FuNGI

Q0CC42

Protein Details

Accession

Q0CC42

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
71-98	AQGNRESKGRIRFKPPPKKEFWNRPYQI	Hydrophilic
1281-1301	QLEPRTRWMKRPTTLQRKAMS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
78-89	KGRIRFKPPPKK

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 7, cyto 3, pero 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP
CDD	cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MARNPGYNAPPATRRHQPSFNQSSQVIAPWKLWDSLAITVKNLTEEINAFILWSAFQEHGNIYSIDIFEDAQGNRESKGRIRFKPPPKKEFWNRPYQISLHDGRKFTISVALDQNRLDPHVPSPTPRDIQYPAESKMPISSMEIGVLCGETTMLPMRSVNFSNPRPLILDLRGRALWIYFDLAISHVRKERLEVVKQEYRLKIPLVQLTRIFQTQDSKSGDIVHFIFLDSPPIYQRRIKNVENTFIDDLNWRESDTWFRQTHIVHNPHEHASLPIGLKKIKPVVDIGRWNALRITYSNTVSKTKDFALLCDVLNDYNIKIEHTDRFTLWDKDEQIPSPIWQWIDPTDSRPSAESSMALVDLIDHDYIHLPFSVRYQLEVCISNGYLSEYAMTREFAVKLSELGETQATKLLEHVATQKRVYYDPMKIFDLKFIKGATNAKIPPYCCYIRSARVTPSTVYYETPSMDMSNRIIRHYIEYADRFLRVRFTDEKLLGRIYSTTDNTMDEVFTRVKRALANGIVIGDRRYEFLAFGNSQFREHGAYFFAPLPNLTAANIRAWMGHFDDIRNVAKHAARLGQCFSTTRAIFGCPIKVQEIDDIVRNGYRFSDGVGRISKFLAQMVMSELKIKTPSGEPPSVFQFRLGGCKGILTVSPQAQRQEVHIRKSQAKFTATHNGLEIIRWSQFTAASLNRQLIIVLSTLGIRDRIFHEKLRAVLWGLNEALKNDAKAIHLLRRYVDPNQRTLTISQMVVDGFRRTEEPFATSVLTLWRAWHLKYLKDKAKITIDKGACVFGCMDETGTLKGYFHEKIPDRDAPFEQRFAALPEIFLQIPNQDKGGKYEVIQGMCILARNPSLHSGDIRVVKAVDVPALRHLQDVVVLPQTGDRDIASMCSGGDLDGDDYVVIWDQDLIPKDWFRPPMNYTTNKARDLDRDVTVDEITSFFVTYMKNDCLPTIAHAHLAWADRLDNGVDEEKCIRLAQLHSDAVDYNKNGTPAHMTRNLEPKLWPHFMEKKTEKVYKSGKILGQLYDAVERVNFVPSLEKPFDRRILNSRIPVAEDLYQFARDMKKDYDIALRRIMAQHEIKTEFEVWSTFVLSHANMSKDYKFHEEIGMLSSSLREGFKRECYDKVGGRGFDRVAPLALAMYRITHEEMNAALEKHRAGFSEDAKNFQKTGPKMDQLPLISFPWIFPRVLGQIATGYYDEEPVPAPAAVDPKPEQVVSENCQNGTTDREKKPNDGASPVPYEDHFGLFEGEEVVSQTTVREAILKDVLMSMIRCSRAARAQLEPRTRWMKRPTTLQRKAMSPPQLLLSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.57
3	0.63
4	0.65
5	0.69
6	0.74
7	0.72
8	0.68
9	0.6
10	0.56
11	0.48
12	0.46
13	0.4
14	0.31
15	0.28
16	0.26
17	0.29
18	0.26
19	0.25
20	0.22
21	0.2
22	0.26
23	0.31
24	0.28
25	0.27
26	0.28
27	0.28
28	0.27
29	0.25
30	0.18
31	0.14
32	0.15
33	0.17
34	0.16
35	0.15
36	0.14
37	0.14
38	0.13
39	0.1
40	0.1
41	0.1
42	0.09
43	0.1
44	0.12
45	0.12
46	0.14
47	0.16
48	0.16
49	0.14
50	0.16
51	0.15
52	0.14
53	0.14
54	0.12
55	0.11
56	0.15
57	0.14
58	0.16
59	0.19
60	0.19
61	0.2
62	0.23
