Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XCA4

Protein Details
Accession F0XCA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22ASNNRFPPRPLNKKSVFDRQRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
721-737KKDKKAAADGASKKGGR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
Amino Acid Sequences MASNNRFPPRPLNKKSVFDRQRAEAEAKRQREAAETAAIYEDFVKSFDDGGSERDSASSSHDMPGKGGRLSGSAAGAVPSLLQPPALLGSGRRHFSMPTSGAAAMRNSGPGSLGPTTSSGSAAGAESAAVPSRRGPGGGRLAAFDDDSDEEDGLGSSTTTTTAAAAASASTVTAMGSIGSSSLVSTAADRAEERATSKPTIRLASLPPNMSPAAVRALVSPAGLVVEGVLMLPAATTASGSTERKSAAAIVTLAASSAASDIDAAVSALQNRYLGYGYYLNLHRHLSSAVAAATAAVSLSTLSTTSSASQPFGAKPVPPARLDGAEFTNHASRSTYGRGRIGIPPPAMFAPPASGNGSSSSVVSRDSLLYVPVRPPRDIRKLRMIHRVVEKVLSQGPAFEALLMSRPEVQREERWAWIWDARSEAGVWYRYRLWETVTGHQTKRGHGRYMPLFEGSHAWKIPDDPLPYEFVTGVAEFVSDSEYGNSSDDSDYDDGPRGRGMDATITTNGGGSGSAVGTGAAVAAAVDGDEDMFLNPIEKAKLAHLLARLPSTLSKLRKGDIARVTSFAIRHASRGSNEIVDMIISNIETPFTYTAANPAHHRADDGEGTSGASGEPGAVRDTSGAKLVGVYVVSDILSSSATSGIRHAWRYRQLFDTALRSRRVFEGLGLMAERLHWGRLRADKWKRSIGLVLDHWDGWSVFSAETQEYLVGSFENPPSAKKDKKAAADGASKKGGRWKTVDSAAARPVEESGFQPAAEAHRGDEDGDGNDANDGDEGDDDDDNGEGDDGAYRSEYTDDEELDLACLAEEDIDGEPMSDFDLDGIPLTADEIEALIGTDVAAMSEEGEIGSDDDAAGMSGLSDGGGGGGGDSDVEMEAGDGESCKENENDQGTVVVATAAAVAAKPSRKRMRAVDMFADADADDGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.8
3 0.81
4 0.78
5 0.75
6 0.73
7 0.69
8 0.67
9 0.62
10 0.61
11 0.56
12 0.58
13 0.6
14 0.58
15 0.55
16 0.51
17 0.48
18 0.47
19 0.43
20 0.37
21 0.34
22 0.3
23 0.28
24 0.28
25 0.26
26 0.22
27 0.2
28 0.17
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.15
38 0.19
39 0.18
40 0.17
41 0.17
42 0.18
43 0.15
44 0.2
45 0.22
46 0.19
47 0.23
48 0.27
49 0.27
50 0.28
51 0.34
52 0.31
53 0.27
54 0.27
55 0.23
56 0.21
57 0.22
58 0.22
59 0.17
60 0.14
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.1
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.2
77 0.26
78 0.28
79 0.28
80 0.28
81 0.28
82 0.31
83 0.36
84 0.3
85 0.26
86 0.27
87 0.27
88 0.27
89 0.28
90 0.25
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.14
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.11
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.1
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.15
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.23
124 0.31
125 0.34
126 0.32
127 0.3
128 0.31
129 0.31
130 0.29
131 0.21
132 0.15
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.08
141 0.07
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.18
182 0.22
183 0.24
184 0.27
185 0.29
186 0.32
187 0.33
188 0.32
189 0.31
190 0.32
191 0.38
192 0.4
193 0.37
194 0.33
195 0.34
196 0.32
197 0.29
198 0.24
199 0.16
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.11
204 0.13
205 0.14
206 0.13
207 0.11
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.03
224 0.03
225 0.05
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.14
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.07
