Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0X867

Protein Details
Accession F0X867    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-199EREREQRRVKRRDLADRKRAVREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-195RRVKRRDLADRKR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 8, pero 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Amino Acid Sequences MSKNGSAYGTAAGDTEFRKTRNLDEYAAKAKEREAKEREEAKARYEAKMAGKRYYKPLDGTETLTTARAATLDLSAQVGKVQIVAMGTAGAVGRRGRGAGFYCETCDWTVKDNLQWVEHINSMTHLRNLGQTGEVARSTADEVRARIDAAWARVEAQRQQATVNLSERLALRQQEDEREREQRRVKRRDLADRKRAVREAEAAAAAKPDYGEDVRVEGEHDEDDMMALMGITGFGSTKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.17
3 0.18
4 0.19
5 0.23
6 0.25
7 0.3
8 0.36
9 0.39
10 0.37
11 0.39
12 0.44
13 0.47
14 0.48
15 0.43
16 0.35
17 0.36
18 0.4
19 0.4
20 0.43
21 0.4
22 0.43
23 0.52
24 0.57
25 0.58
26 0.58
27 0.55
28 0.49
29 0.54
30 0.49
31 0.43
32 0.38
33 0.38
34 0.38
35 0.44
36 0.43
37 0.42
38 0.45
39 0.46
40 0.52
41 0.53
42 0.47
43 0.43
44 0.44
45 0.43
46 0.4
47 0.41
48 0.34
49 0.3
50 0.27
51 0.25
52 0.21
53 0.14
54 0.12
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.03
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.08
85 0.1
86 0.13
87 0.15
88 0.14
89 0.16
90 0.16
91 0.17
92 0.16
93 0.15
94 0.12
95 0.13
96 0.15
97 0.14
98 0.15
99 0.18
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.16
106 0.15
107 0.1
108 0.11
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.09
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.15
141 0.17
142 0.17
143 0.21
144 0.22
145 0.21
146 0.21
147 0.22
148 0.23
149 0.24
150 0.23
151 0.18
152 0.16
153 0.17
154 0.18
155 0.17
156 0.18
157 0.17
158 0.16
159 0.21
160 0.23
161 0.3
162 0.33
163 0.34
164 0.35
165 0.43
166 0.43
167 0.46
168 0.53
169 0.53
170 0.61
171 0.66
172 0.69
173 0.69
174 0.74
175 0.77
176 0.8
177 0.82
178 0.82
179 0.81
180 0.8
181 0.77
182 0.73
183 0.64
184 0.56
185 0.5
186 0.43
187 0.36
188 0.32
189 0.27
190 0.23
191 0.21
192 0.18
193 0.13
194 0.1
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.12
205 0.13
206 0.11
207 0.11
208 0.09
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.04