63	0.25
64	0.28
65	0.38
66	0.43
67	0.48
68	0.56
69	0.66
70	0.73
71	0.81
72	0.85
73	0.84
74	0.82
75	0.86
76	0.87
77	0.89
78	0.85
79	0.85
80	0.79
81	0.75
82	0.72
83	0.63
84	0.56
85	0.51
86	0.5
87	0.48
88	0.5
89	0.46
90	0.42
91	0.43
92	0.39
93	0.33
94	0.33
95	0.26
96	0.24
97	0.32
98	0.34
99	0.34
100	0.33
101	0.36
102	0.3
103	0.32
104	0.28
105	0.21
106	0.21
107	0.28
108	0.29
109	0.3
110	0.35
111	0.4
112	0.41
113	0.41
114	0.43
115	0.38
116	0.42
117	0.46
118	0.44
119	0.39
120	0.41
121	0.39
122	0.35
123	0.33
124	0.28
125	0.22
126	0.2
127	0.21
128	0.17
129	0.18
130	0.18
131	0.16
132	0.15
133	0.14
134	0.1
135	0.07
136	0.07
137	0.05
138	0.07
139	0.1
140	0.11
141	0.11
142	0.13
143	0.15
144	0.19
145	0.21
146	0.26
147	0.3
148	0.32
149	0.4
150	0.4
151	0.39
152	0.38
153	0.38
154	0.36
155	0.33
156	0.39
157	0.32
158	0.35
159	0.34
160	0.32
161	0.29
162	0.25
163	0.2
164	0.14
165	0.15
166	0.11
167	0.11
168	0.11
169	0.12
170	0.17
171	0.17
172	0.19
173	0.21
174	0.23
175	0.23
176	0.27
177	0.35
178	0.38
179	0.43
180	0.45
181	0.49
182	0.53
183	0.56
184	0.6
185	0.54
186	0.49
187	0.46
188	0.42
189	0.38
190	0.37
191	0.4
192	0.37
193	0.38
194	0.37
195	0.37
196	0.38
197	0.34
198	0.31
199	0.25
200	0.29
201	0.27
202	0.32
203	0.33
204	0.32
205	0.31
206	0.34
207	0.32
208	0.29
209	0.27
210	0.21
211	0.17
212	0.16
213	0.17
214	0.12
215	0.16
216	0.13
217	0.13
218	0.15
219	0.18
220	0.21
221	0.26
222	0.32
223	0.38
224	0.45
225	0.48
226	0.53
227	0.57
228	0.62
229	0.58
230	0.58
231	0.5
232	0.43
233	0.4
234	0.34
235	0.29
236	0.25
237	0.22
238	0.17
239	0.16
240	0.17
241	0.24
242	0.26
243	0.33
244	0.3
245	0.31
246	0.35
247	0.35
248	0.42
249	0.44
250	0.45
251	0.4
252	0.45
253	0.47
254	0.44
255	0.44
256	0.36
257	0.27
258	0.23
259	0.24
260	0.2
261	0.2
262	0.2
263	0.21
264	0.22
265	0.25
266	0.29
267	0.27
268	0.26
269	0.29
270	0.33
271	0.38
272	0.43
273	0.41
274	0.44
275	0.42
276	0.42
277	0.37
278	0.31
279	0.26
280	0.21
281	0.25
282	0.2
283	0.23
284	0.26
285	0.28
286	0.31
287	0.31
288	0.32
289	0.28
290	0.25
291	0.29
292	0.26
293	0.24
294	0.26
295	0.26
296	0.24
297	0.23
298	0.22
299	0.15
300	0.16
301	0.15
302	0.1
303	0.11
304	0.11
305	0.11
306	0.12
307	0.14
308	0.18
309	0.22
310	0.24
311	0.21
312	0.26
313	0.3
314	0.31
315	0.31
316	0.31
317	0.31
318	0.33
319	0.36
320	0.31
321	0.3
322	0.28
