Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UPX7

Protein Details
Accession Q0UPX7    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-33AETATPRRSTRRGRASQQDEDVHydrophilic
53-75TDEDERPVKKRKTARSQTSSSPVHydrophilic
185-209DAEPAPKRRIRRRAITSVDKKKRLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-12GRLRKAA
17-22PRRSTR
189-207APKRRIRRRAITSVDKKKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000111  C:nucleotide-excision repair factor 2 complex  
GO:0071942  C:XPC complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG pno:SNOG_06187  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MARARGRLRKAAETATPRRSTRRGRASQQDEDVPAIFQEMLLEEEAAAKATSTDEDERPVKKRKTARSQTSSSPVVKPSHVKATVVKGTEPAPSIRSRKDASLEPETPLYSLTHPPATAGSMPPDVAPSSGRILQTVIDSDESDDSDEEWEDALADGDEADEHEETESVIPQVAGISITLGANKDAEPAPKRRIRRRAITSVDKKKRLDIHKMHVLCLLYHVYRRNAWCNDLRVQSALRKLVPPKTLQNLVPNPDLTQYSASKRFIDGMNELKVLWNKRFKLTAQGMYKPKWAEADAHVRPFSDFDELDDPMDKDDFRRTAHTLQGSQDVGTQLFCALLRAIGVEARLVCSLQPLPFASSAQPSTPQKTTSQKNTIVLDPYNKQEAASSSKSRAVTPSRPRKLSRMERVMGERHAVLNKTGVALQRQKAYHTPYPVYWVEVFNTAHQKWVAIDTHSTFTVNSPEKLEPPLSHAQNSLTYAIAYEEDYTAKDVTRRYAKAYNAKTRKFRIECTPNGAEWWRKAMKFFKRMVPLDRDQVEDAALARKEASEGIPKNVQDFKNHPVYVLERHLKHNEVIHPMDPIGKINVGTGMNPKMESIYRRNNVHTVRSADKWYRMGQDVKDGEQPLKHAKPKRGRQMSVNLDMDVDDQQEEIGAGLYAKFQTRLYVPPPVVKGRVPRNVYGNLDLYVPSMCPPGGTHIRHKIASKAARIVGVDYADAVTGFSFKGRHGTAIVQGVVVASEYAEAVQEVIDGMIYQQEEAANAARSRESLRLWRRFFLGLRIAQRVNAMEIDGEKGPSMDVDVQQEIDREDEQMVEGEMAGGFFPDEADFAQPPRVERAYEPPQQEYGGGGFMADDDEDEGGGFIPERDDDDDAVKAPISMNREHSFESSILDSHQLRPRRRSSFADDFVLEEEEDEEGSAGSTRDQSDAEPANDDENAETHIAQDEAAVDGGGGFLPEDADADVNMVDQPPQEASPVPRDPGTEDAEMPPESSPSDTGSLPLEDPEDEDADPDWLVDAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.65
3 0.67
4 0.62
5 0.65
6 0.68
7 0.7
8 0.71
9 0.73
10 0.73
11 0.76
12 0.84
13 0.84
14 0.83
15 0.79
16 0.73
17 0.64
18 0.57
19 0.48
20 0.38
21 0.29
22 0.23
23 0.17
24 0.11
25 0.1
26 0.08
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.1
39 0.13
40 0.17
41 0.17
42 0.24
43 0.29
44 0.33
45 0.4
46 0.49
47 0.5
48 0.54
49 0.62
50 0.66
51 0.73
52 0.79
53 0.83
54 0.82
55 0.82
56 0.81
57 0.79
58 0.75
59 0.67
60 0.6
61 0.54
62 0.49
63 0.48
64 0.46
65 0.43
66 0.47
67 0.45
68 0.43
69 0.42
70 0.48
71 0.49
72 0.46
73 0.41
74 0.33
75 0.33
76 0.35
77 0.32
78 0.25
79 0.22
80 0.28
81 0.33
82 0.35
83 0.4
84 0.39
85 0.41
86 0.44
87 0.47
88 0.47
89 0.51
90 0.48
91 0.44
92 0.44
93 0.4
94 0.35
95 0.29
96 0.24
97 0.18
98 0.21
99 0.22
100 0.22
101 0.21
102 0.22
103 0.22
104 0.23
105 0.22
106 0.19
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.18
