FuNGI

F0XLM2

Protein Details

Accession

F0XLM2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
59-79	GSRSFKLRPKVVRRADEERKA	Basic
94-114	VDDARRRRESRMRGGRGRGRG	Basic
363-387	SSSSGVVKTKKRRPQKEKEKDPEEV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
97-121	ARRRRESRMRGGRGRGRGGRGRGRG
371-380	TKKRRPQKEK

Subcellular Location(s)

mito 19, nucl 6.5, cyto_nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRTRRVLRGGATPAANSDDTSGQGSPAAALEPTAASEAAGATEASEASTLVPTRTAGSRSFKLRPKVVRRADEERKALAEQEEKKLLDRAAVDDARRRRESRMRGGRGRGRGGRGRGRGDFAGGRDGLIRRTVAPDGPFSQMPGSLSQGRGRPGQGGFGGGGGGGGGGGFGGGGRGSGPSSGGFLSVSGPAVEVDLRLNTDMFNGRMADYADGDDVAVKDEFAAETISSTSSGKKIPQLLPMGIKREEFRETGMVVAATDELEATAGEGDAVDDGEADDSGSDLFIGNGDVTTTGGSADDDEVWSRAIKTQRGVKLIGPDGQEIEVTDIDTLAEKRQEIAAAAAAAGQRPSGEEGEEGGISSSSGVVKTKKRRPQKEKEKDPEEVMVEEGLQAMLHDLAIDPPRDSGTAPLAIHSNESAADDEEERRKQQESAEAPQREGRLFLFQFPPVLPSLQPFQPSSPTIKNSSHVGGVVKPDPDEHSDVVMLDSVPAAAAVDLTGSGDNSNDNDGRKPSDIGEGGFLGTLTIRKSGRAELSWGGMTYEMMPGSDVQFLTTAVLLEEADEKPNVGDGQPTENAGGNAFGMGPVGGKYNLVPVFSSETEWTVDPAELEMYEDEDEDEEDEEDEEEEATVQVD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.41
3	0.35
4	0.32
5	0.24
6	0.21
7	0.17
8	0.17
9	0.2
10	0.18
11	0.14
12	0.15
13	0.14
14	0.12
15	0.11
16	0.11
17	0.08
18	0.08
19	0.08
20	0.08
21	0.08
22	0.09
23	0.08
24	0.07
25	0.08
26	0.08
27	0.07
28	0.07
29	0.06
30	0.05
31	0.06
32	0.06
33	0.06
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.1
38	0.1
39	0.1
40	0.11
41	0.11
42	0.14
43	0.17
44	0.19
45	0.22
46	0.28
47	0.34
48	0.39
49	0.47
50	0.52
51	0.57
52	0.62
53	0.67
54	0.7
55	0.75
56	0.78
57	0.78
58	0.78
59	0.8
60	0.82
61	0.8
62	0.74
63	0.66
64	0.59
65	0.52
66	0.47
67	0.41
68	0.39
69	0.35
70	0.38
71	0.4
72	0.38
73	0.39
74	0.4
75	0.36
76	0.32
77	0.28
78	0.25
79	0.27
80	0.3
81	0.3
82	0.34
83	0.4
84	0.45
85	0.48
86	0.47
87	0.47
88	0.54
89	0.61
90	0.65
91	0.69
92	0.71
93	0.74
94	0.81
95	0.81
96	0.78
97	0.77
98	0.71
99	0.68
100	0.65
101	0.65
102	0.65
103	0.63
104	0.62
105	0.56
106	0.55
107	0.48
108	0.45
109	0.4
110	0.32
111	0.31
112	0.25
113	0.23
114	0.22
115	0.22
116	0.2
117	0.19
118	0.18
119	0.14
120	0.17
121	0.19
122	0.18
123	0.19
124	0.22
125	0.22
126	0.25
127	0.24
128	0.22
129	0.21
130	0.19
131	0.19
132	0.16
133	0.18
134	0.17
135	0.19
136	0.22
137	0.24
138	0.26
139	0.27
140	0.26
141	0.26
142	0.24
143	0.25
144	0.21
145	0.2
146	0.17
147	0.15
148	0.13
149	0.09
150	0.08
151	0.05
152	0.04
153	0.02
154	0.02
155	0.02
156	0.02
157	0.02
158	0.02
159	0.01
160	0.02
161	0.02
162	0.02
163	0.03
164	0.03
165	0.04
166	0.04
167	0.05
168	0.05
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.08
175	0.08
176	0.08
177	0.06
178	0.07
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.12
196	0.13
197	0.11
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.04
214	0.05
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.07
219	0.08
220	0.09
221	0.11
222	0.12
223	0.15
224	0.22
225	0.23
226	0.29
227	0.31
228	0.31
229	0.36
230	0.37
231	0.37
232	0.32
233	0.31
234	0.25
235	0.25
236	0.26
237	0.2
238	0.19
239	0.17
240	0.15
241	0.15
242	0.14
243	0.11
244	0.09
245	0.08
246	0.06
247	0.05
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.02
262	0.02
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.02
273	0.02
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.09
296	0.12
297	0.14
298	0.17
299	0.23
300	0.27
301	0.29
302	0.3
303	0.28
304	0.29
305	0.3
306	0.3
307	0.24
308	0.2
309	0.18
310	0.17
311	0.15
312	0.11
313	0.1
314	0.07
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.06
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.07
325	0.07
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.04
338	0.05
339	0.07
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.06
355	0.1
356	0.18
357	0.27
358	0.36
359	0.45
360	0.55
361	0.66
362	0.74
363	0.81
364	0.86
365	0.88
366	0.9
367	0.91
368	0.86
369	0.78
370	0.7
371	0.61
372	0.51
373	0.4
374	0.29
375	0.2
376	0.14
377	0.11
378	0.09
379	0.06
380	0.04
381	0.03
382	0.03
383	0.03
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.05
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.09
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.1
397	0.14
398	0.14
399	0.14
400	0.15
401	0.14
402	0.15
403	0.13
404	0.11
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.08
410	0.09
411	0.12
412	0.17
413	0.19
414	0.19
415	0.2
416	0.21
417	0.21
418	0.23
419	0.28
420	0.28
421	0.34
422	0.43
423	0.42
424	0.42
425	0.44
426	0.42
427	0.34
428	0.3
429	0.23
430	0.21
431	0.2
432	0.23
433	0.22
434	0.21
435	0.22
436	0.21
437	0.22
438	0.15
439	0.16
440	0.13
441	0.12
442	0.16
443	0.17
444	0.19
445	0.19
446	0.19
447	0.22
448	0.24
449	0.28
450	0.29
451	0.3
452	0.32
453	0.33
454	0.34
455	0.33
456	0.33
457	0.28
458	0.24
459	0.22
460	0.19
461	0.21
462	0.22
463	0.19
464	0.18
465	0.18
466	0.19
467	0.21
468	0.23
469	0.19
470	0.18
471	0.18
472	0.18
473	0.17
474	0.15
475	0.11
476	0.08
477	0.07
478	0.05
479	0.05
480	0.04
481	0.04
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.03
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.05
491	0.05
492	0.06
493	0.07
494	0.11
495	0.12
496	0.13
497	0.16
498	0.19
499	0.22
500	0.23
501	0.24
502	0.22
503	0.26
504	0.26
505	0.24
506	0.23
507	0.2
508	0.18
509	0.17
510	0.15
511	0.09
512	0.08
513	0.09
514	0.08
515	0.12
516	0.12
517	0.14
518	0.16
519	0.21
520	0.25
521	0.25
522	0.29
523	0.26
524	0.29
525	0.28
526	0.26
527	0.22
528	0.17
529	0.16
530	0.13
531	0.12
532	0.09
533	0.08
534	0.09
535	0.09
536	0.1
537	0.13
538	0.12
539	0.1
540	0.11
541	0.11
542	0.11
543	0.11
544	0.1
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.1
550	0.1
551	0.11
552	0.11
553	0.12
554	0.11
555	0.14
556	0.14
557	0.11
558	0.14
559	0.14
560	0.2
561	0.2
562	0.21
563	0.2
564	0.22
565	0.22
566	0.18
567	0.17
568	0.11
569	0.1
570	0.09
571	0.07
572	0.06
573	0.05
574	0.06
575	0.06
576	0.08
577	0.08
578	0.08
579	0.09
580	0.16
581	0.17
582	0.18
583	0.18
584	0.18
585	0.24
586	0.24
587	0.27
588	0.21
589	0.21
590	0.22
591	0.22
592	0.21
593	0.16
594	0.16
595	0.13
596	0.13
597	0.12
598	0.1
599	0.12
600	0.11
601	0.11
602	0.11
603	0.11
604	0.11
605	0.1
606	0.11
607	0.1
608	0.11
609	0.09
610	0.09
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.08
616	0.08
617	0.08

F0XLM2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer