Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XSK4

Protein Details
Accession F0XSK4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-214AAAAASSRRNRKRRRGGDGGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-209SRRNRKRRRG
Subcellular Location(s) cyto 12, mito 7, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028036  DUF4536  
IPR025721  Exosome_cplx_N_dom  
IPR026699  Exosome_RNA_bind1/RRP40/RRP4  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF15055  DUF4536  
PF14382  ECR1_N  
CDD cd05789  S1_Rrp4  
Amino Acid Sequences MAGDKIPTLASLERPEKYQNLLKEDRGDDCLPCRVIGGGAFLGLGAYSYISGQAQLEQQRAAILQSKSMFGMRSRKFGITGISLGLVWLGVWRLFALGDSAGDLTHCTIYWKSLRTSSSVDDDHIPANLILRYKHRDRPSTGTRKELCLRTYMPITILRPERPAARRFVAAANDGSDDSDASDNGGASVGRAAAAAAASSRRNRKRRRGGDGGDEIVTPGEVVTEDAKWMRGHGTYADESGAGIVSSLAGTVMRTNRLLSVRPLRARYAPEVGDLVVGRIVEVQARRWRVDVGAAQLAALPLSAINLPGGVLRKRTETDELQIRSFFAEGDLLLAEVQQIFADGAAVLHTRSLRYGKLRNGVFAAVAGGGAGAGAGVVRARRQLWTIGRGGGGGDGGGLDDDDDDDDAQNEMLHDHGHETSHVVSALGTGAGKIDVILGVNGYVFIGAHVAPPSPDAAVDAAGDAGRSATHTSHASHAAPGPPSAVGLNNMEEAVSAAIYSSQNDPVSRETMREIARLRSVVSMLVEHRLPIDEPMVMRAYREAIDLAHLTPDQADDDVYLGGDRGDKLAAVLAGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.38
3 0.37
4 0.41
5 0.44
6 0.42
7 0.45
8 0.49
9 0.5
10 0.53
11 0.53
12 0.49
13 0.49
14 0.44
15 0.38
16 0.36
17 0.39
18 0.32
19 0.3
20 0.27
21 0.22
22 0.21
23 0.19
24 0.19
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.04
33 0.04
34 0.04
35 0.04
36 0.06
37 0.06
38 0.07
39 0.07
40 0.1
41 0.15
42 0.19
43 0.21
44 0.2
45 0.2
46 0.2
47 0.2
48 0.2
49 0.22
50 0.18
51 0.21
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.25
56 0.25
57 0.22
58 0.32
59 0.3
60 0.35
61 0.38
62 0.38
63 0.38
64 0.38
65 0.37
66 0.3
67 0.28
68 0.23
69 0.2
70 0.18
71 0.16
72 0.14
73 0.1
74 0.06
75 0.05
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.09
96 0.14
97 0.19
98 0.22
99 0.23
100 0.28
101 0.29
102 0.31
103 0.34
104 0.33
105 0.34
106 0.31
107 0.31
108 0.28
109 0.28
110 0.25
111 0.21
112 0.2
113 0.13
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.19
119 0.26
120 0.31
121 0.39
122 0.44
123 0.49
124 0.53
125 0.6
126 0.66
127 0.7
128 0.67
129 0.68
130 0.63
131 0.63
132 0.64
133 0.6
134 0.5
135 0.44
136 0.43
137 0.37
138 0.38
139 0.31
140 0.27
141 0.26
142 0.26
143 0.27
144 0.29
145 0.27
146 0.27
147 0.28
148 0.34
149 0.35
150 0.38
151 0.37
152 0.35
153 0.35
154 0.34
155 0.36
156 0.31
157 0.28
158 0.25
159 0.2
160 0.19
161 0.17
162 0.16
163 0.12
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.06
185 0.08
186 0.13
187 0.23
188 0.32
189 0.41
190 0.51
191 0.62
192 0.71
193 0.78
194 0.82
195 0.83
196 0.78
197 0.77
198 0.72
199 0.63
200 0.52
201 0.43
202 0.34
203 0.24
204 0.19
205 0.1
206 0.06
207 0.04
208 0.03
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.14
222 0.13
223 0.14
224 0.13
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.08
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.02
236 0.02
237 0.03
238 0.05
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.12
244 0.14
245 0.15
246 0.18
247 0.25
248 0.29
249 0.33
250 0.34
251 0.33
252 0.35
253 0.36
254 0.34
255 0.3
256 0.25
257 0.22
258 0.2
259 0.18
260 0.16
261 0.13
262 0.1
263 0.07
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.1
271 0.15
272 0.17
273 0.17
274 0.18
275 0.18
276 0.17
277 0.19
278 0.17
279 0.15
280 0.15
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.12
285 0.09
286 0.07
287 0.04
288 0.02
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.05
296 0.08
297 0.08
298 0.1
299 0.11
300 0.13
301 0.14
302 0.16
303 0.19
304 0.19
305 0.23
306 0.29
307 0.3
308 0.28
309 0.28
310 0.25
311 0.21
312 0.2
313 0.15
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.08
339 0.1
340 0.12
341 0.18
342 0.24
343 0.28
344 0.35
345 0.35
346 0.35
347 0.35
348 0.32
349 0.26
350 0.2
351 0.15
352 0.08
353 0.07
354 0.05
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.02
359 0.02
360 0.01
361 0.01
362 0.02
363 0.02
364 0.03
365 0.04
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.1
370 0.17
371 0.2
372 0.25
373 0.26
374 0.26
375 0.25
376 0.24
377 0.22
378 0.16
379 0.12
380 0.07
381 0.05
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.02
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.07
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.06
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.03
432 0.03
433 0.04
434 0.04
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.09
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.04
454 0.05
455 0.07
456 0.07
457 0.1
458 0.12
459 0.14
460 0.17
461 0.21
462 0.21
463 0.21
464 0.24
465 0.25
466 0.24
467 0.23
468 0.21
469 0.17
470 0.17
471 0.15
472 0.13
473 0.12
474 0.12
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.12
479 0.11
480 0.11
481 0.09
482 0.06
483 0.05
484 0.04
485 0.07
486 0.07
487 0.09
488 0.11
489 0.15
490 0.17
491 0.18
492 0.2
493 0.21
494 0.25
495 0.24
496 0.23
497 0.22
498 0.27
499 0.28
500 0.31
501 0.31
502 0.32
503 0.36
504 0.35
505 0.33
506 0.29
507 0.27
508 0.24
509 0.22
510 0.21
511 0.17
512 0.2
513 0.19
514 0.17
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.15
519 0.16
520 0.14
521 0.14
522 0.18
523 0.2
524 0.18
525 0.18
526 0.18
527 0.19
528 0.17
529 0.18
530 0.15
531 0.12
532 0.16
533 0.17
534 0.16
535 0.16
536 0.16
537 0.15
538 0.14
539 0.15
540 0.13
541 0.12
542 0.11
543 0.08
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.1
554 0.09
555 0.1
556 0.12