Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XTG6

Protein Details
Accession F0XTG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-255ATCSVCHRKTCTRCKKPAHGNSACPTHydrophilic
270-289HWQRCPSCRRIIERNQGCNEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS00518  ZF_RING_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
Amino Acid Sequences MDLNPSDDTSTGVSLRLQLEELDSFQHSRTEDRPSDLSVAIDLYRDDVETRLQELRIDTDASARPSGQPNLVPGLSGMLQSLSYGELLRFEAENLPRLLRSLRMTATQLRADVDRPATDQAPNSTSCVSCTDDINVDAIPVSCGHRYCLGCLQRLFELATSDVSQFPPQCCGQAITLDSKTRTALGPEIINRYLEKKLESETPNRTYCHEPQCQTFIPPAAGNDEQLGVATCSVCHRKTCTRCKKPAHGNSACPTDRADEQVLTIAQEEHWQRCPSCRRIIERNQGCNEISKW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.17
4 0.15
5 0.14
6 0.16
7 0.16
8 0.16
9 0.15
10 0.16
11 0.16
12 0.16
13 0.19
14 0.17
15 0.2
16 0.22
17 0.29
18 0.3
19 0.33
20 0.35
21 0.34
22 0.37
23 0.33
24 0.3
25 0.22
26 0.21
27 0.16
28 0.14
29 0.11
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.12
36 0.13
37 0.16
38 0.17
39 0.17
40 0.18
41 0.19
42 0.2
43 0.19
44 0.19
45 0.16
46 0.19
47 0.22
48 0.23
49 0.22
50 0.2
51 0.21
52 0.24
53 0.26
54 0.24
55 0.22
56 0.21
57 0.25
58 0.24
59 0.21
60 0.16
61 0.16
62 0.14
63 0.13
64 0.11
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.05
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.13
79 0.13
80 0.17
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.17
85 0.17
86 0.15
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.19
91 0.21
92 0.24
93 0.28
94 0.25
95 0.23
96 0.21
97 0.2
98 0.19
99 0.19
100 0.16
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.1
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.22
136 0.23
137 0.25
138 0.26
139 0.26
140 0.21
141 0.22
142 0.21
143 0.14
144 0.13
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.13
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.17
164 0.19
165 0.18
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.15
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.14
174 0.16
175 0.2
176 0.19
177 0.2
178 0.19
179 0.2
180 0.2
181 0.18
182 0.18
183 0.15
184 0.17
185 0.24
186 0.27
187 0.3
188 0.35
189 0.4
190 0.42
191 0.41
192 0.42
193 0.41
194 0.45
195 0.47
196 0.47
197 0.43
198 0.43
199 0.48
200 0.46
201 0.41
202 0.36
203 0.29
204 0.25
205 0.23
206 0.2
207 0.2
208 0.19
209 0.18
210 0.16
211 0.15
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.11
220 0.16
221 0.17
222 0.19
223 0.25
224 0.35
225 0.45
226 0.56
227 0.63
228 0.69
229 0.77
230 0.84
231 0.88
232 0.89
233 0.89
234 0.88
235 0.84
236 0.81
237 0.77
238 0.76
239 0.66
240 0.56
241 0.47
242 0.4
243 0.35
244 0.32
245 0.29
246 0.2
247 0.2
248 0.23
249 0.22
250 0.19
251 0.19
252 0.14
253 0.12
254 0.18
255 0.2
256 0.2
257 0.27
258 0.3
259 0.3
260 0.38
261 0.47
262 0.48
263 0.55
264 0.59
265 0.61
266 0.68
267 0.77
268 0.79
269 0.8
270 0.82
271 0.77
272 0.73
273 0.66