Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XJ12

Protein Details
Accession F0XJ12    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-112SEINAVPKPRRGPKKKKAPLHTPPPRQVAQHydrophilic
505-534LGRLIRPVYKPHKQKKEKAKGKGKGRADEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-102PKPRRGPKKKKAPL
512-530VYKPHKQKKEKAKGKGKGR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 10, mito 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSRTQLARLIDLPDDALQQVLDYSLTLSKADAVDHFKNLLGDSPAAVAFIADFNGRRHDPAGPSAAATAAKDVSPAATASRSSEINAVPKPRRGPKKKKAPLHTPPPRQVAQLAPHPGSAYSKKDVEDDYMVSRSGAVQAGASTTPPQQQQQQQRKPPSAAGSMIQDALQPKAKGSKAVTTSSRTNSKTQPAARITITGGTAMQGASTALADFDAAIRALEISTNPTLASGGSDGVQDVATRRCHCVATRHPLQTAAPNCLHCGKVICLKEGLGPCTFCGQPLLAADEVQAMIRELREQRGREKMAADKAAHRRPDVAGAAKPYARPTMIAGSVKWGGDDAEFVSLAEAQTQARAHRDRLLAFQAENAQRTTVRDEAADFDVGEAMALAAAGGSGAGAAAQNLWATPEERARALRRQQKLLREMEWNARPEYEKRRQVLSIDLAGRKVFKKTVAAERPPSSLSEDGTDSDGDDGLGLGGFDAGTGADASGDGAGAGGTFSKNPLLGRLIRPVYKPHKQKKEKAKGKGKGRADEEADDDDDESAAPLPGRKDDPEAASRWQRVQDDLNDNEAVILDGGIYGTGGTDEPGRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.16
3 0.14
4 0.11
5 0.1
6 0.09
7 0.08
8 0.07
9 0.06
10 0.07
11 0.09
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.13
16 0.13
17 0.14
18 0.17
19 0.22
20 0.24
21 0.26
22 0.27
23 0.25
24 0.26
25 0.25
26 0.25
27 0.2
28 0.17
29 0.16
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.14
34 0.1
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.07
39 0.09
40 0.11
41 0.18
42 0.19
43 0.2
44 0.21
45 0.26
46 0.28
47 0.31
48 0.34
49 0.28
50 0.28
51 0.27
52 0.26
53 0.22
54 0.19
55 0.16
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.14
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.2
71 0.2
72 0.25
73 0.29
74 0.34
75 0.36
76 0.41
77 0.48
78 0.54
79 0.63
80 0.68
81 0.75
82 0.77
83 0.84
84 0.88
85 0.9
86 0.9
87 0.9
88 0.89
89 0.89
90 0.89
91 0.88
92 0.86
93 0.82
94 0.74
95 0.65
96 0.57
97 0.52
98 0.47
99 0.45
100 0.42
101 0.37
102 0.36
103 0.34
104 0.32
105 0.31
106 0.3
107 0.27
108 0.26
109 0.27
110 0.27
111 0.29
112 0.3
113 0.29
114 0.27
115 0.24
116 0.23
117 0.22
118 0.22
119 0.19
120 0.18
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.11
132 0.14
133 0.16
134 0.18
135 0.24
136 0.32
137 0.42
138 0.52
139 0.6
140 0.65
141 0.71
142 0.74
143 0.7
144 0.66
145 0.6
146 0.52
147 0.43
148 0.36
149 0.3
150 0.26
151 0.24
152 0.2
153 0.17
154 0.14
155 0.15
156 0.18
157 0.15
158 0.15
159 0.21
160 0.22
161 0.25
162 0.26
163 0.31
164 0.3
165 0.35
166 0.37
167 0.35
168 0.39
169 0.4
170 0.45
171 0.41
172 0.42
173 0.42
174 0.44
175 0.47
176 0.46
177 0.49
178 0.44
179 0.45
180 0.41
181 0.37
182 0.32
183 0.26
184 0.23
185 0.15
186 0.12
187 0.09
188 0.09
189 0.07
190 0.06
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.1
227 0.13
228 0.15
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.21
233 0.27
234 0.31
235 0.37
236 0.43
237 0.43
238 0.42
239 0.42
240 0.41
241 0.39
242 0.33
243 0.29
244 0.24
245 0.22
246 0.23
247 0.24
248 0.23
249 0.16
250 0.17
251 0.14
252 0.19
253 0.19
254 0.19
255 0.18
256 0.18
257 0.21
258 0.21
259 0.21
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.16
264 0.16
265 0.12
266 0.11
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.11
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.07
282 0.07
283 0.12
284 0.17
285 0.18
286 0.22
287 0.29
288 0.31
289 0.3
290 0.31
291 0.31
292 0.31
293 0.33
294 0.3
295 0.3
296 0.36
297 0.4
298 0.4
299 0.35
300 0.33
301 0.29
302 0.32
303 0.27
304 0.22
305 0.19
306 0.19
307 0.21
308 0.2
309 0.2
310 0.17
311 0.16
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.13
316 0.15
317 0.16
318 0.14
319 0.16
320 0.18
321 0.17
322 0.15
323 0.12
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.07
338 0.08
339 0.09
340 0.14
341 0.16
342 0.17
343 0.22
344 0.25
345 0.24
346 0.26
347 0.29
348 0.25
349 0.23
350 0.23
351 0.24
352 0.24
353 0.24
354 0.21
355 0.18
356 0.17
357 0.19
358 0.21
359 0.16
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.16
364 0.17
365 0.16
366 0.12
367 0.1
368 0.1
369 0.09
370 0.08
371 0.05
372 0.03
373 0.03
374 0.02
375 0.02
376 0.02
377 0.02
378 0.02
379 0.01
380 0.01
381 0.01
382 0.01
383 0.02
384 0.02
385 0.02
386 0.02
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.05
392 0.06
393 0.08
394 0.11
395 0.13
396 0.14
397 0.19
398 0.22
399 0.29
400 0.38
401 0.44
402 0.46
403 0.55
404 0.59
405 0.63
406 0.66
407 0.63
408 0.57
409 0.53
410 0.51
411 0.5
412 0.5
413 0.44
414 0.38
415 0.35
416 0.34
417 0.35
418 0.41
419 0.43
420 0.45
421 0.45
422 0.48
423 0.48
424 0.47
425 0.48
426 0.42
427 0.38
428 0.36
429 0.35
430 0.32
431 0.31
432 0.32
433 0.27
434 0.25
435 0.21
436 0.18
437 0.23
438 0.28
439 0.38
440 0.44
441 0.49
442 0.53
443 0.54
444 0.54
445 0.49
446 0.45
447 0.38
448 0.3
449 0.25
450 0.21
451 0.19
452 0.18
453 0.18
454 0.17
455 0.13
456 0.12
457 0.11
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.04
472 0.03
473 0.03
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.06
487 0.07
488 0.09
489 0.09
490 0.13
491 0.17
492 0.21
493 0.25
494 0.33
495 0.36
496 0.39
497 0.41
498 0.47
499 0.51
500 0.56
501 0.63
502 0.65
503 0.72
504 0.78
505 0.85
506 0.87
507 0.9
508 0.9
509 0.9
510 0.91
511 0.89
512 0.9
513 0.89
514 0.86
515 0.83
516 0.78
517 0.74
518 0.67
519 0.61
520 0.54
521 0.48
522 0.41
523 0.33
524 0.28
525 0.21
526 0.17
527 0.14
528 0.11
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.11
533 0.12
534 0.17
535 0.2
536 0.21
537 0.26
538 0.3
539 0.35
540 0.37
541 0.39
542 0.42
543 0.48
544 0.49
545 0.47
546 0.49
547 0.45
548 0.44
549 0.47
550 0.49
551 0.49
552 0.47
553 0.48
554 0.42
555 0.4
556 0.36
557 0.29
558 0.2
559 0.12
560 0.1
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.04
566 0.04
567 0.03
568 0.04
569 0.04
570 0.05