111 0.18
112 0.16
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.15
117 0.19
118 0.19
119 0.18
120 0.18
121 0.18
122 0.19
123 0.18
124 0.16
125 0.13
126 0.13
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.14
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.11
172 0.12
173 0.18
174 0.22
175 0.28
176 0.36
177 0.42
178 0.51
179 0.58
180 0.66
181 0.69
182 0.74
183 0.78
184 0.79
185 0.81
186 0.84
187 0.84
188 0.85
189 0.86
190 0.83
191 0.75
192 0.72
193 0.72
194 0.68
195 0.68
196 0.65
197 0.64
198 0.67
199 0.67
200 0.61
201 0.56
202 0.49
203 0.38
204 0.32
205 0.27
206 0.19
207 0.22
208 0.25
209 0.24
210 0.28
211 0.33
212 0.38
213 0.37
214 0.41
215 0.43
216 0.43
217 0.47
218 0.45
219 0.42
220 0.36
221 0.36
222 0.35
223 0.35
224 0.33
225 0.29
226 0.3
227 0.34
228 0.38
229 0.4
230 0.4
231 0.41
232 0.43
233 0.47
234 0.44
235 0.49
236 0.47
237 0.47
238 0.46
239 0.4
240 0.35
241 0.32
242 0.3
243 0.22
244 0.21
245 0.2
246 0.22
247 0.28
248 0.29
249 0.28
250 0.27
251 0.29
252 0.27
253 0.28
254 0.26
255 0.25
256 0.26
257 0.26
258 0.25
259 0.25
260 0.28
261 0.28
262 0.3
263 0.33
264 0.32
265 0.35
266 0.39
267 0.37
268 0.42
269 0.45
270 0.47
271 0.45
272 0.51
273 0.52
274 0.51
275 0.54
276 0.45
277 0.39
278 0.33
279 0.28
280 0.24
281 0.24
282 0.32
283 0.31
284 0.34
285 0.33
286 0.32
287 0.31
288 0.28
289 0.24
290 0.18
291 0.15
292 0.13
293 0.16
294 0.16
295 0.17
296 0.18
297 0.17
298 0.14
299 0.15
300 0.12
301 0.1
302 0.15
303 0.17
304 0.17
305 0.21
306 0.24
307 0.27
308 0.32
309 0.34
310 0.31
311 0.3
312 0.33
313 0.3
314 0.26
315 0.24
316 0.2
317 0.16
318 0.14
319 0.12
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.12
341 0.11
342 0.13
343 0.14
344 0.15
345 0.13
346 0.15
347 0.15
348 0.14
349 0.19
350 0.19
351 0.23
352 0.24
353 0.25
354 0.27
355 0.33
356 0.39
357 0.42
358 0.47
359 0.47
360 0.49
361 0.5
362 0.47
363 0.42
364 0.37
365 0.33
366 0.27
367 0.26
368 0.24
369 0.22
370 0.2
371 0.18
372 0.19
373 0.21
374 0.24
375 0.24
376 0.24
377 0.29
378 0.29
379 0.28
380 0.31
381 0.31
382 0.35
383 0.43
384 0.52
385 0.55
386 0.59
387 0.61
388 0.62
389 0.66
390 0.67
391 0.66
392 0.63
393 0.58
394 0.56
395 0.58
396 0.54
397 0.45
398 0.36
399 0.27
400 0.21
401 0.21
402 0.18
403 0.15
404 0.13
405 0.12
406 0.11
407 0.13
408 0.12
409 0.15
410 0.19
411 0.21
412 0.25
413 0.25
414 0.26
415 0.28
416 0.34
417 0.33
418 0.33
419 0.32
420 0.27
421 0.32
422 0.31
423 0.29
424 0.24
425 0.2
426 0.17
427 0.19
428 0.19
429 0.16
430 0.22
431 0.19
432 0.2
433 0.19
434 0.19
435 0.15
436 0.18
437 0.17
438 0.12
439 0.13
440 0.13
441 0.15
442 0.15
443 0.14
444 0.11
445 0.11
446 0.16
447 0.16
448 0.15
449 0.17
450 0.18
451 0.19
452 0.2
453 0.21
454 0.15
455 0.19
456 0.25
457 0.23
458 0.23
459 0.22
460 0.22
461 0.22
462 0.23
463 0.17
464 0.11
465 0.1
466 0.09
467 0.09
468 0.08
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.09
478 0.09
479 0.13
480 0.19
481 0.2
482 0.23
483 0.28
484 0.33
485 0.39
486 0.46
487 0.52
488 0.53
489 0.57
490 0.59
491 0.57
492 0.62
493 0.55
494 0.51
495 0.51
496 0.51
497 0.48
498 0.5
499 0.47
500 0.38
501 0.37
502 0.36
503 0.28
504 0.21
505 0.25
506 0.2
507 0.19
508 0.22
509 0.28
510 0.34
511 0.4
512 0.43
513 0.43
514 0.48
515 0.5
516 0.52
517 0.5
518 0.44
519 0.42
520 0.4
521 0.36
522 0.28
523 0.26
524 0.22
525 0.15
526 0.13
527 0.11
528 0.1
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.13
536 0.14
537 0.17
538 0.2
539 0.2
540 0.23
541 0.28
542 0.27
543 0.24
544 0.26
545 0.28
546 0.33
547 0.33
548 0.3
549 0.26
550 0.27
551 0.27
552 0.3
553 0.31
554 0.25
555 0.29
556 0.31
557 0.31
558 0.3
559 0.31
560 0.28
561 0.28
562 0.27
563 0.24
564 0.22
565 0.21
566 0.22
567 0.18
568 0.15
569 0.11
570 0.09
571 0.09
572 0.09
573 0.11
574 0.09
575 0.1
576 0.12
577 0.13
578 0.13
579 0.13
580 0.13
581 0.11
582 0.13
583 0.16
584 0.2
585 0.27
586 0.32
587 0.34
588 0.36
589 0.41
590 0.42
591 0.42
592 0.4
593 0.35
594 0.34
595 0.33
596 0.36
597 0.32
598 0.33
599 0.32
600 0.3
601 0.28
602 0.29
603 0.3
604 0.26
605 0.32
606 0.3
607 0.29
608 0.3
609 0.28
610 0.26
611 0.23
612 0.25
613 0.23
614 0.28
615 0.32
616 0.35
617 0.43
618 0.52
619 0.6
620 0.69
621 0.71
622 0.68
623 0.67
624 0.71
625 0.68
626 0.66
627 0.58
628 0.47
629 0.38
630 0.36
631 0.31
632 0.21
633 0.15
634 0.07
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.05
639 0.04
640 0.04
641 0.03
642 0.03
643 0.03
644 0.04
645 0.05
646 0.06
647 0.07
648 0.07
649 0.09
650 0.1
651 0.14
652 0.16
653 0.22
654 0.23
655 0.26
656 0.29
657 0.3
658 0.3
659 0.29
660 0.34
661 0.36
662 0.43
663 0.42
664 0.41
665 0.43
666 0.46
667 0.45
668 0.41
669 0.34
670 0.27
671 0.24
672 0.21
673 0.17
674 0.13
675 0.11
676 0.08
677 0.08
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.13
682 0.21
683 0.23
684 0.29
685 0.37
686 0.41
687 0.43
688 0.44
689 0.41
690 0.42
691 0.45
692 0.42
693 0.38
694 0.36
695 0.35
696 0.34
697 0.31
698 0.24
699 0.18
700 0.15
701 0.1
702 0.09
703 0.07
704 0.07
705 0.06
706 0.04
707 0.04
708 0.04
709 0.05
710 0.06
711 0.06
712 0.11
713 0.12
714 0.13
715 0.14
716 0.16
717 0.18
718 0.21
719 0.21
720 0.16
721 0.16
722 0.14
723 0.12
724 0.11
725 0.07
726 0.03
727 0.03
728 0.03
729 0.03
730 0.03
731 0.03
732 0.03
733 0.03
734 0.03
735 0.03
736 0.03
737 0.03
738 0.03
739 0.03
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.06
744 0.06
745 0.06
746 0.08
747 0.09
748 0.1
749 0.11
750 0.12
751 0.11
752 0.12
753 0.15
754 0.17
755 0.18
756 0.25
757 0.35
758 0.44
759 0.46
760 0.48
761 0.48
762 0.48
763 0.46
764 0.43
765 0.41
766 0.37
767 0.38
768 0.41
769 0.38
770 0.35
771 0.36
772 0.3
773 0.24
774 0.19
775 0.15
776 0.11
777 0.11
778 0.13
779 0.12
780 0.11
781 0.09
782 0.09
783 0.09
784 0.08
785 0.1
786 0.09
787 0.11
788 0.14
789 0.14
790 0.15
791 0.16
792 0.17
793 0.15
794 0.14
795 0.13
796 0.11
797 0.11
798 0.1
799 0.1
800 0.09
801 0.09
802 0.07
803 0.07
804 0.06
805 0.06
806 0.05
807 0.05
808 0.04
809 0.04
810 0.03
811 0.04
812 0.04
813 0.04
814 0.05
815 0.08
816 0.09
817 0.1
818 0.15
819 0.16
820 0.17
821 0.22
822 0.23
823 0.22
824 0.24
825 0.32
826 0.35
827 0.41
828 0.43
829 0.4
830 0.4
831 0.39
832 0.37
833 0.29
834 0.22
835 0.16
836 0.12
837 0.09
838 0.07
839 0.07
840 0.07
841 0.06
842 0.05
843 0.05
844 0.05
845 0.05
846 0.05
847 0.05
848 0.05
849 0.05
850 0.05
851 0.05
852 0.05
853 0.06
854 0.08
855 0.1
856 0.11
857 0.13
858 0.14
859 0.15
860 0.15
861 0.16
862 0.14
863 0.12
864 0.12
865 0.14
866 0.15
867 0.18
868 0.23
869 0.25
870 0.28
871 0.29
872 0.3
873 0.3
874 0.26
875 0.26
876 0.2
877 0.19
878 0.17
879 0.2
880 0.2
881 0.24
882 0.31
883 0.36
884 0.41
885 0.5
886 0.58
887 0.6
888 0.64
889 0.64
890 0.66
891 0.68
892 0.66
893 0.63
894 0.54
895 0.49
896 0.44
897 0.39
898 0.29
899 0.19
900 0.15
901 0.1
902 0.1
903 0.09
904 0.07
905 0.05
906 0.06
907 0.07
908 0.06
909 0.07
910 0.1
911 0.11
912 0.12
913 0.13
914 0.13
915 0.2
916 0.24
917 0.24
918 0.25
919 0.24
920 0.25
921 0.24
922 0.24
923 0.18
924 0.13
925 0.14
926 0.12
927 0.11
928 0.1
929 0.12
930 0.11
931 0.1
932 0.1
933 0.08
934 0.08
935 0.09
936 0.08
937 0.06
938 0.06
939 0.06
940 0.05
941 0.05
942 0.03
943 0.03
944 0.04
945 0.04
946 0.05
947 0.05
948 0.06
949 0.06
950 0.07
951 0.07
952 0.07
953 0.08
954 0.07
955 0.08
956 0.08
957 0.09
958 0.11
959 0.11
960 0.12
961 0.15
962 0.19
963 0.27
964 0.3
965 0.31
966 0.3
967 0.31
968 0.33
969 0.35
970 0.36
971 0.3
972 0.28
973 0.28
974 0.3
975 0.29
976 0.27
977 0.22
978 0.18
979 0.17
980 0.16
981 0.15
982 0.15
983 0.17
984 0.16
985 0.17
986 0.19
987 0.2
988 0.18
989 0.18
990 0.17
991 0.14
992 0.16
993 0.17
994 0.17
995 0.15
996 0.15
997 0.15
998 0.14
999 0.14
1000 0.12