323	0.26
324	0.23
325	0.22
326	0.18
327	0.16
328	0.16
329	0.16
330	0.19
331	0.19
332	0.2
333	0.23
334	0.24
335	0.24
336	0.23
337	0.24
338	0.21
339	0.21
340	0.18
341	0.14
342	0.13
343	0.13
344	0.11
345	0.08
346	0.06
347	0.07
348	0.07
349	0.06
350	0.05
351	0.06
352	0.08
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.08
357	0.09
358	0.11
359	0.16
360	0.15
361	0.16
362	0.16
363	0.18
364	0.19
365	0.2
366	0.19
367	0.15
368	0.15
369	0.14
370	0.13
371	0.13
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.09
377	0.09
378	0.1
379	0.09
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.12
384	0.11
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.09
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.1
393	0.13
394	0.12
395	0.11
396	0.11
397	0.13
398	0.12
399	0.13
400	0.21
401	0.23
402	0.26
403	0.26
404	0.28
405	0.27
406	0.28
407	0.31
408	0.28
409	0.29
410	0.31
411	0.34
412	0.34
413	0.35
414	0.34
415	0.36
416	0.34
417	0.28
418	0.24
419	0.22
420	0.2
421	0.22
422	0.25
423	0.21
424	0.25
425	0.25
426	0.27
427	0.29
428	0.29
429	0.28
430	0.3
431	0.29
432	0.23
433	0.27
434	0.27
435	0.31
436	0.36
437	0.37
438	0.35
439	0.38
440	0.39
441	0.35
442	0.35
443	0.32
444	0.27
445	0.25
446	0.22
447	0.19
448	0.17
449	0.17
450	0.14
451	0.11
452	0.11
453	0.12
454	0.12
455	0.16
456	0.17
457	0.17
458	0.18
459	0.18
460	0.2
461	0.2
462	0.2
463	0.19
464	0.2
465	0.22
466	0.22
467	0.22
468	0.2
469	0.19
470	0.2
471	0.16
472	0.2
473	0.2
474	0.23
475	0.28
476	0.29
477	0.31
478	0.28
479	0.28
480	0.24
481	0.2
482	0.17
483	0.14
484	0.15
485	0.14
486	0.14
487	0.14
488	0.15
489	0.15
490	0.15
491	0.12
492	0.09
493	0.11
494	0.11
495	0.11
496	0.12
497	0.12
498	0.13
499	0.14
500	0.15
501	0.17
502	0.16
503	0.16
504	0.15
505	0.15
506	0.14
507	0.13
508	0.12
509	0.09
510	0.08
511	0.08
512	0.09
513	0.08
514	0.08
515	0.09
516	0.12
517	0.12
518	0.13
519	0.17
520	0.17
521	0.17
522	0.17
523	0.16
524	0.15
525	0.15
526	0.14
527	0.12
528	0.12
529	0.13
530	0.14
531	0.14
532	0.11
533	0.11
534	0.11
535	0.1
536	0.1
537	0.08
538	0.09
539	0.09
540	0.09
541	0.1
542	0.09
543	0.08
544	0.09
545	0.1
546	0.1
547	0.12
548	0.11
549	0.11
550	0.12
551	0.15
552	0.16
553	0.16
554	0.14
555	0.15
556	0.15
557	0.16
558	0.16
559	0.19
560	0.18
561	0.19
562	0.21
563	0.19
564	0.18
565	0.19
566	0.19
