Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XHM1

Protein Details
Accession F0XHM1    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-327EATEEKRRRREYRQTRKDQFKRPDPGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-65KIPKGAKSATGKASPPPPKRER
286-294KAKKLAKRL
305-318EEKRRRREYRQTRK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 7.5, cyto_mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MADDDLSDTSSLSSLSSLSSAPSDDEADIQLRQEKGGILKFFHKIPKGAKSATGKASPPPPKRERAASPPHEYVLADNQDIAFIVMFRNRLVEAFPKSLATFGPQELERDVVDSVPGERVEHFLCALLKLLLNRQQDVKPGHYNRALEEAVQSHSSQWVAAWKDNPLAGGKTFASMTPSERLTLLRALILWAMASSKIVHDIIDHAYKGKRNEDDSNVAMSIQPWGSDSDKRRYFLIEGRDDTAFRVYRESNPAGFINRTWRSVAGSIDETRTLIEKLETGDGGPKAKKLAKRLSDEIPRFEATEEKRRRREYRQTRKDQFKRPDPGFSVYEGRTRGKRIKYTYSDDEDFLTDSTGRRRSGRNSAVAEHSGPTTTASGRQVRAPNRLNASTGAGGDGVTSSATSVQGDGDVDMDDVSVGPTGRPRRSAAVNHSMNGWAQKKTKEVYDEYDSAAEDNESEPDLGDDEEDEEDEGQEDEDEDDEDDEDKEFDEDKDAALDAEDEELEQELEQELEQEQEQDARRSTVVKLPVSAVLDKETGKWLKSEGKADVKAPTKAEEGEKGVPLDVPTIAVATVLSCRKSPDKALQAGRPDAVGLSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.13
10 0.14
11 0.13
12 0.14
13 0.15
14 0.16
15 0.16
16 0.16
17 0.2
18 0.18
19 0.18
20 0.18
21 0.19
22 0.22
23 0.29
24 0.29
25 0.27
26 0.32
27 0.35
28 0.38
29 0.43
30 0.42
31 0.41
32 0.45
33 0.51
34 0.52
35 0.51
36 0.54
37 0.54
38 0.57
39 0.58
40 0.56
41 0.48
42 0.47
43 0.55
44 0.58
45 0.58
46 0.62
47 0.62
48 0.65
49 0.69
50 0.72
51 0.69
52 0.69
53 0.72
54 0.7
55 0.71
56 0.67
57 0.62
58 0.55
59 0.47
60 0.4
61 0.37
62 0.32
63 0.24
64 0.22
65 0.21
66 0.19
67 0.19
68 0.17
69 0.08
70 0.06
71 0.07
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.14
79 0.19
80 0.22
81 0.24
82 0.25
83 0.25
84 0.25
85 0.25
86 0.23
87 0.2
88 0.17
89 0.15
90 0.19
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.2
95 0.16
96 0.15
97 0.15
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.18
118 0.23
119 0.24
120 0.26
121 0.28
122 0.29
123 0.35
124 0.38
125 0.38
126 0.4
127 0.42
128 0.47
129 0.47
130 0.46
131 0.41
132 0.43
133 0.37
134 0.28
135 0.27
136 0.22
137 0.2
138 0.2
139 0.19
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.12
144 0.1
145 0.14
146 0.15
147 0.18
148 0.19
149 0.19
150 0.21
151 0.21
152 0.22
153 0.18
154 0.17
155 0.14
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.17
171 0.14
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.09
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.1
189 0.12
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.17
194 0.2
195 0.23
196 0.26
197 0.26
198 0.28
199 0.33
200 0.36
201 0.38
202 0.36
203 0.35
204 0.3
205 0.27
206 0.22
207 0.17
208 0.14
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.09
213 0.11
214 0.17
215 0.21
216 0.29
217 0.32
218 0.33
219 0.33
220 0.33
221 0.34
222 0.33
