FuNGI

Q0CHU1

Protein Details

Accession

Q0CHU1

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
49-70	QGKTKYEQAREIKKRKRMSEVS	Hydrophilic
291-323	VVEKEKGDDQKKKKKKKKKTRKRQDMVPTPLSN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
38-65	GAVKKRKTEALQGKTKYEQAREIKKRKR
293-313	EKEKGDDQKKKKKKKKKTRKR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013520 Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3 IPR037431 REX4_DEDDh_dom IPR047021 REXO1/3/4-like IPR013924 RNase_H2_suC IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0032299 C:ribonuclease H2 complex GO:0008408 F:3'-5' exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006401 P:RNA catabolic process GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF08615 RNase_H2_suC PF00929 RNase_T
CDD	cd06144 REX4_like cd09271 RNase_H2-C

Amino Acid Sequences

MDLKNLSSNWKKLQETLKKESVSTSTKRKTADREPQNGAVKKRKTEALQGKTKYEQAREIKKRKRMSEVSSEDRGNGVQETEVKSVSRKSSTATLAVRAEPKTAKVNEGRSKTAELGKYVAMDCEMVGVGPNPDHDSALARVSIVNFNGEQVYDSFVRPKEMVTDWRTHVSGILPRHMAEARTLEQVQKEVAEIIDGRILVGHALRNDLDALLLSHPKRDIRDTSKYPPYRKVAGGGSPRLKVLASEFLGLDIQGGAHSSVEDAKATMLLYRRDKDGFEREHAKKWPVRVVVEKEKGDDQKKKKKKKKKTRKRQDMVPTPLSNKLSTIEPPMIKLNYAHIAYFVISDNSFSNWTTAMFALQRPSQSSDSTCPDKCTPNILPCRVHHDGPVNSVDRFWIPVPDEKDKALQTAHFRGRKLRGRHVAVPEGYQGVVAALTERVIPSKPAENDDSAPEEPIKILEQQSTFKEVVVWGHETMPASDDPFVKGVEEWIKLAEAMHIQPSSEKQPST