567	0.19
568	0.18
569	0.17
570	0.16
571	0.15
572	0.17
573	0.17
574	0.17
575	0.12
576	0.13
577	0.14
578	0.14
579	0.14
580	0.12
581	0.13
582	0.12
583	0.13
584	0.12
585	0.11
586	0.12
587	0.11
588	0.1
589	0.08
590	0.09
591	0.07
592	0.08
593	0.14
594	0.13
595	0.16
596	0.19
597	0.19
598	0.19
599	0.19
600	0.19
601	0.13
602	0.13
603	0.1
604	0.07
605	0.07
606	0.09
607	0.1
608	0.09
609	0.11
610	0.11
611	0.11
612	0.12
613	0.11
614	0.1
615	0.1
616	0.15
617	0.18
618	0.21
619	0.21
620	0.22
621	0.27
622	0.28
623	0.26
624	0.21
625	0.19
626	0.16
627	0.21
628	0.19
629	0.15
630	0.12
631	0.12
632	0.12
633	0.1
634	0.1
635	0.08
636	0.1
637	0.12
638	0.15
639	0.16
640	0.17
641	0.18
642	0.18
643	0.19
644	0.27
645	0.28
646	0.3
647	0.32
648	0.35
649	0.41
650	0.43
651	0.43
652	0.37
653	0.36
654	0.33
655	0.33
656	0.39
657	0.33
658	0.32
659	0.28
660	0.25
661	0.23
662	0.21
663	0.18
664	0.09
665	0.09
666	0.09
667	0.09
668	0.07
669	0.08
670	0.08
671	0.1
672	0.1
673	0.12
674	0.13
675	0.13
676	0.12
677	0.12
678	0.11
679	0.09
680	0.08
681	0.06
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.06
688	0.05
689	0.06
690	0.09
691	0.15
692	0.17
693	0.19
694	0.22
695	0.23
696	0.24
697	0.24
698	0.21
699	0.16
700	0.16
701	0.15
702	0.13
703	0.11
704	0.12
705	0.11
706	0.11
707	0.12
708	0.1
709	0.1
710	0.09
711	0.1
712	0.09
713	0.11
714	0.13
715	0.16
716	0.18
717	0.19
718	0.19
719	0.21
720	0.23
721	0.27
722	0.33
723	0.29
724	0.31
725	0.32
726	0.33
727	0.31
728	0.29
729	0.26
730	0.2
731	0.18
732	0.14
733	0.13
734	0.12
735	0.11
736	0.12
737	0.09
738	0.07
739	0.08
740	0.09
741	0.09
742	0.11
743	0.11
744	0.12
745	0.12
746	0.13
747	0.13
748	0.11
749	0.11
750	0.1
751	0.12
752	0.1
753	0.09
754	0.12
755	0.13
756	0.13
757	0.2
758	0.21
759	0.24
760	0.32
761	0.41
762	0.44
763	0.49
764	0.5
765	0.47
766	0.55
767	0.53
768	0.47
769	0.47
770	0.4
771	0.36
772	0.35
773	0.32
774	0.22
775	0.2
776	0.17
777	0.09
778	0.09
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.08
783	0.08
784	0.09
785	0.09
786	0.08
787	0.09
788	0.11
789	0.12
790	0.12
791	0.19
792	0.2
793	0.24
794	0.29
795	0.34
796	0.33
797	0.35
798	0.36
799	0.37
800	0.36
801	0.33
802	0.28
803	0.24
804	0.22
805	0.21
806	0.22
807	0.14
808	0.12
809	0.12
810	0.14
811	0.13
812	0.13
813	0.11
814	0.1
815	0.13
816	0.13
817	0.13
818	0.12