242 0.06
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.15
266 0.18
267 0.19
268 0.2
269 0.21
270 0.19
271 0.18
272 0.18
273 0.14
274 0.12
275 0.12
276 0.1
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.16
300 0.16
301 0.14
302 0.19
303 0.25
304 0.26
305 0.25
306 0.27
307 0.26
308 0.27
309 0.28
310 0.24
311 0.19
312 0.17
313 0.16
314 0.16
315 0.18
316 0.16
317 0.15
318 0.14
319 0.14
320 0.17
321 0.22
322 0.24
323 0.23
324 0.25
325 0.26
326 0.27
327 0.31
328 0.31
329 0.3
330 0.28
331 0.25
332 0.25
333 0.24
334 0.21
335 0.16
336 0.13
337 0.1
338 0.09
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.11
343 0.12
344 0.14
345 0.12
346 0.12
347 0.1
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.14
359 0.19
360 0.21
361 0.21
362 0.24
363 0.31
364 0.4
365 0.45
366 0.46
367 0.51
368 0.55
369 0.6
370 0.66
371 0.6
372 0.55
373 0.55
374 0.53
375 0.43
376 0.39
377 0.33
378 0.25
379 0.25
380 0.21
381 0.15
382 0.12
383 0.12
384 0.11
385 0.11
386 0.08
387 0.06
388 0.05
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.11
393 0.11
394 0.13
395 0.15
396 0.17
397 0.17
398 0.23
399 0.25
400 0.23
401 0.25
402 0.25
403 0.24
404 0.24
405 0.23
406 0.17
407 0.16
408 0.15
409 0.14
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.13
414 0.12
415 0.12
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.15
420 0.14
421 0.17
422 0.2
423 0.25
424 0.3
425 0.33
426 0.32
427 0.37
428 0.36
429 0.33
430 0.39
431 0.35
432 0.32
433 0.3
434 0.36
435 0.35
436 0.37
437 0.34
438 0.27
439 0.24
440 0.22
441 0.23
442 0.19
443 0.17
444 0.13
445 0.13
446 0.11
447 0.12
448 0.14
449 0.16
450 0.15
451 0.14
452 0.15
453 0.18
454 0.18
455 0.17
456 0.15
457 0.1
458 0.1
459 0.08
460 0.08
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.05
466 0.04
467 0.04
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.1
480 0.13
481 0.12
482 0.12
483 0.13
484 0.11
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.11
491 0.11
492 0.1
493 0.1
494 0.1
495 0.09
496 0.06
497 0.05
498 0.04
499 0.04
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.02
508 0.02
509 0.02
510 0.02
511 0.02
512 0.02
513 0.02
514 0.02
515 0.02
516 0.02
517 0.02
518 0.02
519 0.03
520 0.03
521 0.04
522 0.04
523 0.05
524 0.06
525 0.06
526 0.07
527 0.08
528 0.13
529 0.12
530 0.15
531 0.16
532 0.17
533 0.18
534 0.18
535 0.17
536 0.13
537 0.14
538 0.15
539 0.2
540 0.2
541 0.25
542 0.25
543 0.26
544 0.3
545 0.31
546 0.35
547 0.35
548 0.37
549 0.32
550 0.32
551 0.33
552 0.3
553 0.28
554 0.22
555 0.21
556 0.16
557 0.16
558 0.17
559 0.18
560 0.17
561 0.2
562 0.2
563 0.15
564 0.15
565 0.14
566 0.11
567 0.09
568 0.08
569 0.06
570 0.05
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.05
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.07
581 0.12
582 0.15
583 0.16
584 0.17
585 0.2
586 0.22
587 0.21
588 0.22
589 0.18
590 0.18
591 0.18
