Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0C8J5

Protein Details
Accession Q0C8J5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-308AEFERREGEKKRRREAKFKTKLNDLKKRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
284-309RREGEKKRRREAKFKTKLNDLKKRTR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0000110  C:nucleotide-excision repair factor 1 complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:1901255  P:nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair  
GO:0000715  P:nucleotide-excision repair, DNA damage recognition  
GO:0070914  P:UV-damage excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MSADRRSTPPPSSVHGGPSRGALTPEQLKKIETNRLKAKAIREQREAEQSRANRSSNPVSTTGVKRSYNSMTASDTPATVRDATSAPRPLDAIKPARNFAKYVDYDFSKMTDTKGGFLTEEDDPFNKALHVRDGKSEQKPAHMTQKEWERQQLLTSLRQNRAGPFEPGLSVLDDKSQQKKCRECGNLEIDWKWEETLRCCVCNPCKEKYPEKYSLLTKTEAKEDYLLTDPELRDEELLPHLERPNPHKSTWNNMMLYLRYQVEEYAFSEKKWGSPEALDAEFERREGEKKRRREAKFKTKLNDLKKRTRVDAYRRSRQGVAGGNFGDDLGNGGRHVHQWGRSTENPDTGISVKKCVDCGMEVEELEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.46
3 0.45
4 0.39
5 0.39
6 0.35
7 0.3
8 0.3
9 0.23
10 0.24
11 0.31
12 0.35
13 0.37
14 0.36
15 0.37
16 0.4
17 0.45
18 0.5
19 0.47
20 0.52
21 0.56
22 0.61
23 0.64
24 0.63
25 0.64
26 0.64
27 0.67
28 0.66
29 0.63
30 0.62
31 0.62
32 0.68
33 0.64
34 0.57
35 0.55
36 0.5
37 0.53
38 0.53
39 0.5
40 0.42
41 0.44
42 0.49
43 0.45
44 0.46
45 0.39
46 0.37
47 0.42
48 0.43
49 0.43
50 0.42
51 0.39
52 0.36
53 0.39
54 0.4
55 0.39
56 0.36
57 0.32
58 0.3
59 0.31
60 0.33
61 0.29
62 0.25
63 0.21
64 0.2
65 0.2
66 0.16
67 0.14
68 0.12
69 0.13
70 0.15
71 0.2
72 0.25
73 0.23
74 0.23
75 0.24
76 0.23
77 0.26
78 0.31
79 0.32
80 0.34
81 0.36
82 0.39
83 0.42
84 0.42
85 0.38
86 0.34
87 0.36
88 0.3
89 0.31
90 0.32
91 0.29
92 0.29
93 0.29
94 0.27
95 0.21
96 0.2
97 0.18
98 0.19
99 0.17
100 0.18
101 0.19
102 0.18
103 0.16
104 0.16
105 0.18
106 0.13
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.18
117 0.22
118 0.22
119 0.26
120 0.31
121 0.37
122 0.39
123 0.44
124 0.36
125 0.38
126 0.41
127 0.39
128 0.44
129 0.39
130 0.37
131 0.37
132 0.46
133 0.45
134 0.43
135 0.43
136 0.35
137 0.33
138 0.33
139 0.33
140 0.26
141 0.27
142 0.32
143 0.35
144 0.35
145 0.39
146 0.38
147 0.35
148 0.37
149 0.33
150 0.28
151 0.23
152 0.21
153 0.18
154 0.18
155 0.16
156 0.12
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.11
161 0.13
162 0.2
163 0.26
164 0.31
165 0.38
166 0.43
167 0.46
168 0.53
169 0.54
170 0.49
171 0.5
172 0.49
173 0.45
174 0.42
175 0.37
176 0.29
177 0.26
178 0.23
179 0.17
180 0.14
181 0.12
182 0.12
183 0.21
184 0.21
185 0.21
186 0.22
187 0.27
188 0.3
189 0.37
190 0.39
191 0.35
192 0.41
193 0.46
194 0.53
195 0.56
196 0.58
197 0.57
198 0.56
199 0.56
200 0.52
201 0.53
202 0.48
203 0.42
204 0.37
205 0.32
206 0.33
207 0.29
208 0.26
209 0.21
210 0.19
211 0.19
212 0.18
213 0.17
214 0.13
215 0.16
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.14
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.14
225 0.13
226 0.14
227 0.16
228 0.18
229 0.2
230 0.24
231 0.32
232 0.33
233 0.34
234 0.38
235 0.39
236 0.45
237 0.51
238 0.52
239 0.43
240 0.41
241 0.43
242 0.36
243 0.35
244 0.29
245 0.21
246 0.15
247 0.15
248 0.13
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.22
256 0.21
257 0.23
258 0.25
259 0.25
260 0.19
261 0.19
262 0.23
263 0.23
264 0.23
265 0.22
266 0.19
267 0.21
268 0.19
269 0.19
270 0.17
271 0.14
272 0.18
273 0.26
274 0.36
275 0.41
276 0.5
277 0.61
278 0.69
279 0.75
280 0.81
281 0.84
282 0.84
283 0.86
284 0.85
285 0.8
286 0.81
287 0.82
288 0.82
289 0.82
290 0.78
291 0.79
292 0.79
293 0.78
294 0.73
295 0.74
296 0.73
297 0.73
298 0.75
299 0.74
300 0.76
301 0.75
302 0.74
303 0.67
304 0.59
305 0.56
306 0.54
307 0.47
308 0.41
309 0.37
310 0.33
311 0.31
312 0.29
313 0.22
314 0.12
315 0.12
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.1
320 0.11
321 0.13
322 0.17
323 0.2
324 0.24
325 0.29
326 0.33
327 0.39
328 0.43
329 0.48
330 0.48
331 0.48
332 0.45
333 0.4
334 0.39
335 0.33
336 0.37
337 0.31
338 0.33
339 0.32
340 0.32
341 0.32
342 0.32
343 0.32
344 0.25
345 0.27
346 0.26
347 0.25