Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0CA00

Protein Details
Accession Q0CA00    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MAVGKNKRLSKGKKGIKKRTVDPFSRKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-19KNKRLSKGKKGIKKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027500  Ribosomal_S1/3_euk  
IPR001593  Ribosomal_S3Ae  
IPR018281  Ribosomal_S3Ae_CS  
Gene Ontology GO:0022627  C:cytosolic small ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01015  Ribosomal_S3Ae  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01191  RIBOSOMAL_S3AE  
Amino Acid Sequences MAVGKNKRLSKGKKGIKKRTVDPFSRKDEYSVKAPSTFQIRDVGKTLVNRTSGLKNANDSLKGRIFEVSLADLQNDEDHAFRKVKLRVDEIQGKNCLTNFHGLDFTTDKLRSLVRKWQSLIEANVTVKTTDDYLLRLFAIAFTKRRPNQIKKTTYARSSQIRAIRKKMTEIMQREAASCSLAQLTTKLIPEVIGREIEKATQGIYPLQNVHIRKVKLLKSPKFDLGALLNLHGESTTDDKGHKVEREFKEQVLESV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.88
3 0.87
4 0.87
5 0.85
6 0.85
7 0.84
8 0.83
9 0.82
10 0.78
11 0.77
12 0.74
13 0.66
14 0.6
15 0.57
16 0.51
17 0.49
18 0.46
19 0.4
20 0.38
21 0.38
22 0.36
23 0.38
24 0.34
25 0.29
26 0.32
27 0.31
28 0.31
29 0.33
30 0.32
31 0.27
32 0.3
33 0.32
34 0.28
35 0.28
36 0.27
37 0.27
38 0.29
39 0.3
40 0.31
41 0.29
42 0.27
43 0.3
44 0.31
45 0.31
46 0.29
47 0.3
48 0.31
49 0.29
50 0.27
51 0.24
52 0.21
53 0.19
54 0.19
55 0.15
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.08
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.2
70 0.23
71 0.29
72 0.32
73 0.36
74 0.36
75 0.42
76 0.51
77 0.47
78 0.48
79 0.44
80 0.41
81 0.37
82 0.33
83 0.28
84 0.19
85 0.21
86 0.16
87 0.15
88 0.16
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.14
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.15
98 0.16
99 0.17
100 0.25
101 0.26
102 0.3
103 0.31
104 0.32
105 0.33
106 0.33
107 0.31
108 0.25
109 0.22
110 0.19
111 0.18
112 0.16
113 0.13
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.09
127 0.1
128 0.12
129 0.14
130 0.22
131 0.24
132 0.33
133 0.41
134 0.47
135 0.56
136 0.65
137 0.68
138 0.65
139 0.71
140 0.68
141 0.62
142 0.57
143 0.52
144 0.47
145 0.44
146 0.44
147 0.43
148 0.46
149 0.47
150 0.49
151 0.5
152 0.46
153 0.46
154 0.45
155 0.46
156 0.46
157 0.46
158 0.44
159 0.44
160 0.43
161 0.41
162 0.37
163 0.3
164 0.22
165 0.18
166 0.14
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.13
187 0.12
188 0.1
189 0.11
190 0.14
191 0.15
192 0.16
193 0.16
194 0.2
195 0.25
196 0.25
197 0.3
198 0.33
199 0.33
200 0.36
201 0.43
202 0.45
203 0.49
204 0.58
205 0.6
206 0.6
207 0.65
208 0.65
209 0.6
210 0.54
211 0.48
212 0.4
213 0.37
214 0.3
215 0.25
216 0.21
217 0.18
218 0.17
219 0.14
220 0.12
221 0.09
222 0.12
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.17
227 0.21
228 0.27
229 0.3
230 0.32
231 0.4
232 0.45
233 0.54
234 0.55
235 0.53
236 0.54