223 0.36
224 0.32
225 0.3
226 0.31
227 0.31
228 0.3
229 0.28
230 0.27
231 0.2
232 0.15
233 0.17
234 0.16
235 0.19
236 0.25
237 0.26
238 0.22
239 0.23
240 0.24
241 0.22
242 0.21
243 0.19
244 0.22
245 0.21
246 0.22
247 0.2
248 0.2
249 0.2
250 0.21
251 0.21
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.13
258 0.11
259 0.12
260 0.1
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.1
269 0.11
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.14
274 0.18
275 0.21
276 0.25
277 0.33
278 0.37
279 0.42
280 0.45
281 0.49
282 0.54
283 0.53
284 0.48
285 0.42
286 0.36
287 0.31
288 0.27
289 0.26
290 0.21
291 0.3
292 0.36
293 0.4
294 0.46
295 0.53
296 0.58
297 0.62
298 0.69
299 0.7
300 0.73
301 0.77
302 0.81
303 0.83
304 0.89
305 0.88
306 0.87
307 0.84
308 0.82
309 0.8
310 0.71
311 0.68
312 0.6
313 0.56
314 0.47
315 0.4
316 0.35
317 0.28
318 0.29
319 0.26
320 0.25
321 0.23
322 0.26
323 0.3
324 0.32
325 0.37
326 0.39
327 0.46
328 0.49
329 0.54
330 0.56
331 0.55
332 0.51
333 0.45
334 0.4
335 0.32
336 0.27
337 0.2
338 0.15
339 0.09
340 0.09
341 0.13
342 0.16
343 0.17
344 0.19
345 0.23
346 0.27
347 0.36
348 0.41
349 0.43
350 0.41
351 0.43
352 0.43
353 0.41
354 0.36
355 0.27
356 0.22
357 0.16
358 0.13
359 0.11
360 0.09
361 0.08
362 0.11
363 0.14
364 0.18
365 0.18
366 0.24
367 0.29
368 0.33
369 0.41
370 0.42
371 0.43
372 0.44
373 0.44
374 0.4
375 0.35
376 0.33
377 0.25
378 0.21
379 0.17
380 0.12
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.03
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.04
406 0.05
407 0.1
408 0.17
409 0.19
410 0.21
411 0.23
412 0.27
413 0.33
414 0.39
415 0.41
416 0.46
417 0.46
418 0.43
419 0.42
420 0.39
421 0.34
422 0.34
423 0.29
424 0.23
425 0.25
426 0.27
427 0.3
428 0.32
429 0.35
430 0.34
431 0.34
432 0.36
433 0.38
434 0.37
435 0.34
436 0.33
437 0.29
438 0.24
439 0.21
440 0.15
441 0.09
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.12
481 0.12
482 0.11
483 0.1
484 0.1
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.06
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.09
503 0.14
504 0.17
505 0.19
506 0.21
507 0.21
508 0.22
509 0.23
510 0.25
511 0.26
512 0.31
513 0.29
514 0.29
515 0.28
516 0.31
517 0.33
518 0.31
519 0.26
520 0.22
521 0.22
522 0.21
523 0.21
524 0.25
525 0.24
526 0.24
527 0.23
528 0.25
529 0.31
530 0.36
531 0.4
532 0.4
533 0.46
534 0.48
535 0.49
536 0.53
537 0.5
538 0.49
539 0.45
540 0.41
541 0.35
542 0.35
543 0.37
544 0.34
545 0.35
546 0.34
547 0.35
548 0.33
549 0.3
550 0.28
551 0.25
552 0.22
553 0.16
554 0.13
555 0.11
556 0.1
557 0.1
558 0.08
559 0.08
560 0.07
561 0.12
562 0.15
563 0.16
564 0.17
565 0.22
566 0.26
567 0.31
568 0.37
569 0.42
570 0.48
571 0.55
572 0.62
573 0.64
574 0.67
575 0.66
576 0.6
577 0.49
578 0.41