Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XSH1

Protein Details
Accession F0XSH1    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-76PKNGVIKLKKLPPKHKQPGNWKEGTFHydrophilic
140-166IAACLKIKKEKAQRKKEAKEARERAREBasic
259-283ELDKAGPKKKKKEEVKPKTAKPKGPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-69AAGSAPKNGVIKLKKLPPKHKQPG
145-165KIKKEKAQRKKEAKEARERAR
213-222KLTGKKAAAA
229-234AGGKKT
244-282AKGGVGSNKKRKADSELDKAGPKKKKKEEVKPKTAKPKG
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013243  SCA7_dom  
IPR037804  SGF73  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF08313  SCA7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51505  SCA7  
Amino Acid Sequences MTDVRKGPSSSPAPVTPVTGKKTSSVTPKQKPDEETIKVASKKDGAAGSAPKNGVIKLKKLPPKHKQPGNWKEGTFVDQEKKKAAKSNIPAPSPSPVVNQLDETARETFATGRPLEDAPDLQICKHCKKSVLSTAAKQHIAACLKIKKEKAQRKKEAKEARERAREQQARDEEEAARRAEQGAGGGKDDDSDSDDDGGGGGGGGGTDKKISGKLTGKKAAAAAAAAEAAGGKKTEAGGSGSVDAKGGVGSNKKRKADSELDKAGPKKKKKEEVKPKTAKPKGPVDVERQCGVILPNGQPCARSLTCKSHSMGAKRAVPGRSLPYDMLLAAYQKKNQAKQQKAAIDATAPVEDEDEANSGAIDSEEEASAVMSAMARWRPQPVVPQPTFAPIRRQYQLARLHEQLNMATNGGRVNIFRVVGYGAQKLPDGHPGLLDSEDAPGEPDDAMMMLPPAQPASAGGGGGLPSVTPVLPPIPPSMGAMGASSSPSSMRNQSSPAAMSQHNQQQHQQQHQRPIPVPLAGRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.42
3 0.4
4 0.42
5 0.42
6 0.4
7 0.39
8 0.38
9 0.41
10 0.43
11 0.46
12 0.5
13 0.55
14 0.61
15 0.7
16 0.75
17 0.77
18 0.75
19 0.74
20 0.72
21 0.66
22 0.62
23 0.57
24 0.57
25 0.54
26 0.51
27 0.46
28 0.4
29 0.36
30 0.35
31 0.32
32 0.25
33 0.27
34 0.32
35 0.33
36 0.35
37 0.34
38 0.32
39 0.31
40 0.31
41 0.34
42 0.32
43 0.34
44 0.36
45 0.46
46 0.51
47 0.6
48 0.69
49 0.71
50 0.79
51 0.83
52 0.84
53 0.84
54 0.87
55 0.88
56 0.86
57 0.82
58 0.71
59 0.64
60 0.58
61 0.52
62 0.44
63 0.39
64 0.39
65 0.37
66 0.39
67 0.42
68 0.43
69 0.43
70 0.48
71 0.49
72 0.5
73 0.52
74 0.6
75 0.61
76 0.6
77 0.58
78 0.51
79 0.49
80 0.42
81 0.36
82 0.3
83 0.28
84 0.28
85 0.28
86 0.27
87 0.25
88 0.25
89 0.24
90 0.24
91 0.2
92 0.17
93 0.16
94 0.15
95 0.16
96 0.16
97 0.2
98 0.17
99 0.16
100 0.18
101 0.19
102 0.2
103 0.19
104 0.17
105 0.14
106 0.19
107 0.19
108 0.17
109 0.23
110 0.26
111 0.31
112 0.37
113 0.37
114 0.37
115 0.41
116 0.49
117 0.53
118 0.58
119 0.56
120 0.55
121 0.61
122 0.61
123 0.57
124 0.48
125 0.4
126 0.36
127 0.34
128 0.3
129 0.28
130 0.27
131 0.31
132 0.37
133 0.39
134 0.41
135 0.5
136 0.59
137 0.63
138 0.7
139 0.76
140 0.81
141 0.85
142 0.87
143 0.86
144 0.83
145 0.83
146 0.82
147 0.8
148 0.79
149 0.75
150 0.72
151 0.72
152 0.7
153 0.61
154 0.61
155 0.56
156 0.52
157 0.5
158 0.46
159 0.38
160 0.36
161 0.37
162 0.29
163 0.24
164 0.19
165 0.18
166 0.16
167 0.14
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.05
186 0.04
187 0.03
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.06
197 0.07
198 0.13
199 0.21
200 0.27
201 0.34
202 0.4
203 0.4
204 0.39
205 0.39
206 0.34
207 0.26
208 0.19
209 0.13
210 0.07
211 0.07
212 0.05
213 0.05
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.11
236 0.17
237 0.26
238 0.32
239 0.33
240 0.34
241 0.35
242 0.41
243 0.45
244 0.46
245 0.45
246 0.44
247 0.44
248 0.46
249 0.48
250 0.48
251 0.46
252 0.45
253 0.46
254 0.5
255 0.58
256 0.65
257 0.73
258 0.77
259 0.8
260 0.85
261 0.84
262 0.83
263 0.84
264 0.81
265 0.74
266 0.68
267 0.66
268 0.59
269 0.57
270 0.55
271 0.52
272 0.51
273 0.49
274 0.45
275 0.37
276 0.31
277 0.26
278 0.23
279 0.17
280 0.14
281 0.13
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.16
286 0.16
287 0.21
288 0.19
289 0.2
290 0.21
291 0.28
292 0.32
293 0.35
294 0.35
295 0.34
296 0.38
297 0.38
298 0.41
299 0.38
300 0.38
301 0.38
302 0.42
303 0.37
304 0.34
305 0.32
306 0.31
307 0.27
308 0.25
309 0.22
310 0.18
311 0.18
312 0.16
313 0.15
314 0.11
315 0.1
316 0.13
317 0.14
318 0.15
319 0.21
320 0.25
321 0.29
322 0.36
323 0.44
324 0.47
325 0.51
326 0.57
327 0.55
328 0.54
329 0.51
330 0.44
331 0.34
332 0.28
333 0.24
334 0.16
335 0.12
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.03
359 0.04
360 0.07
361 0.09
362 0.1
363 0.11
364 0.14
365 0.16
366 0.18
367 0.27
368 0.32
369 0.41
370 0.4
371 0.43
372 0.4
373 0.45
374 0.47
375 0.39
376 0.4
377 0.35
378 0.41
379 0.4
380 0.43
381 0.38
382 0.43
383 0.5
384 0.47
385 0.47
386 0.44
387 0.44
388 0.42
389 0.41
390 0.34
391 0.28
392 0.23
393 0.18
394 0.16
395 0.14
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.09
400 0.11
401 0.13
402 0.13
403 0.12
404 0.12
405 0.13
406 0.15
407 0.18
408 0.18
409 0.16
410 0.17
411 0.18
412 0.19
413 0.19
414 0.23
415 0.23
416 0.2
417 0.2
418 0.2
419 0.21
420 0.2
421 0.19
422 0.12
423 0.1
424 0.1
425 0.09
426 0.1
427 0.08
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.12
444 0.11
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.11
449 0.11
450 0.1
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.05
456 0.07
457 0.09
458 0.1
459 0.12
460 0.15
461 0.16
462 0.17
463 0.18
464 0.18
465 0.17
466 0.16
467 0.15
468 0.13
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.09
473 0.09
474 0.11
475 0.14
476 0.2
477 0.24
478 0.26
479 0.29
480 0.31
481 0.34
482 0.34
483 0.32
484 0.31
485 0.28
486 0.28
487 0.32
488 0.38
489 0.4
490 0.41
491 0.44
492 0.48
493 0.56
494 0.65
495 0.67
496 0.67
497 0.72
498 0.75
499 0.77
500 0.71
501 0.68
502 0.61
503 0.56