Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XJ85

Protein Details
Accession F0XJ85    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-214DEKKKSSRSSSDRKRRRHDDDDBasic
244-269GSDSRHRRRSRSPARRRDRSGSRGRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
195-210KKKSSRSSSDRKRRRH
232-303SRRHRRRDDARDGSDSRHRRRSRSPARRRDRSGSRGRDYDRPSRREERDDRDGRDGRNERGRRSEWDGRNKT
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGSGDLNAKKSWHVVNLKNQQKVWESERAALAERKKVAERVEELRKERQEEEIARQLEEAGGRKRVDRVDWMYQGPSAENGGMVTEEAEAFLLGKRRIDALIRGDDHKKLEKNAAHDRFAGPSGGEGTSAGAGAGAASSMTAASTARDMLTKIREDPLLAIKRQEQEAYEAMVSDPIRRRQLLASMGLSTTADEKKKSSRSSSDRKRRRHDDDDDRHHHRSHRHRDNDDDESRRHRRRDDARDGSDSRHRRRSRSPARRRDRSGSRGRDYDRPSRREERDDRDGRDGRNERGRRSEWDGRNKTNARTGGRPSDRSNGRTNADDERARKLAAMQAAASELDQQREQRLAQREAQEAAARAADDKARARDERLGGEQSSFATSLRQQVGEMGLAERLGRGRKGLQRDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.52
3 0.62
4 0.68
5 0.69
6 0.67
7 0.63
8 0.6
9 0.58
10 0.53
11 0.52
12 0.47
13 0.45
14 0.47
15 0.43
16 0.42
17 0.42
18 0.41
19 0.39
20 0.39
21 0.39
22 0.39
23 0.41
24 0.41
25 0.42
26 0.43
27 0.44
28 0.52
29 0.55
30 0.56
31 0.61
32 0.62
33 0.59
34 0.55
35 0.53
36 0.51
37 0.48
38 0.51
39 0.5
40 0.47
41 0.43
42 0.41
43 0.35
44 0.29
45 0.27
46 0.26
47 0.21
48 0.25
49 0.26
50 0.27
51 0.32
52 0.33
53 0.33
54 0.36
55 0.39
56 0.42
57 0.45
58 0.45
59 0.41
60 0.39
61 0.37
62 0.29
63 0.23
64 0.16
65 0.12
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.07
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.18
86 0.21
87 0.22
88 0.28
89 0.3
90 0.33
91 0.34
92 0.35
93 0.37
94 0.39
95 0.36
96 0.32
97 0.38
98 0.37
99 0.42
100 0.5
101 0.51
102 0.47
103 0.46
104 0.44
105 0.38
106 0.36
107 0.29
108 0.18
109 0.13
110 0.13
111 0.11
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.04
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.02
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.02
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.1
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.18
141 0.18
142 0.17
143 0.19
144 0.24
145 0.25
146 0.24
147 0.24
148 0.26
149 0.28
150 0.29
151 0.27
152 0.19
153 0.18
154 0.19
155 0.19
156 0.15
157 0.13
158 0.12
159 0.14
160 0.13
161 0.14
162 0.17
163 0.19
164 0.22
165 0.22
166 0.24
167 0.22
168 0.27
169 0.25
170 0.23
171 0.2
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.15
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.13
182 0.19
183 0.25
184 0.27
185 0.29
186 0.35
187 0.42
188 0.52
189 0.62
190 0.66
191 0.7
192 0.76
193 0.81
194 0.81
195 0.82
196 0.79
197 0.78
198 0.78
199 0.79
200 0.8
201 0.77
202 0.75
203 0.68
204 0.62
205 0.57
206 0.54
207 0.54
208 0.56
209 0.59
210 0.61
211 0.61
212 0.66
213 0.67
214 0.67
215 0.62
216 0.55
217 0.47
218 0.48
219 0.53
220 0.53
221 0.5
222 0.45
223 0.49
224 0.55
225 0.63
226 0.66
227 0.66
228 0.64
229 0.68
230 0.66
231 0.6
232 0.58
233 0.56
234 0.51
235 0.52
236 0.51
237 0.5
238 0.58
239 0.65
240 0.68
241 0.72
242 0.77
243 0.78
244 0.86
245 0.89
246 0.87
247 0.85
248 0.83
249 0.81
250 0.8
251 0.78
252 0.73
253 0.7
254 0.67
255 0.66
256 0.62
257 0.63
258 0.62
259 0.57
260 0.59
261 0.61
262 0.62
263 0.64
264 0.66
265 0.64
266 0.65
267 0.68
268 0.64
269 0.65
270 0.64
271 0.56
272 0.58
273 0.54
274 0.49
275 0.53
276 0.53
277 0.47
278 0.51
279 0.53
280 0.48
281 0.53
282 0.57
283 0.56
284 0.63
285 0.67
286 0.63
287 0.7
288 0.68
289 0.62
290 0.59
291 0.57
292 0.5
293 0.49
294 0.5
295 0.51
296 0.53
297 0.55
298 0.51
299 0.55
300 0.56
301 0.54
302 0.56
303 0.51
304 0.47
305 0.46
306 0.45
307 0.42
308 0.42
309 0.43
310 0.38
311 0.39
312 0.38
313 0.35
314 0.33
315 0.28
316 0.27
317 0.25
318 0.24
319 0.18
320 0.17
321 0.17
322 0.17
323 0.16
324 0.16
325 0.14
326 0.16
327 0.17
328 0.18
329 0.2
330 0.23
331 0.24
332 0.26
333 0.33
334 0.35
335 0.39
336 0.44
337 0.44
338 0.43
339 0.44
340 0.39
341 0.32
342 0.29
343 0.23
344 0.18
345 0.16
346 0.17
347 0.16
348 0.18
349 0.22
350 0.26
351 0.3
352 0.32
353 0.35
354 0.4
355 0.42
356 0.44
357 0.43
358 0.43
359 0.38
360 0.37
361 0.34
362 0.28
363 0.26
364 0.21
365 0.16
366 0.15
367 0.16
368 0.23
369 0.25
370 0.24
371 0.22
372 0.24
373 0.26
374 0.24
375 0.23
376 0.16
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.12
381 0.14
382 0.17
383 0.17
384 0.19
385 0.27
386 0.34
387 0.44