FuNGI

Q0CAJ9

Protein Details

Accession

Q0CAJ9

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
135-155	MEPPKFKHKKIPRGPPSPPPP	Basic
302-323	AARERERMRRERRQENERQLRQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
138-154	PKFKHKKIPRGPPSPPP
310-311	RR

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 6, cyto 6, cyto_mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0000974 C:Prp19 complex GO:0060090 F:molecular adaptor activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MGRKGSSSTSNALTVQVDAEGKVKYDAIARRGHGEDRIVHASFKDLIPLRQRVDMGEVSLDRPSEEEVAAQMEKTKNALANLVEGAVAAQKPKNVKGGRRAEPTFVRYTPANQMGDTTRKNDRIMKIVERQQDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPIMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVRLRAQMQQKLAEKEKAQKEEHLRQLAQKAREERMAGSSRRMSRSVSRSRSRSRSVSRSPYSSRSGTPSEDEQAARERERMRRERRQENERQLRQSRMGTERRIKTMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSSESMWDSRLFNQTSGLDTGFNEDNPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQIDDDDEGGAEGEMSKIQKSSRFEVLGKAKEGFRGAADAEARDGPVQFEKDTTDPFGIDSMIADVTGGAGQKRYGIQEAERDERGSKRARVDDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.19
3	0.17
4	0.14
5	0.13
6	0.15
7	0.13
8	0.13
9	0.14
10	0.14
11	0.12
12	0.19
13	0.24
14	0.27
15	0.32
16	0.33
17	0.38
18	0.4
19	0.42
20	0.38
21	0.37
22	0.35
23	0.36
24	0.4
25	0.35
26	0.33
27	0.3
28	0.3
29	0.28
30	0.24
31	0.25
32	0.22
33	0.27
34	0.34
35	0.4
36	0.39
37	0.41
38	0.41
39	0.35
40	0.38
41	0.33
42	0.27
43	0.25
44	0.24
45	0.21
46	0.22
47	0.2
48	0.15
49	0.15
50	0.15
51	0.13
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.14
56	0.15
57	0.14
58	0.17
59	0.17
60	0.18
61	0.19
62	0.2
63	0.19
64	0.2
65	0.23
66	0.18
67	0.19
68	0.18
69	0.17
70	0.14
71	0.12
72	0.11
73	0.1
74	0.1
75	0.09
76	0.1
77	0.13
78	0.16
79	0.19
80	0.28
81	0.32
82	0.38
83	0.47
84	0.55
85	0.61
86	0.66
87	0.65
88	0.62
89	0.62
90	0.61
91	0.56
92	0.47
93	0.41
94	0.34
95	0.35
96	0.36
97	0.37
98	0.33
99	0.27
100	0.29
101	0.31
102	0.36
103	0.35
104	0.31
105	0.32
106	0.34
107	0.37
108	0.41
109	0.4
110	0.41
111	0.44
112	0.47
113	0.48
114	0.52
115	0.57
116	0.52
117	0.51
118	0.46
119	0.45
120	0.41
121	0.42
122	0.42
123	0.36
124	0.36
125	0.45
126	0.51
127	0.49
128	0.56
129	0.57
130	0.62
131	0.7
132	0.79
133	0.78
134	0.79
135	0.82
136	0.81
137	0.79
138	0.75
139	0.69
140	0.6
141	0.56
142	0.54
143	0.54
144	0.54
145	0.55
146	0.53
147	0.54
148	0.56
149	0.51
150	0.48
151	0.48
152	0.47
153	0.45
154	0.41
155	0.39
156	0.37
157	0.37
158	0.35
159	0.32
160	0.25
161	0.19
162	0.21
163	0.22
164	0.3
165	0.33
166	0.42
167	0.46
168	0.51
169	0.56
170	0.53
171	0.54
172	0.46
173	0.46
174	0.42
175	0.45
176	0.42
177	0.42
178	0.44
179	0.39
180	0.37
181	0.36
182	0.32
183	0.23
184	0.2
185	0.17
186	0.17
187	0.17
188	0.16
189	0.13
190	0.14
191	0.14
192	0.17
193	0.15
194	0.14
195	0.13
196	0.14
197	0.14
198	0.12
199	0.13
200	0.07
201	0.06
202	0.07
203	0.07
204	0.08
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.12
212	0.12
213	0.15
214	0.21
215	0.24
216	0.26
217	0.28
218	0.27
219	0.33
220	0.38
221	0.38
222	0.34
223	0.36
224	0.35
225	0.37
226	0.39
227	0.35
228	0.31
229	0.36
230	0.4
231	0.4
232	0.37
233	0.38
234	0.43
235	0.47
236	0.52
237	0.47
238	0.42
239	0.39
240	0.45
241	0.44
242	0.4
243	0.36
244	0.34
245	0.31
246	0.33
247	0.32
248	0.26
249	0.27
250	0.29
251	0.25
252	0.26
253	0.29
254	0.31
255	0.32
256	0.33
257	0.29
258	0.3
259	0.39
260	0.45
261	0.48
262	0.5
263	0.55
264	0.61
265	0.65
266	0.64
267	0.63
268	0.6
269	0.61
270	0.62
271	0.65
272	0.6
273	0.59
274	0.58
275	0.55
276	0.52
277	0.45
278	0.39
279	0.34
280	0.34
281	0.29
282	0.28
283	0.25
284	0.23
285	0.23
286	0.22
287	0.18
288	0.21
289	0.22
290	0.21
291	0.23
292	0.25
293	0.29
294	0.38
295	0.47
296	0.51
297	0.59
298	0.66
299	0.72
300	0.76
301	0.8
302	0.8
303	0.82
304	0.84
305	0.79
306	0.79
307	0.73
308	0.69
309	0.63
310	0.56
311	0.51
312	0.48
313	0.48
314	0.47
315	0.52
316	0.52
317	0.52
318	0.52
319	0.46
320	0.44
321	0.48
322	0.5
323	0.49
324	0.51
325	0.49
326	0.54
327	0.56
328	0.52
329	0.43
330	0.36
331	0.29
332	0.23
333	0.21
334	0.15
335	0.13
336	0.11
337	0.13
338	0.12
339	0.12
340	0.12
341	0.13
342	0.12
343	0.14
344	0.14
345	0.16
346	0.21
347	0.22
348	0.23
349	0.25
350	0.25
351	0.27
352	0.33
353	0.3
354	0.24
355	0.25
356	0.24
357	0.24
358	0.24
359	0.21
360	0.15
361	0.14
362	0.17
363	0.15
364	0.14
365	0.13
366	0.12
367	0.13
368	0.14
369	0.18
370	0.15
371	0.14
372	0.15
373	0.17
374	0.19
375	0.17
376	0.2
377	0.16
378	0.19
379	0.2
380	0.2
381	0.18
382	0.16
383	0.17
384	0.17
385	0.19
386	0.17
387	0.18
388	0.2
389	0.21
390	0.26
391	0.31
392	0.31
393	0.3
394	0.29
395	0.26
396	0.23
397	0.21
398	0.16
399	0.1
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.07
404	0.08
405	0.09
406	0.12
407	0.18
408	0.22
409	0.27
410	0.32
411	0.36
412	0.36
413	0.44
414	0.51
415	0.5
416	0.48
417	0.46
418	0.39
419	0.38
420	0.39
421	0.31
422	0.23
423	0.2
424	0.18
425	0.2
426	0.2
427	0.17
428	0.18
429	0.18
430	0.18
431	0.16
432	0.16
433	0.13
434	0.17
435	0.19
436	0.17
437	0.18
438	0.2
439	0.22
440	0.24
441	0.26
442	0.22
443	0.2
444	0.2
445	0.2
446	0.17
447	0.14
448	0.12
449	0.1
450	0.08
451	0.08
452	0.07
453	0.06
454	0.06
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.08
459	0.09
460	0.12
461	0.14
462	0.17
463	0.19
464	0.22
465	0.24
466	0.32
467	0.38
468	0.41
469	0.41
470	0.4
471	0.39
472	0.4
473	0.43
474	0.43
475	0.43
476	0.46

Q0CAJ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer