Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0D044

Protein Details
Accession Q0D044    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-56LLDLRKVRDKRPPFKRTQGGEAHydrophilic
401-420LCTYDKVARVKNKWKCTLKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-49KRPPFK
Subcellular Location(s) cysk 12, nucl 5, pero 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
CDD cd07976  TFIIA_alpha_beta_like  
Amino Acid Sequences MSNQQVGAVFERVIQEVCDASQVDFEESGVDQQTLLDLRKVRDKRPPFKRTQGGEAWKGTKGDTGHKAGSWQKKLSSLGVAHFPWDPPPPQPTPQQNQPQPQILPPSATVPSNAPRPTPSPHTQQPPQQQHHQQPPLHQQQQHHHQHNAPPHQPIPQSMASTVPPLQAPTAVGAPNPMGQAPHIKTEPGINGQSLPPNHMMPGNAPNPQSARERAANMLHQRYGAAAANSVSQLQAQSQAAMTMPGQQRPQNALPPMANGQHPQIKQEHGYASVPQPHMNNTQTDGAADDALSEWKAEVTRRREAAERQGGEADRTLREHLTQRMLQYEGGGLLVPLEERQSSSRVSSSVSRMPKAQVDGPGGDDDKDEDDEDAINSDLDDPDDLVAEDHDAEDAVGQVMLCTYDKVARVKNKWKCTLKDGILTTGGKEYVFHKGQGEFEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.13
4 0.13
5 0.14
6 0.13
7 0.12
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.15
16 0.13
17 0.12
18 0.1
19 0.1
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.17
24 0.19
25 0.22
26 0.32
27 0.37
28 0.4
29 0.48
30 0.58
31 0.64
32 0.71
33 0.78
34 0.77
35 0.83
36 0.87
37 0.82
38 0.79
39 0.78
40 0.75
41 0.72
42 0.69
43 0.61
44 0.54
45 0.49
46 0.42
47 0.36
48 0.3
49 0.32
50 0.32
51 0.35
52 0.34
53 0.34
54 0.38
55 0.43
56 0.5
57 0.49
58 0.46
59 0.43
60 0.46
61 0.48
62 0.45
63 0.43
64 0.35
65 0.31
66 0.34
67 0.31
68 0.28
69 0.27
70 0.25
71 0.21
72 0.23
73 0.22
74 0.2
75 0.25
76 0.28
77 0.31
78 0.39
79 0.45
80 0.49
81 0.57
82 0.64
83 0.65
84 0.69
85 0.7
86 0.67
87 0.59
88 0.55
89 0.52
90 0.42
91 0.37
92 0.3
93 0.29
94 0.24
95 0.23
96 0.21
97 0.18
98 0.21
99 0.26
100 0.26
101 0.24
102 0.25
103 0.28
104 0.32
105 0.36
106 0.37
107 0.39
108 0.44
109 0.51
110 0.54
111 0.59
112 0.64
113 0.66
114 0.67
115 0.68
116 0.69
117 0.69
118 0.74
119 0.74
120 0.66
121 0.62
122 0.67
123 0.68
124 0.67
125 0.62
126 0.57
127 0.58
128 0.66
129 0.69
130 0.64
131 0.58
132 0.55
133 0.57
134 0.6
135 0.6
136 0.52
137 0.46
138 0.42
139 0.44
140 0.41
141 0.37
142 0.34
143 0.28
144 0.26
145 0.23
146 0.23
147 0.19
148 0.2
149 0.19
150 0.15
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.14
168 0.15
169 0.18
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.19
174 0.2
175 0.17
176 0.17
177 0.14
178 0.15
179 0.15
180 0.19
181 0.16
182 0.17
183 0.15
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.12
189 0.18
190 0.18
191 0.19
192 0.19
193 0.2
194 0.2
195 0.22
196 0.23
197 0.19
198 0.21
199 0.2
200 0.21
201 0.22
202 0.23
203 0.25
204 0.26
205 0.27
206 0.23
207 0.21
208 0.2
209 0.18
210 0.18
211 0.14
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.12
231 0.14
232 0.16
233 0.18
234 0.19
235 0.21
236 0.26
237 0.28
238 0.26
239 0.26
240 0.26
241 0.24
242 0.24
243 0.25
244 0.21
245 0.2
246 0.16
247 0.18
248 0.21
249 0.21
250 0.22
251 0.22
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.23
256 0.19
257 0.2
258 0.19
259 0.2
260 0.24
261 0.24
262 0.23
263 0.22
264 0.23
265 0.27
266 0.27
267 0.24
268 0.21
269 0.22
270 0.2
271 0.19
272 0.17
273 0.13
274 0.11
275 0.1
276 0.07
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.1
285 0.18
286 0.22
287 0.29
288 0.31
289 0.33
290 0.36
291 0.39
292 0.46
293 0.48
294 0.44
295 0.39
296 0.41
297 0.39
298 0.36
299 0.34
300 0.26
301 0.18
302 0.19
303 0.19
304 0.16
305 0.18
306 0.22
307 0.24
308 0.28
309 0.29
310 0.29
311 0.3
312 0.3
313 0.27
314 0.23
315 0.2
316 0.13
317 0.11
318 0.1
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.07
327 0.09
328 0.11
329 0.13
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.18
334 0.21
335 0.25
336 0.3
337 0.33
338 0.33
339 0.34
340 0.36
341 0.37
342 0.36
343 0.35
344 0.33
345 0.32
346 0.31
347 0.31
348 0.31
349 0.28
350 0.24
351 0.2
352 0.16
353 0.15
354 0.15
355 0.14
356 0.11
357 0.11
358 0.12
359 0.12
360 0.11
361 0.1
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.12
392 0.16
393 0.22
394 0.3
395 0.38
396 0.47
397 0.57
398 0.65
399 0.71
400 0.78
401 0.82
402 0.79
403 0.77
404 0.78
405 0.73
406 0.72
407 0.64
408 0.58
409 0.55
410 0.5
411 0.44
412 0.37
413 0.32
414 0.23
415 0.22
416 0.2
417 0.24
418 0.26
419 0.26
420 0.26
421 0.28