Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XAL1

Protein Details
Accession F0XAL1    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-38TGGDAKSKKKKVTIKEPSEKSRAKTHydrophilic
325-348QAARPGRERGTKRQPPREKLREMMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-37GKKRKRDGVTGGDAKSKKKKVTIKEPSEKSRAK
331-341RERGTKRQPPR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.5, cyto 9.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MAVPGKKRKRDGVTGGDAKSKKKKVTIKEPSEKSRAKTAKTIEVTSIIQPQFSAPVIGLVVPDAIEFDSFAQTSKSAKSLSKRSRPAKPSAELLLHSSSHHTVNYTGKEDKAPGSGAALRHYIGVLDPATGQLQVMEAKKMVIRGSVRAREASEDAMRGVSVKSTMMDLRNDLGQTFGTKKAKKAIQALTENAISTRKRREDGTFEAVAMGAADRAQLQSMQAATAAMSTRDELRETVDRAKPIPRGNFEAQEIQDVYVASEMIGADTLATVPVRDWQEAVRAGEDIQLYSRFVAQRVNQVAARADGLEQLRLLRYLYWVILYWQAARPGRERGTKRQPPREKLREMMDGAPEAIVEHIRQRFSDGGTIRKFQADLLITHCCAFACIIDGFEVNTYDLREDLKLEQQQIAQYFSEIGARNKIVKTDEAVSHVAKLALPLQFPNNMRMRRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.71
3 0.7
4 0.64
5 0.62
6 0.63
7 0.61
8 0.56
9 0.58
10 0.64
11 0.66
12 0.75
13 0.79
14 0.8
15 0.83
16 0.86
17 0.85
18 0.86
19 0.81
20 0.73
21 0.73
22 0.69
23 0.62
24 0.61
25 0.59
26 0.59
27 0.59
28 0.57
29 0.48
30 0.46
31 0.44
32 0.38
33 0.41
34 0.31
35 0.26
36 0.24
37 0.23
38 0.21
39 0.19
40 0.17
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.06
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.13
61 0.14
62 0.16
63 0.17
64 0.21
65 0.29
66 0.39
67 0.48
68 0.56
69 0.64
70 0.69
71 0.76
72 0.77
73 0.79
74 0.76
75 0.7
76 0.64
77 0.59
78 0.55
79 0.45
80 0.43
81 0.37
82 0.29
83 0.26
84 0.24
85 0.21
86 0.2
87 0.19
88 0.16
89 0.17
90 0.22
91 0.25
92 0.27
93 0.27
94 0.27
95 0.28
96 0.29
97 0.27
98 0.23
99 0.21
100 0.16
101 0.17
102 0.19
103 0.18
104 0.19
105 0.18
106 0.16
107 0.15
108 0.15
109 0.12
110 0.09
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.06
120 0.06
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.15
131 0.2
132 0.28
133 0.32
134 0.32
135 0.32
136 0.32
137 0.3
138 0.3
139 0.28
140 0.21
141 0.17
142 0.16
143 0.14
144 0.13
145 0.11
146 0.1
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.1
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.13
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.11
161 0.09
162 0.1
163 0.12
164 0.17
165 0.22
166 0.24
167 0.25
168 0.32
169 0.35
170 0.38
171 0.43
172 0.43
173 0.43
174 0.45
175 0.45
176 0.4
177 0.37
178 0.33
179 0.26
180 0.23
181 0.16
182 0.16
183 0.22
184 0.22
185 0.24
186 0.27
187 0.3
188 0.33
189 0.39
190 0.42
191 0.35
192 0.32
193 0.3
194 0.27
195 0.23
196 0.16
197 0.09
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.1
222 0.13
223 0.15
224 0.21
225 0.22
226 0.22
227 0.23
228 0.27
229 0.29
230 0.31
231 0.34
232 0.3
233 0.35
234 0.36
235 0.37
236 0.35
237 0.34
238 0.29
239 0.27
240 0.24
241 0.18
242 0.16
243 0.14
244 0.12
245 0.08
246 0.08
247 0.05
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.16
266 0.19
267 0.19
268 0.15
269 0.13
270 0.13
271 0.16
272 0.15
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.13
279 0.1
280 0.11
281 0.15
282 0.16
283 0.23
284 0.25
285 0.28
286 0.25
287 0.26
288 0.26
289 0.22
290 0.21
291 0.13
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.21
313 0.22
314 0.24
315 0.26
316 0.3
317 0.35
318 0.41
319 0.45
320 0.49
321 0.58
322 0.65
323 0.72
324 0.76
325 0.8
326 0.81
327 0.87
328 0.86
329 0.81
330 0.76
331 0.72
332 0.68
333 0.61
334 0.55
335 0.46
336 0.37
337 0.31
338 0.26
339 0.2
340 0.14
341 0.11
342 0.09
343 0.07
344 0.12
345 0.15
346 0.16
347 0.16
348 0.2
349 0.21
350 0.22
351 0.29
352 0.25
353 0.31
354 0.34
355 0.36
356 0.34
357 0.34
358 0.32
359 0.25
360 0.29
361 0.23
362 0.2
363 0.22
364 0.25
365 0.24
366 0.25
367 0.25
368 0.18
369 0.16
370 0.15
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.15
389 0.22
390 0.26
391 0.28
392 0.3
393 0.31
394 0.34
395 0.33
396 0.33
397 0.26
398 0.22
399 0.2
400 0.18
401 0.22
402 0.2
403 0.2
404 0.24
405 0.25
406 0.3
407 0.3
408 0.33
409 0.3
410 0.3
411 0.32
412 0.32
413 0.33
414 0.32
415 0.35
416 0.32
417 0.31
418 0.3
419 0.26
420 0.2
421 0.19
422 0.19
423 0.18
424 0.19
425 0.2
426 0.22
427 0.28
428 0.29
429 0.36
430 0.4
431 0.45