 0.45
66 0.5
67 0.59
68 0.7
69 0.71
70 0.77
71 0.78
72 0.81
73 0.86
74 0.88
75 0.89
76 0.88
77 0.89
78 0.86
79 0.84
80 0.75
81 0.67
82 0.61
83 0.5
84 0.46
85 0.41
86 0.33
87 0.32
88 0.32
89 0.28
90 0.33
91 0.34
92 0.31
93 0.26
94 0.28
95 0.22
96 0.23
97 0.22
98 0.17
99 0.18
100 0.15
101 0.21
102 0.21
103 0.23
104 0.23
105 0.24
106 0.24
107 0.28
108 0.34
109 0.36
110 0.42
111 0.48
112 0.55
113 0.64
114 0.66
115 0.69
116 0.67
117 0.68
118 0.7
119 0.72
120 0.75
121 0.76
122 0.79
123 0.81
124 0.84
125 0.85
126 0.81
127 0.74
128 0.72
129 0.71
130 0.72
131 0.67
132 0.67
133 0.6
134 0.54
135 0.52
136 0.44
137 0.35
138 0.29
139 0.24
140 0.17
141 0.17
142 0.19
143 0.18
144 0.23
145 0.29
146 0.31
147 0.33
148 0.34
149 0.34
150 0.33
151 0.35
152 0.33
153 0.33
154 0.33
155 0.32
156 0.3
157 0.27
158 0.29
159 0.25
160 0.23
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.17
165 0.19
166 0.19
167 0.22
168 0.25
169 0.25
170 0.27
171 0.28
172 0.29
173 0.28
174 0.29
175 0.33
176 0.37
177 0.46
178 0.51
179 0.56
180 0.55
181 0.56
182 0.57
183 0.57
184 0.58
185 0.55
186 0.49
187 0.45
188 0.41
189 0.44
190 0.44
191 0.36
192 0.33
193 0.34
194 0.3
195 0.31
196 0.32
197 0.28
198 0.24
199 0.26
200 0.26
201 0.2
202 0.21
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.15
213 0.18
214 0.23
215 0.29
216 0.26
217 0.3
218 0.31
219 0.32
220 0.31
221 0.29
222 0.31
223 0.23
224 0.22
225 0.19
226 0.18
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.12
231 0.11
232 0.14
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.11
239 0.14
240 0.15
241 0.17
242 0.2
243 0.28
244 0.38
245 0.46
246 0.54
247 0.61
248 0.68
249 0.75
250 0.81
251 0.82
252 0.8
253 0.8
254 0.79
255 0.78
256 0.74
257 0.69
258 0.64
259 0.62
260 0.55
261 0.57
262 0.57
263 0.53
264 0.56
265 0.58
266 0.64
267 0.67
268 0.74
269 0.71
270 0.69
271 0.66
272 0.6
273 0.59
274 0.51
275 0.43
276 0.37
277 0.35
278 0.32
279 0.31
280 0.29
281 0.2
282 0.18
283 0.17
284 0.13
285 0.1
286 0.09
287 0.07
288 0.07
289 0.12
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.16
296 0.2
297 0.18
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.19
303 0.19
304 0.2
305 0.25
306 0.27
307 0.3
308 0.3
309 0.29
310 0.29
311 0.32
312 0.33
313 0.29
314 0.36
315 0.4
316 0.46
317 0.47
318 0.46
319 0.46
320 0.46
321 0.45
322 0.41
323 0.42
324 0.37
325 0.39
326 0.39
327 0.35
328 0.32
329 0.34
330 0.29
331 0.24
332 0.23
333 0.24
334 0.27
335 0.32
336 0.36
337 0.41
338 0.49
339 0.56
340 0.64
341 0.69
342 0.74
343 0.77
344 0.79
345 0.76
346 0.77
347 0.74
348 0.72
349 0.72
350 0.71
351 0.65
352 0.6
353 0.55
354 0.47
355 0.4
356 0.34
357 0.26
358 0.18
359 0.17
360 0.15
361 0.18
362 0.18
363 0.22
364 0.26
365 0.3
366 0.35
367 0.39
368 0.46
369 0.48
370 0.49
371 0.46
372 0.47
373 0.5
374 0.47
375 0.48
376 0.46
377 0.51
378 0.54
379 0.57
380 0.54
381 0.52
382 0.57
383 0.55
384 0.53
385 0.46
386 0.47
387 0.45
388 0.46
389 0.47
390 0.39