592 0.17
593 0.14
594 0.12
595 0.12
596 0.11
597 0.1
598 0.07
599 0.05
600 0.04
601 0.04
602 0.04
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.07
608 0.09
609 0.09
610 0.11
611 0.1
612 0.09
613 0.09
614 0.09
615 0.08
616 0.07
617 0.06
618 0.05
619 0.05
620 0.05
621 0.05
622 0.05
623 0.04
624 0.05
625 0.04
626 0.04
627 0.06
628 0.07
629 0.07
630 0.08
631 0.13
632 0.15
633 0.19
634 0.22
635 0.26
636 0.34
637 0.38
638 0.4
639 0.39
640 0.38
641 0.37
642 0.38
643 0.4
644 0.38
645 0.39
646 0.39
647 0.36
648 0.36
649 0.35
650 0.35
651 0.26
652 0.2
653 0.2
654 0.17
655 0.17
656 0.16
657 0.14
658 0.11
659 0.11
660 0.12
661 0.07
662 0.09
663 0.09
664 0.11
665 0.16
666 0.23
667 0.27
668 0.36
669 0.45
670 0.5
671 0.54
672 0.6
673 0.56
674 0.51
675 0.52
676 0.44
677 0.41
678 0.36
679 0.34
680 0.28
681 0.27
682 0.25
683 0.21
684 0.18
685 0.13
686 0.12
687 0.09
688 0.08
689 0.09
690 0.1
691 0.1
692 0.1
693 0.1
694 0.09
695 0.08
696 0.08
697 0.08
698 0.06
699 0.07
700 0.09
701 0.09
702 0.13
703 0.13
704 0.14
705 0.2
706 0.28
707 0.32
708 0.34
709 0.42
710 0.45
711 0.51
712 0.56
713 0.55
714 0.54
715 0.58
716 0.58
717 0.54
718 0.53
719 0.47
720 0.42
721 0.45
722 0.42
723 0.36
724 0.37
725 0.37
726 0.38
727 0.42
728 0.47
729 0.42
730 0.42
731 0.43
732 0.4
733 0.35
734 0.28
735 0.25
736 0.2
737 0.18
738 0.15
739 0.16
740 0.15
741 0.15
742 0.15
743 0.15
744 0.17
745 0.19
746 0.18
747 0.13
748 0.15
749 0.15
750 0.15
751 0.16
752 0.14
753 0.12
754 0.13
755 0.12
756 0.1
757 0.1
758 0.1
759 0.09
760 0.07
761 0.06
762 0.05
763 0.06
764 0.06
765 0.08
766 0.08
767 0.07
768 0.08
769 0.07
770 0.07
771 0.07
772 0.06
773 0.04
774 0.05
775 0.07
776 0.07
777 0.07
778 0.08
779 0.08
780 0.08
781 0.1
782 0.1
783 0.12
784 0.14
785 0.14
786 0.15
787 0.16
788 0.15
789 0.14
790 0.14
791 0.1
792 0.07
793 0.07
794 0.05
795 0.05
796 0.04
797 0.05
798 0.06
799 0.07
800 0.07
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.08
805 0.07
806 0.06
807 0.06
808 0.07
809 0.07
810 0.07
811 0.07
812 0.06
813 0.06
814 0.07
815 0.06
816 0.05
817 0.05
818 0.05
819 0.04
820 0.04
821 0.05
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.04
826 0.04
827 0.04
828 0.04
829 0.04
830 0.05
831 0.05
832 0.05
833 0.05
834 0.05
835 0.06
836 0.06
837 0.06
838 0.05
839 0.05
840 0.05
841 0.05
842 0.05
843 0.05
844 0.04
845 0.04
846 0.04
847 0.04
848 0.04
849 0.04
850 0.03
851 0.03
852 0.04
853 0.03
854 0.03
855 0.03
856 0.03
857 0.03
858 0.03
859 0.04
860 0.04
861 0.04
862 0.04
863 0.04
864 0.05
865 0.05
866 0.06
867 0.05
868 0.07
869 0.1
870 0.11
871 0.13
872 0.14
873 0.15
874 0.22
875 0.26
876 0.25
877 0.22
878 0.22
879 0.21
880 0.2
881 0.18
882 0.11
883 0.07
884 0.06
885 0.06
886 0.05
887 0.04
888 0.04
889 0.06
890 0.1
891 0.17
892 0.21
893 0.32
894 0.42
895 0.46
896 0.53
897 0.6
898 0.66
899 0.69
900 0.72
901 0.68
902 0.62
903 0.59
904 0.52
905 0.44
906 0.33