FuNGI

Q0CCS6

Protein Details

Accession

Q0CCS6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
897-923	GLVSQPTTPKRRLRKKTSQTTNVDSSA	Hydrophilic
974-994	GRDAARKNAAKARKKRRAAGF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
977-993	AARKNAAKARKKRRAAG

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

MDEHPTSALQYGHLGRAIYYPETQTWGFARRLSPPPHISYAGVTKTTVPSPLTAPQSSLVENKNALRRAYPELAAGWHLLRNETLSHVIATTSERCDPLVSSLLDFGYAVDLETDEWRSRVVPIAVVASGECGNSVSFRMIEEDIVEVRQENTVGMRVPSVGNSEWVEWCAGGAPVRQICFAQPVEEKPTWLAVRFHRSTSIFRPMYHRSPVPVHVYRQGERVSPNRHSNSRLNANPLVEISHLQTGGFAHADVTFNPWYQRQFALVDERGNWSIWEISGRQRRHKSNLSAACVKSGSLPWLDLGDGQDIEGHPRHDGWAAIEWVGDFKTLIVSDRRCLILYRTEDDDTYSYPIELDLGRKSEWILDVKRSPCNVSHVFILTTSRIFWLDVSPESLPAADKGSNPSLYPRLSWRHFRDPEDTTLKLTPLIVHTDFYLVLYSRLNKIVLSFHCSTTSGDIESIPDPFILDIPSISDDDIEPQAGSDSAQFSSLVFKEISHLPTFVSRDYYNPDQKLVKLFAVDTQLRVREYIFSGPAYGGTEDERDLGDHILRPKKRQTGVHKEQYVRPKDEFVVDDWDDSVVGAGAFAVANTGMSSITPLAIPQWTMDFTQVYAVATGRMIVASSEGQEAPAVDKSLRESIQELRDKVSSLDLSDQPVGRTMLEYLGSSPVLDDIDQNAQELSEYLSEIMADSHLQQFFVQLPASSGAAPLIGTPSTTGVNLIDLYDRLANDWLASLPHYIPGRTRIMKEKVIRTIAADIVLSQVTVLRPTTRRLGEPSEKTPEISTNESNIDEDDILYGTQDSQLPLPPSTPRHRTDVPKSSATVRNDTGRGDEGLSDMQDDTVPLFSSLASFTSFNTDRPLARNVANMLQQWQPGTDPSRYTWQRIGQPSETDDGLVSQPTTPKRRLRKKTSQTTNVDSSAPPLVSSATPVVRDWGSQPDRNERFTSRPPPSSQVFDEDLPMTQVERGTFGGRDAARKNAAKARKKRRAAGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.2
3	0.22
4	0.25
5	0.22
6	0.22
7	0.22
8	0.21
9	0.26
10	0.25
11	0.25
12	0.25
13	0.28
14	0.28
15	0.28
16	0.3
17	0.33
18	0.42
19	0.45
20	0.5
21	0.51
22	0.55
23	0.56
24	0.56
25	0.49
26	0.45
27	0.47
28	0.42
29	0.37
30	0.32
31	0.29
32	0.3
33	0.3
34	0.29
35	0.23
36	0.21
37	0.23
38	0.29
39	0.33
40	0.3
41	0.3
42	0.29
43	0.31
44	0.31
45	0.33
46	0.29
47	0.27
48	0.29
49	0.33
50	0.38
51	0.4
52	0.39
53	0.36
54	0.38
55	0.42
56	0.43
57	0.39
58	0.33
59	0.3
60	0.3
61	0.29
62	0.26
63	0.2
64	0.17
65	0.17
66	0.16
67	0.15
68	0.15
69	0.15
70	0.16
71	0.18
72	0.16
73	0.16
74	0.16
75	0.15
76	0.14
77	0.17
78	0.17
79	0.18
80	0.2
81	0.2
82	0.2
83	0.21
84	0.21
85	0.21
86	0.24
87	0.21
88	0.19
89	0.2
90	0.2
91	0.19
92	0.17
93	0.14
94	0.1
95	0.09
96	0.08
97	0.06
98	0.07
99	0.08
100	0.1
101	0.13
102	0.12
103	0.12
104	0.13
105	0.13
106	0.14
107	0.19
108	0.18
109	0.17
110	0.17
111	0.19
112	0.18
113	0.18
114	0.17
115	0.13
116	0.12
117	0.1
118	0.09
119	0.07
120	0.08
121	0.08
122	0.09
123	0.09
124	0.09
125	0.09
126	0.13
127	0.12
128	0.13
129	0.13
130	0.13
131	0.13
132	0.13
133	0.12
134	0.1
135	0.1
136	0.11
137	0.1
138	0.08
139	0.09
140	0.11
141	0.12
142	0.12
143	0.12
144	0.12
145	0.13
