Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XMY1

Protein Details
Accession F0XMY1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-48SARPSHHVPQTRPPRPQRPPRSRRSQQPRRPRERTAILPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-52TRPPRPQRPPRSRRSQQPRRPRERTAILPQRSA
55-59MRKVR
Subcellular Location(s) plas 16, nucl 9.5, cyto_nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038967  Dsc4-like  
IPR013715  DUF1746  
Gene Ontology GO:0044695  C:Dsc E3 ubiquitin ligase complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF08508  DUF1746  
Amino Acid Sequences MDDNGSSSRSARPSHHVPQTRPPRPQRPPRSRRSQQPRRPRERTAILPQRSASVMRKVRAGLSKKLKFFTELMGQLDMIVYAELCTLYYMDPKPDEFMLITPAHRPHVLAVVVPNALCMLAHVLWQPLQGTETSRGYLHGGVLIDFVGQRAPSSRWVLFLLDLVVLAVQCLMLAVHTEREKLRKLVLPMKGALALPMGRDLASPALAATTNAMVAAAQDHDAEERGVQRTTGRPAEGGDGIEMQRLGGGDATTENNGIENENENENALLDDRPRRLPPEQAAEYVLNALASGCNLSDFYVVHAIREASQDYQGVAAQSLQTMSYAASLARLAARRGGAGVRTQTTGVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.6
3 0.62
4 0.63
5 0.7
6 0.77
7 0.77
8 0.79
9 0.8
10 0.8
11 0.82
12 0.89
13 0.89
14 0.89
15 0.91
16 0.91
17 0.93
18 0.91
19 0.91
20 0.91
21 0.91
22 0.9
23 0.92
24 0.92
25 0.92
26 0.9
27 0.86
28 0.85
29 0.82
30 0.8
31 0.79
32 0.78
33 0.72
34 0.68
35 0.62
36 0.54
37 0.48
38 0.43
39 0.36
40 0.36
41 0.38
42 0.35
43 0.38
44 0.37
45 0.41
46 0.46
47 0.46
48 0.46
49 0.51
50 0.56
51 0.57
52 0.59
53 0.54
54 0.49
55 0.45
56 0.4
57 0.37
58 0.33
59 0.31
60 0.29
61 0.27
62 0.24
63 0.23
64 0.17
65 0.1
66 0.07
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.1
76 0.11
77 0.14
78 0.15
79 0.16
80 0.18
81 0.17
82 0.18
83 0.14
84 0.13
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.19
92 0.18
93 0.15
94 0.18
95 0.18
96 0.15
97 0.14
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.07
115 0.08
116 0.07
117 0.09
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.06
138 0.07
139 0.11
140 0.15
141 0.15
142 0.16
143 0.18
144 0.18
145 0.16
146 0.15
147 0.12
148 0.08
149 0.08
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.03
161 0.03
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.1
166 0.13
167 0.15
168 0.16
169 0.18
170 0.19
171 0.23
172 0.29
173 0.32
174 0.31
175 0.3
176 0.3
177 0.28
178 0.24
179 0.2
180 0.14
181 0.1
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.08
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.12
216 0.15
217 0.2
218 0.22
219 0.2
220 0.19
221 0.19
222 0.22
223 0.21
224 0.18
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.1
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.08
256 0.1
257 0.16
258 0.19
259 0.23
260 0.25
261 0.29
262 0.3
263 0.37
264 0.4
265 0.44
266 0.44
267 0.41
268 0.43
269 0.38
270 0.36
271 0.3
272 0.23
273 0.13
274 0.1
275 0.09
276 0.06
277 0.05
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.18
287 0.18
288 0.17
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.22
293 0.21
294 0.15
295 0.17
296 0.17
297 0.16
298 0.16
299 0.16
300 0.14
301 0.12
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.13
317 0.15
318 0.15
319 0.19
320 0.2
321 0.19
322 0.21
323 0.23
324 0.21
325 0.24
326 0.28
327 0.27
328 0.28