Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XNA6

Protein Details
Accession F0XNA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32SPATSRHSSHQQQQKEQKVDHydrophilic
236-259SGESKSTSRHKREKSASSKHKSNVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018554  FRQ  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007623  P:circadian rhythm  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09421  FRQ  
Amino Acid Sequences MADKGRQSHVRTSPATSRHSSHQQQQKEQKVDQALSIDAQSVRQRQRRHALDGPDHVKVAGDEPTSSPRASKIVADKMSHEKSPTGDSSGPSSDEAKNWFDCANRDPTIALAGSTSMDDSDSSADDDRINAAAASQDDPYPMIPPAPETPFLAQGFTRQTTSSVTEDYRSVIDDLTIENKRLKEELKRYRQSAGRDVLEKEKLFEVKLHGLPRRKKQELEATLRNFAASLGTTSASGESKSTSRHKREKSASSKHKSNVGIYSLAGASSKHASTSSSRSRPVDSAYASMSTGAHSSGVALARPSFGGPQARTSEQKVERYLQDIPEGLHPNYGLRALSDKDKKKLIVRRLEQLFTGKISGRYARRNRSMLPPTDGTPTAHDTTSGSGTGPGSGVSAAVNALPGSGQPPNSLTSPIVLGCSMPPSEPTREALIQSRQNNHKRHSSRDHSLSNSNSNGDEAGNGNGSKSVSRSAGHWSGNGNGNGNGNGNGNGNGNGKSPTNGSLPEQRPTRPLDLDPDRVQIPAENMEYIRHLGLVPPEIGHADEQLAIDMAPDVDGWVYLNLLSNLAQLHIFNVAPDFIRKAIVEKSTKFQLSPDGQKIRWRGGTDGTKFSSDGSSGENGTQNQSTDEGDGSDKNGRRNKAKTSGNGSASVLSSSKKQSRSGPYASKTSSSFHYKPLFVHQTSVPLTSVEDLASQSSGDIGCSIPAATINNSNSNESRSDKDMSGSSSHRQRRISDGVLVYYTGAPFCTDLAGDSGGDTSPATFVTSSGQTRDSALSSAESTQSARPLCRTTSGARVQLRPLTDFSTLSKEELAEIGLSSDDDGDSTLSTTVPPDEPELQLLDDAESDYWPVEPEEPFLEASGIGRVFPEDHFSLVVTTKRPVRAASSNSHDGNTVSDDDGNDEDAEHAEGVFSMSSLMKRLAALKRQSAPISGAVPKRPRLHASGVRIEYVSAKMRYREPVPLPPPVAFYRSLSTSSESGYDEASMSSLGEEDEDESMLASSSEEMISRRANPHQSDNHPSPASLPLAMSGDSSDVEAEAESMEVDSTGGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.56
4 0.52
5 0.52
6 0.6
7 0.6
8 0.61
9 0.64
10 0.66
11 0.73
12 0.79
13 0.81
14 0.78
15 0.73
16 0.71
17 0.69
18 0.61
19 0.53
20 0.46
21 0.37
22 0.31
23 0.29
24 0.25
25 0.18
26 0.21
27 0.24
28 0.3
29 0.38
30 0.44
31 0.49
32 0.55
33 0.66
34 0.68
35 0.71
36 0.7
37 0.7
38 0.71
39 0.75
40 0.7
41 0.62
42 0.56
43 0.47
44 0.4
45 0.31
46 0.25
47 0.21
48 0.17
49 0.16
50 0.18
51 0.24
52 0.26
53 0.26
54 0.24
55 0.21
56 0.23
57 0.23
58 0.27
59 0.3
60 0.36
61 0.42
62 0.42
63 0.45
64 0.51
65 0.54
66 0.5
67 0.44
68 0.37
69 0.34
70 0.38
71 0.36
72 0.32
73 0.31
74 0.3
75 0.33
76 0.33
77 0.32
78 0.28
79 0.29
80 0.25
81 0.26
82 0.28
83 0.27
84 0.25
85 0.26
86 0.26
87 0.25
88 0.26
89 0.28
90 0.32
91 0.3
92 0.29
93 0.28
94 0.26
95 0.27
96 0.24
97 0.19
98 0.12
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.09
118 0.08
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.13
132 0.18
133 0.21
134 0.22
135 0.22
136 0.24
137 0.29
138 0.29
139 0.28
140 0.23
141 0.24
142 0.27
143 0.26
144 0.25
145 0.2
146 0.21
147 0.22
148 0.26
149 0.24
150 0.22
151 0.22
152 0.22
153 0.22
154 0.22
155 0.2
156 0.18
157 0.16
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.17
163 0.18
164 0.18
165 0.21
166 0.22
167 0.23
168 0.25
169 0.28
170 0.31
171 0.4
172 0.5
173 0.57
174 0.63
175 0.64
176 0.68
177 0.7
178 0.66
179 0.63
180 0.6
181 0.53
182 0.5
183 0.5
184 0.49
185 0.5
186 0.44
187 0.38
188 0.35
189 0.31
190 0.28
191 0.28
192 0.27
193 0.28
194 0.32
195 0.36
196 0.39
197 0.47
198 0.54
199 0.62
200 0.67
201 0.64
202 0.62
203 0.63
204 0.68
205 0.68
206 0.69
207 0.67
208 0.61
209 0.6
210 0.57
211 0.49
212 0.38
213 0.29
214 0.21
215 0.13
216 0.1
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.17
228 0.25
229 0.34
230 0.43
231 0.52
232 0.58
233 0.67
234 0.74
235 0.79
236 0.8
237 0.82
238 0.83
239 0.82
240 0.83
241 0.75
242 0.74
243 0.66
244 0.59
245 0.53
246 0.45
247 0.38
248 0.3
249 0.29
250 0.21
251 0.19
252 0.15
253 0.1
254 0.09
255 0.11
256 0.11
257 0.09
258 0.1
259 0.12
260 0.15
261 0.24
262 0.32
263 0.34
264 0.38
265 0.4
266 0.42
267 0.42
268 0.42
269 0.39
270 0.31
271 0.28
272 0.25
273 0.24
274 0.21
275 0.2
276 0.16
277 0.11
278 0.1
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.1
293 0.16
294 0.16
295 0.21
296 0.24
297 0.27
298 0.29
299 0.31
300 0.37
301 0.36
302 0.41
303 0.39
304 0.39
305 0.38
306 0.39
307 0.38
308 0.3
309 0.27
310 0.23
311 0.21
312 0.23
313 0.26
314 0.23
315 0.21
316 0.2
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.11
321 0.08
322 0.11
323 0.11
324 0.19
325 0.28
326 0.32
327 0.34
328 0.38
329 0.41
330 0.46
331 0.52
332 0.53
333 0.55
334 0.54
335 0.59
336 0.6
337 0.58
338 0.51
339 0.46
340 0.38
341 0.29
342 0.27
343 0.2
344 0.17
345 0.18
346 0.22
347 0.24
348 0.33
349 0.4
350 0.46
351 0.51
352 0.53
353 0.54
354 0.58
355 0.6
356 0.54
357 0.52
358 0.45
359 0.4
360 0.4
361 0.38
362 0.29
363 0.25
364 0.25
365 0.22
366 0.2
367 0.18
368 0.15
369 0.16
370 0.16
371 0.14
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.05
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.09
395 0.11
396 0.12
397 0.13
398 0.11
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.1
403 0.08
404 0.08
405 0.06
406 0.08
407 0.08
408 0.07
409 0.09
410 0.12
411 0.14
412 0.15
413 0.17
414 0.19
415 0.19
416 0.21
417 0.23
418 0.26
419 0.3
420 0.33
421 0.38
422 0.43
423 0.51
424 0.55
425 0.54
426 0.58
427 0.55
428 0.59
429 0.61
430 0.6
431 0.59
432 0.6
433 0.61
434 0.54
435 0.56
436 0.5
437 0.44
438 0.38
439 0.32
440 0.25
441 0.21
442 0.18
443 0.13
444 0.11
445 0.08
446 0.07
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.11
458 0.15
459 0.2
460 0.2
461 0.2
462 0.2
463 0.21
464 0.25
465 0.25
466 0.2
467 0.16
468 0.16
469 0.16
470 0.15
471 0.13
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.13
489 0.21
490 0.23
491 0.28
492 0.29
493 0.27
494 0.29
495 0.31
496 0.32
497 0.25
498 0.23
499 0.26
500 0.28
501 0.32
502 0.31
503 0.29
504 0.27
505 0.25
506 0.24
507 0.17
508 0.14
509 0.12
510 0.11
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.09
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.07
528 0.06
529 0.05
530 0.06
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.03
544 0.03
545 0.03
546 0.03
547 0.04
548 0.04
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.06
554 0.06
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.07
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.09
569 0.12
570 0.17
571 0.21
572 0.21
573 0.24
574 0.27
575 0.28
576 0.26
577 0.23
578 0.25
579 0.26
580 0.31
581 0.35
582 0.35
583 0.35
584 0.4
585 0.41
586 0.38
587 0.37
588 0.32
589 0.26
590 0.29
591 0.36
592 0.34
593 0.37
594 0.34
595 0.31
596 0.3
597 0.29
598 0.22
599 0.15
600 0.12
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.11
605 0.12
606 0.12
607 0.14
608 0.14
609 0.12
610 0.11
611 0.12
612 0.11
613 0.1
614 0.09
615 0.08
616 0.09
617 0.09
618 0.1
619 0.15
620 0.17
621 0.23
622 0.28
623 0.31
624 0.36
625 0.4
626 0.45
627 0.49
628 0.52
629 0.51
630 0.54
631 0.57
632 0.53
633 0.5
634 0.44
635 0.35
636 0.3
637 0.25
638 0.18
639 0.11
640 0.12
641 0.16
642 0.21
643 0.22
644 0.25
645 0.32
646 0.39
647 0.45
648 0.5
649 0.52
650 0.5
651 0.52
652 0.51
653 0.45
654 0.39
655 0.34
656 0.31
657 0.32
658 0.3
659 0.31
660 0.35
661 0.33
662 0.33
663 0.4
664 0.42
665 0.34
666 0.36
667 0.3
668 0.31
669 0.31
670 0.31
671 0.23
672 0.16
673 0.16
674 0.14
675 0.14
676 0.08
677 0.08
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.06
682 0.05
683 0.06
684 0.06
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.04
692 0.05
693 0.07
694 0.07
695 0.12
696 0.14
697 0.19
698 0.2
699 0.23
700 0.23
701 0.24
702 0.25
703 0.23
704 0.24
705 0.22
706 0.24
707 0.22
708 0.23
709 0.23
710 0.22
711 0.24
712 0.24
713 0.26
714 0.32
715 0.37
716 0.41
717 0.42
718 0.41
719 0.45
720 0.48
721 0.46
722 0.42
723 0.38
724 0.34
725 0.31
726 0.29
727 0.23
728 0.17
729 0.14
730 0.09
731 0.07
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.06
736 0.05
737 0.06
738 0.07
739 0.07
740 0.07
741 0.07
742 0.07
743 0.07
744 0.07
745 0.06
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.06
750 0.05
751 0.06
752 0.09
753 0.12
754 0.13
755 0.14
756 0.16
757 0.15
758 0.17
759 0.18
760 0.16
761 0.13
762 0.13
763 0.12
764 0.12
765 0.13
766 0.12
767 0.11
768 0.12
769 0.13
770 0.17
771 0.17
772 0.17
773 0.19
774 0.21
775 0.22
776 0.24
777 0.26
778 0.25
779 0.32
780 0.37
781 0.41
782 0.42
783 0.43
784 0.43
785 0.43
786 0.42
787 0.35
788 0.31
789 0.27
790 0.25
791 0.23
792 0.22
793 0.25
794 0.24
795 0.22
796 0.21
797 0.17
798 0.16
799 0.16
800 0.14
801 0.08
802 0.07
803 0.07
804 0.06
805 0.06
806 0.06
807 0.06
808 0.05
809 0.04
810 0.05
811 0.05
812 0.05
813 0.06
814 0.06
815 0.06
816 0.06
817 0.07
818 0.09
819 0.09
820 0.1
821 0.14
822 0.16
823 0.16
824 0.17
825 0.18
826 0.16
827 0.15
828 0.15
829 0.11
830 0.09
831 0.09
832 0.08
833 0.07
834 0.07
835 0.07
836 0.06
837 0.07
838 0.08
839 0.09
840 0.09
841 0.11
842 0.13
843 0.14
844 0.14
845 0.13
846 0.13
847 0.1
848 0.11
849 0.12
850 0.1
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.1
855 0.1
856 0.15
857 0.12
858 0.13
859 0.14
860 0.14
861 0.15
862 0.17
863 0.19
864 0.16
865 0.19
866 0.23
867 0.26
868 0.27
869 0.27
870 0.31
871 0.36
872 0.4
873 0.43
874 0.46
875 0.49
876 0.49
877 0.47
878 0.42
879 0.34
880 0.31
881 0.26
882 0.2
883 0.15
884 0.15
885 0.14
886 0.16
887 0.16
888 0.16
889 0.13
890 0.11
891 0.11
892 0.1
893 0.11
894 0.09
895 0.08
896 0.06
897 0.06
898 0.07
899 0.06
900 0.05
901 0.06
902 0.07
903 0.08
904 0.1
905 0.11
906 0.11
907 0.12
908 0.19
909 0.25
910 0.32
911 0.38
912 0.43
913 0.48
914 0.52
915 0.52
916 0.47
917 0.43
918 0.38
919 0.36
920 0.35
921 0.35
922 0.38
923 0.43
924 0.48
925 0.51
926 0.52
927 0.52
928 0.51
929 0.56
930 0.57
931 0.59
932 0.62
933 0.58
934 0.54
935 0.5
936 0.45
937 0.37
938 0.33
939 0.32
940 0.26
941 0.27
942 0.29
943 0.33
944 0.38
945 0.39
946 0.44
947 0.43
948 0.49
949 0.5
950 0.54
951 0.53
952 0.48
953 0.5
954 0.43
955 0.41
956 0.32
957 0.31
958 0.28
959 0.28
960 0.29
961 0.26
962 0.27
963 0.25
964 0.25
965 0.24
966 0.21
967 0.2
968 0.18
969 0.17
970 0.13
971 0.12
972 0.12
973 0.09
974 0.08
975 0.07
976 0.07
977 0.06
978 0.06
979 0.06
980 0.07
981 0.08
982 0.08
983 0.08
984 0.08
985 0.08
986 0.08
987 0.07
988 0.06
989 0.06
990 0.07
991 0.08
992 0.08
993 0.09
994 0.13
995 0.16
996 0.2
997 0.24
998 0.3
999 0.38
1000 0.42
1001 0.5
1002 0.56
1003 0.6
1004 0.65
1005 0.65
1006 0.67
1007 0.59
1008 0.54
1009 0.47
1010 0.43
1011 0.38
1012 0.29
1013 0.24
1014 0.18
1015 0.19
1016 0.19
1017 0.17
1018 0.13
1019 0.12
1020 0.11
1021 0.12
1022 0.09
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.07
1026 0.07
1027 0.06
1028 0.06
1029 0.06
1030 0.06
1031 0.06
1032 0.05