146	0.13
147	0.16
148	0.14
149	0.15
150	0.16
151	0.18
152	0.17
153	0.18
154	0.17
155	0.13
156	0.12
157	0.11
158	0.1
159	0.1
160	0.1
161	0.15
162	0.17
163	0.18
164	0.19
165	0.18
166	0.18
167	0.22
168	0.21
169	0.2
170	0.21
171	0.23
172	0.3
173	0.3
174	0.3
175	0.25
176	0.31
177	0.28
178	0.28
179	0.29
180	0.28
181	0.37
182	0.38
183	0.39
184	0.39
185	0.4
186	0.42
187	0.44
188	0.48
189	0.4
190	0.4
191	0.45
192	0.46
193	0.49
194	0.5
195	0.45
196	0.39
197	0.41
198	0.45
199	0.47
200	0.44
201	0.42
202	0.43
203	0.47
204	0.44
205	0.45
206	0.41
207	0.36
208	0.36
209	0.41
210	0.4
211	0.42
212	0.49
213	0.51
214	0.53
215	0.56
216	0.57
217	0.58
218	0.6
219	0.56
220	0.54
221	0.51
222	0.48
223	0.43
224	0.37
225	0.29
226	0.21
227	0.19
228	0.15
229	0.14
230	0.13
231	0.12
232	0.12
233	0.11
234	0.12
235	0.11
236	0.09
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.12
242	0.12
243	0.13
244	0.15
245	0.16
246	0.17
247	0.19
248	0.2
249	0.18
250	0.18
251	0.19
252	0.25
253	0.25
254	0.25
255	0.24
256	0.26
257	0.25
258	0.24
259	0.22
260	0.15
261	0.13
262	0.12
263	0.13
264	0.11
265	0.19
266	0.27
267	0.31
268	0.39
269	0.47
270	0.53
271	0.58
272	0.66
273	0.64
274	0.66
275	0.69
276	0.66
277	0.65
278	0.59
279	0.54
280	0.45
281	0.38
282	0.3
283	0.23
284	0.19
285	0.12
286	0.13
287	0.1
288	0.11
289	0.11
290	0.1
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.09
297	0.12
298	0.13
299	0.12
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.13
307	0.13
308	0.13
309	0.13
310	0.12
311	0.11
312	0.11
313	0.09
314	0.05
315	0.04
316	0.06
317	0.06
318	0.08
319	0.12
320	0.14
321	0.15
322	0.18
323	0.19
324	0.18
325	0.19
326	0.19
327	0.21
328	0.23
329	0.25
330	0.26
331	0.26
332	0.25
333	0.26
334	0.25
335	0.19
336	0.18
337	0.15
338	0.11
339	0.1
340	0.1
341	0.09
342	0.09
343	0.1
344	0.09
345	0.11
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.13
350	0.14
351	0.17
352	0.17
353	0.2
354	0.26
355	0.29
356	0.33
357	0.32
358	0.31
359	0.28
360	0.33
361	0.3
362	0.26
363	0.25
364	0.22
365	0.22
366	0.2
367	0.2
368	0.14
369	0.12
370	0.11
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.1
377	0.1
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.1
384	0.08
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.13
389	0.15
390	0.16
391	0.16
392	0.18
393	0.19
394	0.18
395	0.19
396	0.2
397	0.25
398	0.28
399	0.36
400	0.4
401	0.47
402	0.5
403	0.52
404	0.53
405	0.49
406	0.52
407	0.48
408	0.42
409	0.34
410	0.31
411	0.28
412	0.23
413	0.2
414	0.14
415	0.11
416	0.14
417	0.12
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.12