819	0.13
820	0.16
821	0.2
822	0.18
823	0.16
824	0.23
825	0.25
826	0.24
827	0.24
828	0.2
829	0.17
830	0.17
831	0.16
832	0.09
833	0.07
834	0.08
835	0.09
836	0.1
837	0.13
838	0.14
839	0.15
840	0.15
841	0.16
842	0.19
843	0.22
844	0.21
845	0.18
846	0.16
847	0.16
848	0.17
849	0.15
850	0.13
851	0.1
852	0.11
853	0.14
854	0.16
855	0.16
856	0.15
857	0.14
858	0.12
859	0.13
860	0.14
861	0.11
862	0.11
863	0.11
864	0.1
865	0.12
866	0.12
867	0.11
868	0.1
869	0.08
870	0.07
871	0.08
872	0.09
873	0.08
874	0.07
875	0.07
876	0.06
877	0.06
878	0.05
879	0.05
880	0.05
881	0.05
882	0.05
883	0.05
884	0.04
885	0.04
886	0.04
887	0.05
888	0.04
889	0.03
890	0.04
891	0.04
892	0.08
893	0.09
894	0.11
895	0.13
896	0.14
897	0.17
898	0.21
899	0.26
900	0.25
901	0.29
902	0.3
903	0.37
904	0.43
905	0.45
906	0.45
907	0.5
908	0.53
909	0.5
910	0.49
911	0.42
912	0.4
913	0.42
914	0.42
915	0.34
916	0.3
917	0.28
918	0.27
919	0.25
920	0.21
921	0.14
922	0.1
923	0.09
924	0.08
925	0.07
926	0.06
927	0.08
928	0.08
929	0.09
930	0.13
931	0.14
932	0.16
933	0.17
934	0.17
935	0.16
936	0.17
937	0.17
938	0.18
939	0.16
940	0.15
941	0.15
942	0.15
943	0.17
944	0.17
945	0.15
946	0.11
947	0.11
948	0.1
949	0.11
950	0.1
951	0.08
952	0.09
953	0.13
954	0.12
955	0.13
956	0.15
957	0.15
958	0.15
959	0.15
960	0.13
961	0.12
962	0.14
963	0.18
964	0.22
965	0.22
966	0.22
967	0.23
968	0.23
969	0.21
970	0.23
971	0.18
972	0.16
973	0.17
974	0.18
975	0.17
976	0.17
977	0.23
978	0.22
979	0.28
980	0.31
981	0.31
982	0.35
983	0.44
984	0.45
985	0.39
986	0.38
987	0.37
988	0.38
989	0.39
990	0.36
991	0.34
992	0.41
993	0.42
994	0.51
995	0.49
996	0.5
997	0.54
998	0.59
999	0.53
1000	0.52
1001	0.57
1002	0.53
1003	0.56
1004	0.54
1005	0.48
1006	0.48
1007	0.49
1008	0.41
1009	0.36
1010	0.31
1011	0.26
1012	0.22
1013	0.2
1014	0.14
1015	0.12
1016	0.12
1017	0.1
1018	0.11
1019	0.1
1020	0.09
1021	0.13
1022	0.14
1023	0.22
1024	0.24
1025	0.25
1026	0.27
1027	0.33
1028	0.39
1029	0.37
1030	0.4
1031	0.4
1032	0.46
1033	0.5
1034	0.5
1035	0.48
1036	0.43
1037	0.42
1038	0.39
1039	0.35
1040	0.3
1041	0.24
1042	0.23
1043	0.21
1044	0.2
1045	0.18
1046	0.2
1047	0.21
1048	0.18
1049	0.22
1050	0.22
1051	0.24
1052	0.25
1053	0.27
1054	0.34
1055	0.35
1056	0.38
1057	0.38
1058	0.36
1059	0.34
1060	0.35
1061	0.34
1062	0.32
1063	0.31
1064	0.3
1065	0.31
1066	0.33
