Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R852

Protein Details
Accession C4R852    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-379EAKGYPPPIIEKKKKEKKVKNKGTRYPVDSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-371EKKKKEKKVKNKG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15.333, cyto 14, nucl 12.5, mito_nucl 7.332, cyto_pero 7.332
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR023617  Tyr-tRNA-ligase_arc/euk-type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
KEGG ppa:PAS_chr4_0522  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MSGVLTDPQEQYDLITKNLQEVLNPQIIKDVLEKEKRPLKLYWGTAPTGRPHCGYFVPMTKLAHFLKAGCEVKVLLADLHAYLDNMKAPLEVVAYRAKYYEFVIKAILRSINVPIEKLTFVTGSSYQLTPEYTMDIFRISNSVSQNDAKRAGADVVKQVANPLLSGLIYPLMQALDEEHLKVDAQFGGVDQRKIFVLAEENLQSLGYKKRAHLMNPMVPGLAQGGKMSASDPNSKVDVIEEPKSVKKKINTAFCAPGNVEENGLLSFVEYVLAPIYELKHGSGFQFHIDRPEKYGGPVDYSSFEELKQAFKDEKLAPPDLKSGVADAINELLLPIREEFANNKEFQEAEAKGYPPPIIEKKKKEKKVKNKGTRYPVDSTANKTAVQPDVQSTTESLENTTLESK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.24
4 0.27
5 0.32
6 0.29
7 0.23
8 0.24
9 0.28
10 0.3
11 0.3
12 0.26
13 0.26
14 0.26
15 0.27
16 0.28
17 0.29
18 0.31
19 0.39
20 0.41
21 0.45
22 0.53
23 0.55
24 0.55
25 0.5
26 0.5
27 0.5
28 0.53
29 0.53
30 0.5
31 0.49
32 0.48
33 0.49
34 0.48
35 0.45
36 0.42
37 0.36
38 0.33
39 0.33
40 0.31
41 0.32
42 0.29
43 0.3
44 0.33
45 0.35
46 0.35
47 0.33
48 0.38
49 0.35
50 0.33
51 0.28
52 0.24
53 0.23
54 0.31
55 0.32
56 0.25
57 0.25
58 0.22
59 0.22
60 0.22
61 0.19
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.09
79 0.1
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.16
86 0.18
87 0.23
88 0.18
89 0.18
90 0.21
91 0.22
92 0.22
93 0.24
94 0.23
95 0.16
96 0.16
97 0.18
98 0.2
99 0.19
100 0.19
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.1
107 0.1
108 0.12
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.08
127 0.12
128 0.13
129 0.14
130 0.15
131 0.19
132 0.21
133 0.23
134 0.24
135 0.2
136 0.19
137 0.19
138 0.18
139 0.16
140 0.16
141 0.15
142 0.17
143 0.17
144 0.16
145 0.16
146 0.15
147 0.13
148 0.12
149 0.09
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.12
175 0.13
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.14
182 0.07
183 0.09
184 0.09
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.11
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.21
197 0.23
198 0.25
199 0.32
200 0.35
201 0.36
202 0.36
203 0.36
204 0.29
205 0.27
206 0.25
207 0.18
208 0.13
209 0.08
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.14
218 0.15
219 0.17
220 0.18
221 0.18
222 0.17
223 0.16
224 0.17
225 0.16
226 0.18
227 0.17
228 0.18
229 0.23
230 0.26
231 0.27
232 0.28
233 0.28
234 0.35
235 0.41
236 0.48
237 0.48
238 0.5
239 0.53
240 0.48
241 0.47
242 0.38
243 0.33
244 0.26
245 0.22
246 0.18
247 0.12
248 0.12
249 0.1
250 0.1
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.13
270 0.12
271 0.14
272 0.17
273 0.17
274 0.24
275 0.28
276 0.28
277 0.29
278 0.33
279 0.3
280 0.28
281 0.34
282 0.26
283 0.27
284 0.27
285 0.24
286 0.21
287 0.23
288 0.24
289 0.19
290 0.18
291 0.18
292 0.17
293 0.19
294 0.19
295 0.2
296 0.19
297 0.19
298 0.25
299 0.25
300 0.3
301 0.32
302 0.36
303 0.34
304 0.35
305 0.37
306 0.32
307 0.3
308 0.24
309 0.2
310 0.17
311 0.17
312 0.15
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.1
325 0.14
326 0.18
327 0.23
328 0.22
329 0.23
330 0.23
331 0.23
332 0.23
333 0.27
334 0.23
335 0.23
336 0.26
337 0.26
338 0.26
339 0.27
340 0.26
341 0.2
342 0.27
343 0.31
344 0.38
345 0.46
346 0.56
347 0.66
348 0.76
349 0.85
350 0.89
351 0.9
352 0.91
353 0.93
354 0.94
355 0.94
356 0.94
357 0.94
358 0.93
359 0.91
360 0.86
361 0.8
362 0.75
363 0.72
364 0.65
365 0.62
366 0.6
367 0.53
368 0.47
369 0.44
370 0.41
371 0.37
372 0.35
373 0.3
374 0.26
375 0.28
376 0.28
377 0.28
378 0.24
379 0.23
380 0.24
381 0.22
382 0.2
383 0.18
384 0.17