422	0.11
423	0.1
424	0.06
425	0.07
426	0.08
427	0.09
428	0.1
429	0.11
430	0.11
431	0.1
432	0.11
433	0.15
434	0.15
435	0.21
436	0.21
437	0.2
438	0.21
439	0.22
440	0.21
441	0.18
442	0.18
443	0.12
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.1
448	0.1
449	0.08
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.05
455	0.05
456	0.04
457	0.05
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.05
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.06
467	0.05
468	0.06
469	0.05
470	0.06
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.09
478	0.09
479	0.1
480	0.09
481	0.08
482	0.1
483	0.13
484	0.15
485	0.13
486	0.13
487	0.11
488	0.14
489	0.15
490	0.13
491	0.14
492	0.12
493	0.13
494	0.18
495	0.23
496	0.26
497	0.25
498	0.27
499	0.25
500	0.26
501	0.28
502	0.25
503	0.19
504	0.14
505	0.14
506	0.14
507	0.18
508	0.17
509	0.15
510	0.16
511	0.17
512	0.16
513	0.17
514	0.15
515	0.11
516	0.13
517	0.13
518	0.12
519	0.11
520	0.11
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.08
525	0.07
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.06
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.09
536	0.15
537	0.21
538	0.23
539	0.26
540	0.32
541	0.38
542	0.42
543	0.48
544	0.53
545	0.57
546	0.64
547	0.7
548	0.69
549	0.65
550	0.66
551	0.66
552	0.62
553	0.54
554	0.46
555	0.39
556	0.35
557	0.34
558	0.3
559	0.22
560	0.23
561	0.2
562	0.19
563	0.17
564	0.16
565	0.13
566	0.12
567	0.1
568	0.04
569	0.03
570	0.03
571	0.02
572	0.03
573	0.02
574	0.02
575	0.03
576	0.02
577	0.02
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.05
588	0.05
589	0.06
590	0.05
591	0.07
592	0.07
593	0.08
594	0.09
595	0.08
596	0.08
597	0.09
598	0.09
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.05
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.05
610	0.05
611	0.06
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.08
617	0.08
618	0.09
619	0.09
620	0.08
621	0.08
622	0.11
623	0.15
624	0.15
625	0.14
626	0.15
627	0.2
628	0.28
629	0.32
630	0.31
631	0.29
632	0.29
633	0.29
634	0.27
635	0.25
636	0.17
637	0.14
638	0.17
639	0.16
640	0.18
641	0.19
642	0.19
643	0.16
644	0.18
645	0.17
646	0.13
647	0.13
648	0.11
649	0.1
650	0.1
651	0.1
652	0.09
653	0.1
654	0.1
655	0.09
656	0.08
657	0.07
658	0.07
659	0.07
660	0.07
661	0.07
662	0.11
663	0.11
664	0.11
665	0.1
666	0.1
667	0.09
668	0.09
669	0.08
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.05
678	0.05
679	0.06
680	0.1
681	0.1
682	0.11
683	0.1
684	0.11
685	0.12
686	0.13
687	0.12
688	0.08
689	0.09
690	0.1
691	0.11
692	0.1
693	0.09
694	0.07
695	0.07
696	0.07