1067	0.31
1068	0.31
1069	0.31
1070	0.25
1071	0.21
1072	0.18
1073	0.14
1074	0.13
1075	0.13
1076	0.11
1077	0.1
1078	0.11
1079	0.1
1080	0.13
1081	0.16
1082	0.16
1083	0.17
1084	0.21
1085	0.23
1086	0.23
1087	0.27
1088	0.29
1089	0.28
1090	0.28
1091	0.29
1092	0.26
1093	0.25
1094	0.26
1095	0.23
1096	0.17
1097	0.14
1098	0.13
1099	0.11
1100	0.12
1101	0.12
1102	0.1
1103	0.13
1104	0.17
1105	0.25
1106	0.33
1107	0.35
1108	0.36
1109	0.41
1110	0.47
1111	0.48
1112	0.51
1113	0.5
1114	0.45
1115	0.44
1116	0.44
1117	0.4
1118	0.36
1119	0.34
1120	0.27
1121	0.21
1122	0.18
1123	0.17
1124	0.14
1125	0.13
1126	0.11
1127	0.09
1128	0.09
1129	0.09
1130	0.11
1131	0.13
1132	0.12
1133	0.12
1134	0.12
1135	0.12
1136	0.15
1137	0.16
1138	0.15
1139	0.14
1140	0.16
1141	0.16
1142	0.17
1143	0.18
1144	0.15
1145	0.17
1146	0.22
1147	0.26
1148	0.35
1149	0.35
1150	0.39
1151	0.42
1152	0.43
1153	0.4
1154	0.38
1155	0.4
1156	0.32
1157	0.4
1158	0.42
1159	0.43
1160	0.45
1161	0.47
1162	0.5
1163	0.44
1164	0.45
1165	0.39
1166	0.32
1167	0.29
1168	0.25
1169	0.22
1170	0.23
1171	0.23
1172	0.2
1173	0.17
1174	0.2
1175	0.21
1176	0.23
1177	0.23
1178	0.17
1179	0.17
1180	0.17
1181	0.19
1182	0.15
1183	0.14
1184	0.12
1185	0.13
1186	0.12
1187	0.11
1188	0.12
1189	0.11
1190	0.12
1191	0.11
1192	0.11
1193	0.11
1194	0.16
1195	0.16
1196	0.21
1197	0.22
1198	0.24
1199	0.27
1200	0.26
1201	0.25
1202	0.26
1203	0.31
1204	0.29
1205	0.36
1206	0.35
1207	0.33
1208	0.34
1209	0.34
1210	0.3
1211	0.31
1212	0.35
1213	0.36
1214	0.41
1215	0.5
1216	0.52
1217	0.56
1218	0.63
1219	0.65
1220	0.6
1221	0.55
1222	0.52
1223	0.49
1224	0.51
1225	0.47
1226	0.4
1227	0.32
1228	0.32
1229	0.28
1230	0.26
1231	0.21
1232	0.17
1233	0.17
1234	0.15
1235	0.15
1236	0.12
1237	0.11
1238	0.09
1239	0.1
1240	0.1
1241	0.09
1242	0.09
1243	0.08
1244	0.08
1245	0.09
1246	0.09
1247	0.12
1248	0.12
1249	0.16
1250	0.19
1251	0.19
1252	0.18
1253	0.18
1254	0.19
1255	0.17
1256	0.17
1257	0.16
1258	0.19
1259	0.2
1260	0.21
1261	0.22
1262	0.26
1263	0.32
1264	0.38
1265	0.38
1266	0.42
1267	0.5
1268	0.59
1269	0.66
1270	0.63
1271	0.64
1272	0.67
1273	0.66
1274	0.66
1275	0.66
1276	0.66
1277	0.64
1278	0.73
1279	0.75
1280	0.77
1281	0.84
1282	0.83
1283	0.79
1284	0.74
1285	0.74
1286	0.72
1287	0.69
1288	0.61
1289	0.53

Q0CC42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer