Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XFN5

Protein Details
Accession F0XFN5    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-50GDDQPAKKKSKRKASTTDLPELEHydrophilic
53-82VSLPEPPSKRAKRALKKGKPLPPRPNPLADHydrophilic
399-451EDDQARYKKRFGKDRPQKQLPQQQQRQTEQPQTQHKRPRQEKWQDKTARNEEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-40KKKSKRK
59-77PSKRAKRALKKGKPLPPRP
101-101K
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MATETETKIEVARPPAVEDVADDVSSHGDDQPAKKKSKRKASTTDLPELEVDVSLPEPPSKRAKRALKKGKPLPPRPNPLADSKDDAADDDGAGKSGKNGKNGKPSKERSQFGVWIGNLAFTVTRTQLFQWLVESSGGTIAEADITRVNLPTSSRRPGQPPRDREAEPAGAAGGVALAVQNKGFAYVDFATYEAQVAAAALSETELDGRRVLIKDSKSFDGRPAKPAAVAADGETAADKDGSGAAAAASAGAASSTATKVFVGNLGFETTEEDLRRHFAPCGTIAWAKVATFPDNTEKCRGYGWVQFGLPEVTDGTQPTPAEAAASAVLGFVRIKEAVDTEEDFVAEALAAEANKTTETDEAAATATTLSVKPKEARFRTRKWWVNMLKGRTLKVQFAEDDQARYKKRFGKDRPQKQLPQQQQRQTEQPQTQHKRPRQEKWQDKTARNEEAAAPSDKPFKFQDLSIAQRTGAVTASLGKKTMLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.29
4 0.26
5 0.22
6 0.22
7 0.19
8 0.18
9 0.15
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.1
15 0.12
16 0.16
17 0.23
18 0.32
19 0.38
20 0.45
21 0.51
22 0.59
23 0.66
24 0.73
25 0.76
26 0.77
27 0.79
28 0.81
29 0.85
30 0.84
31 0.82
32 0.72
33 0.64
34 0.54
35 0.45
36 0.36
37 0.26
38 0.18
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.1
43 0.12
44 0.13
45 0.18
46 0.29
47 0.34
48 0.4
49 0.49
50 0.59
51 0.66
52 0.76
53 0.83
54 0.82
55 0.87
56 0.9
57 0.9
58 0.9
59 0.89
60 0.89
61 0.88
62 0.87
63 0.81
64 0.79
65 0.72
66 0.69
67 0.64
68 0.56
69 0.53
70 0.44
71 0.41
72 0.33
73 0.31
74 0.25
75 0.2
76 0.17
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.12
83 0.2
84 0.24
85 0.3
86 0.37
87 0.43
88 0.54
89 0.61
90 0.66
91 0.67
92 0.71
93 0.73
94 0.75
95 0.7
96 0.65
97 0.65
98 0.6
99 0.52
100 0.52
101 0.41
102 0.34
103 0.32
104 0.27
105 0.2
106 0.17
107 0.14
108 0.08
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.05
128 0.07
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.08
137 0.11
138 0.18
139 0.23
140 0.27
141 0.3
142 0.32
143 0.4
144 0.48
145 0.57
146 0.59
147 0.61
148 0.61
149 0.64
150 0.62
151 0.58
152 0.53
153 0.44
154 0.35
155 0.28
156 0.22
157 0.16
158 0.15
159 0.11
160 0.05
161 0.03
162 0.02
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.06
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.02
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.15
200 0.17
201 0.21
202 0.24
203 0.27
204 0.27
205 0.27
206 0.32
207 0.37
208 0.36
209 0.36
210 0.35
211 0.32
212 0.3
213 0.3
214 0.24
215 0.15
216 0.14
217 0.11
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.06
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.12
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.11
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.13
278 0.12
279 0.14
280 0.21
281 0.23
282 0.25
283 0.27
284 0.26
285 0.25
286 0.25
287 0.26
288 0.21
289 0.23
290 0.25
291 0.23
292 0.23
293 0.22
294 0.22
295 0.21
296 0.17
297 0.13
298 0.09
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.05
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.06
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.09
357 0.1
358 0.14
359 0.19
360 0.26
361 0.36
362 0.42
363 0.53
364 0.58
365 0.64
366 0.7
367 0.76
368 0.78
369 0.73
370 0.76
371 0.72
372 0.74
373 0.75
374 0.7
375 0.68
376 0.62
377 0.59
378 0.56
379 0.52
380 0.45
381 0.4
382 0.38
383 0.31
384 0.32
385 0.37
386 0.31
387 0.32
388 0.33
389 0.38
390 0.38
391 0.39
392 0.42
393 0.43
394 0.5
395 0.57
396 0.61
397 0.66
398 0.74
399 0.82
400 0.86
401 0.88
402 0.88
403 0.87
404 0.88
405 0.87
406 0.87
407 0.85
408 0.83
409 0.83
410 0.8
411 0.78
412 0.75
413 0.73
414 0.69
415 0.68
416 0.7
417 0.71
418 0.75
419 0.77
420 0.77
421 0.79
422 0.81
423 0.83
424 0.83
425 0.85
426 0.87
427 0.84
428 0.88
429 0.86
430 0.83
431 0.84
432 0.8
433 0.76
434 0.66
435 0.61
436 0.54
437 0.5
438 0.47
439 0.4
440 0.34
441 0.3
442 0.37
443 0.34
444 0.35
445 0.32
446 0.34
447 0.33
448 0.32
449 0.39
450 0.38
451 0.45
452 0.46
453 0.45
454 0.39
455 0.39
456 0.39
457 0.3
458 0.23
459 0.17
460 0.12
461 0.17
462 0.22
463 0.21
464 0.21