697	0.06
698	0.06
699	0.05
700	0.05
701	0.06
702	0.07
703	0.07
704	0.08
705	0.08
706	0.07
707	0.08
708	0.08
709	0.08
710	0.08
711	0.07
712	0.09
713	0.1
714	0.09
715	0.09
716	0.1
717	0.1
718	0.09
719	0.1
720	0.09
721	0.07
722	0.08
723	0.09
724	0.08
725	0.13
726	0.14
727	0.14
728	0.15
729	0.2
730	0.26
731	0.28
732	0.31
733	0.35
734	0.4
735	0.47
736	0.52
737	0.54
738	0.54
739	0.54
740	0.5
741	0.44
742	0.41
743	0.34
744	0.28
745	0.21
746	0.14
747	0.13
748	0.12
749	0.1
750	0.07
751	0.08
752	0.07
753	0.08
754	0.09
755	0.13
756	0.15
757	0.18
758	0.26
759	0.26
760	0.29
761	0.32
762	0.4
763	0.44
764	0.49
765	0.51
766	0.52
767	0.5
768	0.48
769	0.45
770	0.41
771	0.36
772	0.35
773	0.31
774	0.26
775	0.28
776	0.27
777	0.26
778	0.22
779	0.19
780	0.14
781	0.13
782	0.1
783	0.09
784	0.08
785	0.08
786	0.07
787	0.06
788	0.08
789	0.09
790	0.09
791	0.1
792	0.14
793	0.16
794	0.17
795	0.18
796	0.21
797	0.27
798	0.34
799	0.4
800	0.39
801	0.44
802	0.5
803	0.57
804	0.62
805	0.66
806	0.63
807	0.6
808	0.59
809	0.59
810	0.6
811	0.55
812	0.51
813	0.43
814	0.43
815	0.41
816	0.4
817	0.36
818	0.3
819	0.28
820	0.23
821	0.2
822	0.16
823	0.16
824	0.15
825	0.13
826	0.11
827	0.1
828	0.09
829	0.09
830	0.08
831	0.08
832	0.09
833	0.08
834	0.08
835	0.07
836	0.08
837	0.09
838	0.09
839	0.1
840	0.09
841	0.1
842	0.17
843	0.19
844	0.18
845	0.23
846	0.25
847	0.25
848	0.28
849	0.32
850	0.28
851	0.28
852	0.32
853	0.29
854	0.32
855	0.33
856	0.31
857	0.3
858	0.29
859	0.29
860	0.25
861	0.23
862	0.19
863	0.2
864	0.23
865	0.23
866	0.23
867	0.24
868	0.34
869	0.36
870	0.4
871	0.42
872	0.45
873	0.5
874	0.55
875	0.59
876	0.53
877	0.54
878	0.52
879	0.48
880	0.41
881	0.33
882	0.26
883	0.21
884	0.17
885	0.15
886	0.13
887	0.12
888	0.17
889	0.24
890	0.3
891	0.36
892	0.44
893	0.55
894	0.65
895	0.74
896	0.79
897	0.83
898	0.88
899	0.92
900	0.93
901	0.92
902	0.89
903	0.85
904	0.81
905	0.71
906	0.62
907	0.51
908	0.43
909	0.37
910	0.29
911	0.22
912	0.17
913	0.16
914	0.15
915	0.17
916	0.19
917	0.17
918	0.19
919	0.19
920	0.22
921	0.2
922	0.22
923	0.21
924	0.27
925	0.31
926	0.35
927	0.39
928	0.47
929	0.5
930	0.54
931	0.57
932	0.51
933	0.52
934	0.57
935	0.62
936	0.59
937	0.62
938	0.62
939	0.63
940	0.63
941	0.62
942	0.55
943	0.51
944	0.47
945	0.4
946	0.39
947	0.34
948	0.3
949	0.25
950	0.22
951	0.17
952	0.15
953	0.16
954	0.13
955	0.15
956	0.16
957	0.17
958	0.17
959	0.17
960	0.23
961	0.23
962	0.29
963	0.29
964	0.34
965	0.39
966	0.42
967	0.47
968	0.49
969	0.57
970	0.61
971	0.69
972	0.74
973	0.77
974	0.82

Q0CCS6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer