Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XSY5

Protein Details
Accession F0XSY5    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-52ADELRKGNDRSSKRRKVQKDGDDDDDAcidic
72-96NEAGPDSTRNKKRRRKSVADEGDADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-87NKKRRRK
108-109KR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MAADKRNVYLDVEDSDEDDNQSYDSEADELRKGNDRSSKRRKVQKDGDDDDDDDEPIGGRDDDAGEEDGLPNEAGPDSTRNKKRRRKSVADEGDADEDDEADKGSSKKRKRLDSAGNDLPGVSKPLTKKNLVASEKAVQRSGVMYLSRVPPFMKPIKLRSLLSPYGTINRIFLSPEDPLSHARRVRGGGNKKRSFVDGWVEFVRKRDAKRAVDLLNGHAIGGKKSSYYRDDLWNVVYLRGFKWHHLTEQITTENAERAGRMRAEIAQSTRENKEFVRNVERAKMLDGIEAKTAEKKKRSTTQKEAGHEDRAPPAPAPAADTKEHKNSRTFTFKQTTLVSRKDKDQQPEQVKRVLSKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.19
4 0.18
5 0.16
6 0.14
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.09
11 0.09
12 0.1
13 0.1
14 0.13
15 0.15
16 0.16
17 0.18
18 0.26
19 0.27
20 0.31
21 0.39
22 0.45
23 0.54
24 0.63
25 0.71
26 0.73
27 0.82
28 0.84
29 0.86
30 0.88
31 0.87
32 0.86
33 0.81
34 0.78
35 0.72
36 0.64
37 0.55
38 0.46
39 0.36
40 0.25
41 0.2
42 0.13
43 0.1
44 0.1
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.1
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.12
64 0.17
65 0.27
66 0.36
67 0.45
68 0.55
69 0.65
70 0.74
71 0.8
72 0.85
73 0.85
74 0.86
75 0.88
76 0.87
77 0.82
78 0.75
79 0.66
80 0.57
81 0.47
82 0.38
83 0.26
84 0.16
85 0.12
86 0.09
87 0.07
88 0.05
89 0.07
90 0.08
91 0.16
92 0.24
93 0.3
94 0.39
95 0.46
96 0.55
97 0.6
98 0.68
99 0.71
100 0.72
101 0.74
102 0.71
103 0.64
104 0.55
105 0.48
106 0.39
107 0.29
108 0.22
109 0.14
110 0.13
111 0.14
112 0.23
113 0.27
114 0.28
115 0.3
116 0.35
117 0.43
118 0.42
119 0.42
120 0.37
121 0.4
122 0.42
123 0.41
124 0.34
125 0.25
126 0.23
127 0.22
128 0.19
129 0.15
130 0.1
131 0.1
132 0.12
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.14
138 0.2
139 0.23
140 0.27
141 0.26
142 0.3
143 0.37
144 0.4
145 0.4
146 0.37
147 0.4
148 0.36
149 0.33
150 0.31
151 0.24
152 0.24
153 0.24
154 0.21
155 0.15
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.14
166 0.17
167 0.21
168 0.2
169 0.21
170 0.22
171 0.22
172 0.26
173 0.32
174 0.39
175 0.44
176 0.53
177 0.55
178 0.55
179 0.54
180 0.51
181 0.44
182 0.36
183 0.34
184 0.24
185 0.25
186 0.25
187 0.25
188 0.24
189 0.24
190 0.27
191 0.23
192 0.24
193 0.29
194 0.35
195 0.37
196 0.41
197 0.44
198 0.4
199 0.4
200 0.4
201 0.33
202 0.27
203 0.24
204 0.2
205 0.16
206 0.15
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.09
211 0.11
212 0.14
213 0.15
214 0.19
215 0.21
216 0.26
217 0.29
218 0.29
219 0.28
220 0.3
221 0.27
222 0.25
223 0.23
224 0.18
225 0.16
226 0.21
227 0.21
228 0.18
229 0.24
230 0.25
231 0.26
232 0.29
233 0.31
234 0.26
235 0.3
236 0.29
237 0.22
238 0.22
239 0.21
240 0.17
241 0.16
242 0.14
243 0.1
244 0.11
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.16
250 0.18
251 0.21
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.29
256 0.31
257 0.3
258 0.28
259 0.26
260 0.34
261 0.33
262 0.36
263 0.39
264 0.39
265 0.41
266 0.45
267 0.46
268 0.37
269 0.35
270 0.33
271 0.25
272 0.26
273 0.25
274 0.21
275 0.21
276 0.21
277 0.2
278 0.23
279 0.3
280 0.33
281 0.38
282 0.42
283 0.48
284 0.57
285 0.67
286 0.7
287 0.74
288 0.76
289 0.78
290 0.78
291 0.78
292 0.72
293 0.67
294 0.6
295 0.52
296 0.48
297 0.43
298 0.39
299 0.31
300 0.28
301 0.25
302 0.23
303 0.25
304 0.24
305 0.25
306 0.26
307 0.31
308 0.35
309 0.42
310 0.47
311 0.46
312 0.48
313 0.49
314 0.54
315 0.59
316 0.57
317 0.56
318 0.58
319 0.56
320 0.55
321 0.56
322 0.56
323 0.54
324 0.59
325 0.58
326 0.54
327 0.59
328 0.64
329 0.66
330 0.66
331 0.67
332 0.69
333 0.72
334 0.78
335 0.76
336 0.72
337 0.68
338 0.63