Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XC43

Protein Details
Accession F0XC43    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-416EERALERERLRKQKRDNELNALDHydrophilic
421-443KKYLEREREKEIRRSSKRTTMRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
402-408RLRKQKR
419-438AQKKYLEREREKEIRRSSKR
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 9, mito 6, nucl 4, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MAQFLNNMFGGAKSAASPVPSGDSDFADFAQATAAAVSGAAAAAASAAGTPAVTAPPYTKWYNVHERYTLNDFRNEGLIFVVMAVVFTVHLIGSRRNRSKAHAWFRAHAKLLTSEFALVGFGSAPHPMTDLADEAAAVEELAKKTEAADPKTLMKENSLFEYATYATGRQNVAFVDVKLELVKRFNPFVTFAESILSFFIDSVTAPTDVLSATLYSFDGKEALTVPRYSAVGVGKSTYDGFVWAIVNKERMKGVRDERFDVSLTFTKDNAKLPAWLTVMSESAEITDALLTPELIQAVEAAGEDLDYIIISDQPVIKPVTIDETAPRKRVFLKYRLPANNNYETLLPIFAYFLRSADVLVQSAHLRPEVLRKVKNIREETVRQIKKADEDEKAEERALERERLRKQKRDNELNALDAKAQKKYLEREREKEIRRSSKRTTMRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.13
6 0.16
7 0.17
8 0.18
9 0.18
10 0.19
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.16
15 0.16
16 0.13
17 0.12
18 0.1
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.04
26 0.04
27 0.03
28 0.03
29 0.03
30 0.03
31 0.03
32 0.03
33 0.02
34 0.03
35 0.03
36 0.03
37 0.03
38 0.04
39 0.05
40 0.06
41 0.06
42 0.08
43 0.12
44 0.17
45 0.19
46 0.22
47 0.25
48 0.33
49 0.43
50 0.47
51 0.49
52 0.48
53 0.47
54 0.49
55 0.53
56 0.52
57 0.44
58 0.42
59 0.38
60 0.35
61 0.38
62 0.33
63 0.25
64 0.19
65 0.16
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.03
74 0.03
75 0.04
76 0.03
77 0.05
78 0.07
79 0.14
80 0.22
81 0.32
82 0.38
83 0.43
84 0.45
85 0.5
86 0.58
87 0.62
88 0.64
89 0.64
90 0.62
91 0.63
92 0.67
93 0.67
94 0.59
95 0.5
96 0.42
97 0.36
98 0.34
99 0.29
100 0.24
101 0.18
102 0.15
103 0.14
104 0.13
105 0.08
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.14
133 0.19
134 0.2
135 0.24
136 0.25
137 0.29
138 0.32
139 0.32
140 0.28
141 0.25
142 0.25
143 0.23
144 0.24
145 0.21
146 0.18
147 0.16
148 0.18
149 0.16
150 0.13
151 0.13
152 0.1
153 0.1
154 0.13
155 0.13
156 0.11
157 0.12
158 0.1
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.1
168 0.11
169 0.14
170 0.14
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.18
175 0.18
176 0.22
177 0.2
178 0.18
179 0.18
180 0.17
181 0.16
182 0.13
183 0.12
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.15
237 0.16
238 0.18
239 0.22
240 0.29
241 0.33
242 0.35
243 0.38
244 0.38
245 0.38
246 0.36
247 0.3
248 0.26
249 0.22
250 0.22
251 0.2
252 0.19
253 0.2
254 0.22
255 0.24
256 0.23
257 0.2
258 0.19
259 0.19
260 0.23
261 0.21
262 0.19
263 0.18
264 0.16
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.04
298 0.05
299 0.07
300 0.07
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.18
310 0.26
311 0.3
312 0.34
313 0.34
314 0.31
315 0.35
316 0.44
317 0.46
318 0.46
319 0.52
320 0.56
321 0.65
322 0.71
323 0.7
324 0.68
325 0.68
326 0.65
327 0.57
328 0.5
329 0.4
330 0.33
331 0.3
332 0.23
333 0.16
334 0.09
335 0.1
336 0.09
337 0.11
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.12
344 0.13
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.14
350 0.15
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.21
355 0.29
356 0.35
357 0.38
358 0.43
359 0.52
360 0.57
361 0.66
362 0.62
363 0.57
364 0.58
365 0.59
366 0.62
367 0.64
368 0.61
369 0.53
370 0.51
371 0.48
372 0.46
373 0.5
374 0.46
375 0.4
376 0.43
377 0.48
378 0.49
379 0.48
380 0.42
381 0.35
382 0.31
383 0.32
384 0.3
385 0.31
386 0.32
387 0.39
388 0.48
389 0.58
390 0.65
391 0.68
392 0.75
393 0.78
394 0.84
395 0.87
396 0.84
397 0.83
398 0.78
399 0.73
400 0.65
401 0.56
402 0.49
403 0.43
404 0.39
405 0.33
406 0.32
407 0.31
408 0.35
409 0.43
410 0.5
411 0.56
412 0.62
413 0.63
414 0.71
415 0.77
416 0.77
417 0.78
418 0.78
419 0.78
420 0.78
421 0.81
422 0.79
423 0.8