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.66
3	0.69
4	0.69
5	0.62
6	0.61
7	0.58
8	0.54
9	0.51
10	0.49
11	0.51
12	0.5
13	0.53
14	0.57
15	0.59
16	0.61
17	0.64
18	0.68
19	0.68
20	0.69
21	0.71
22	0.76
23	0.79
24	0.76
25	0.74
26	0.73
27	0.69
28	0.65
29	0.64
30	0.62
31	0.56
32	0.61
33	0.64
34	0.64
35	0.67
36	0.66
37	0.66
38	0.62
39	0.65
40	0.6
41	0.53
42	0.53
43	0.52
44	0.6
45	0.65
46	0.73
47	0.75
48	0.79
49	0.84
50	0.81
51	0.82
52	0.79
53	0.76
54	0.76
55	0.75
56	0.73
57	0.69
58	0.64
59	0.54
60	0.46
61	0.39
62	0.29
63	0.22
64	0.15
65	0.11
66	0.15
67	0.19
68	0.19
69	0.2
70	0.19
71	0.21
72	0.25
73	0.28
74	0.27
75	0.23
76	0.25
77	0.31
78	0.33
79	0.37
80	0.34
81	0.34
82	0.33
83	0.35
84	0.37
85	0.31
86	0.32
87	0.26
88	0.28
89	0.31
90	0.3
91	0.32
92	0.34
93	0.43
94	0.47
95	0.51
96	0.51
97	0.46
98	0.47
99	0.45
100	0.45
101	0.38
102	0.31
103	0.29
104	0.26
105	0.25
106	0.23
107	0.2
108	0.14
109	0.12
110	0.1
111	0.09
112	0.08
113	0.05
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.08
119	0.09
120	0.1
121	0.1
122	0.1
123	0.12
124	0.13
125	0.14
126	0.13
127	0.11
128	0.11
129	0.13
130	0.14
131	0.12
132	0.12
133	0.11
134	0.11
135	0.12
136	0.11
137	0.1
138	0.08
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.15
143	0.15
144	0.17
145	0.17
146	0.17
147	0.17
148	0.19
149	0.26
150	0.25
151	0.3
152	0.3
153	0.32
154	0.32
155	0.28
156	0.26
157	0.22
158	0.23
159	0.2
160	0.22
161	0.2
162	0.2
163	0.22
164	0.22
165	0.2
166	0.17
167	0.18
168	0.16
169	0.19
170	0.2
171	0.19
172	0.18
173	0.19
174	0.17
175	0.13
176	0.12
177	0.09
178	0.08
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.07
184	0.07
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.07
190	0.06
191	0.07
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.07
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.1
201	0.1
202	0.11
203	0.13
204	0.14
205	0.16
206	0.19
207	0.24
208	0.27
209	0.36
210	0.4
211	0.46
212	0.54
213	0.58
214	0.58
215	0.58
216	0.56
217	0.51
218	0.46
219	0.42
220	0.35
221	0.36
222	0.38
223	0.36
224	0.35
225	0.31
226	0.31
227	0.27
228	0.25
229	0.18
230	0.15
231	0.15
232	0.12
233	0.13
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.1
239	0.05
240	0.04
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.07
255	0.09
256	0.13
257	0.17
258	0.18
259	0.2
260	0.21
261	0.21
262	0.24
263	0.29
264	0.28
265	0.29
266	0.37
267	0.37
268	0.42
269	0.44
270	0.44
271	0.38
272	0.39
273	0.41
274	0.35
275	0.35
276	0.36
277	0.41
278	0.45
279	0.49
280	0.46
281	0.41
282	0.43
283	0.45
284	0.45
285	0.47
286	0.47
287	0.52
288	0.62
289	0.71
290	0.77
291	0.82
292	0.87
293	0.9
294	0.92
295	0.93
296	0.95
297	0.95
298	0.97
299	0.93
300	0.92
301	0.91
302	0.9
303	0.86
304	0.82
305	0.72
306	0.63
307	0.6
308	0.52
309	0.41
310	0.31
311	0.25
312	0.2
313	0.18
314	0.2
315	0.2
316	0.19
317	0.2
318	0.23
319	0.22
320	0.2
321	0.19
322	0.18
323	0.18
324	0.18
325	0.17
326	0.14
327	0.14
328	0.14
329	0.14
330	0.12
331	0.08
332	0.08
333	0.09
334	0.09
335	0.1
336	0.11
337	0.1
338	0.1
339	0.09
340	0.1
341	0.1
342	0.09
343	0.1
344	0.1
345	0.11
346	0.14
347	0.15
348	0.16
349	0.17
350	0.22
351	0.22
352	0.22
353	0.24
354	0.26
355	0.3
356	0.34
357	0.33
358	0.33
359	0.35
360	0.37
361	0.35
362	0.38
363	0.37
364	0.41
365	0.48
366	0.48
367	0.5
368	0.47
369	0.55
370	0.51
371	0.47
372	0.42
373	0.41
374	0.38
375	0.36
376	0.4
377	0.33
378	0.3
379	0.29
380	0.26
381	0.19
382	0.2
383	0.17
384	0.16
385	0.16
386	0.22
387	0.28
388	0.32
389	0.33
390	0.32
391	0.36
392	0.33
393	0.33
394	0.28
395	0.27
396	0.28
397	0.35
398	0.43
399	0.42
400	0.43
401	0.48
402	0.56
403	0.61
404	0.62
405	0.63
406	0.64
407	0.67
408	0.73
409	0.72
410	0.71
411	0.63
412	0.57
413	0.48
414	0.4
415	0.33
416	0.25
417	0.18
418	0.1
419	0.09
420	0.07
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.08
427	0.09
428	0.11
429	0.13
430	0.21
431	0.23
432	0.27
433	0.31
434	0.33
435	0.34
436	0.36
437	0.38
438	0.31
439	0.3
440	0.26
441	0.23
442	0.19
443	0.19
444	0.17
445	0.15
446	0.17
447	0.2
448	0.22
449	0.26
450	0.28
451	0.32
452	0.31
453	0.27
454	0.26
455	0.22
456	0.23
457	0.23
458	0.23
459	0.19
460	0.2
461	0.22
462	0.22
463	0.21
464	0.2
465	0.17
466	0.16
467	0.18
468	0.18
469	0.18
470	0.18
471	0.18
472	0.16
473	0.16
474	0.2
475	0.22
476	0.22
477	0.21
478	0.21
479	0.21
480	0.2
481	0.2
482	0.18
483	0.15
484	0.16
485	0.2
486	0.19
487	0.19
488	0.21
489	0.26
490	0.3

Q0CHU1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer