Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XD49

Protein Details
Accession F0XD49    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
154-181VAVPQKRKYNKTGESKKKKKANVAPASAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-174KRKYNKTGESKKKKKA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MEPRARAGKNVGKMNFGYGELRQLLYGCGDVREPLPDTMRLLDEIATDFIQGLSFEAARVAHYAGRQKIKYEDFEFALRRNPLFLGKVREMFEMSKEVKDARKMPGIGEGNLGKADVNELAKLGGIGEDATREAGVRGATDGDGGGADGQGSTVAVPQKRKYNKTGESKKKKKANVAPASAVGADEGDDLADLDDDIDAELR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.4
3 0.34
4 0.28
5 0.2
6 0.24
7 0.21
8 0.21
9 0.18
10 0.17
11 0.16
12 0.14
13 0.15
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.11
19 0.14
20 0.15
21 0.16
22 0.18
23 0.18
24 0.2
25 0.2
26 0.21
27 0.19
28 0.17
29 0.15
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.11
50 0.17
51 0.22
52 0.28
53 0.28
54 0.29
55 0.34
56 0.36
57 0.39
58 0.35
59 0.33
60 0.28
61 0.31
62 0.3
63 0.26
64 0.28
65 0.24
66 0.21
67 0.19
68 0.18
69 0.16
70 0.18
71 0.2
72 0.21
73 0.22
74 0.26
75 0.26
76 0.26
77 0.25
78 0.23
79 0.21
80 0.19
81 0.18
82 0.15
83 0.14
84 0.15
85 0.16
86 0.19
87 0.2
88 0.19
89 0.22
90 0.22
91 0.22
92 0.28
93 0.28
94 0.24
95 0.25
96 0.22
97 0.17
98 0.17
99 0.17
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.04
112 0.03
113 0.04
114 0.03
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.06
141 0.1
142 0.13
143 0.18
144 0.22
145 0.31
146 0.4
147 0.45
148 0.49
149 0.55
150 0.61
151 0.68
152 0.75
153 0.77
154 0.81
155 0.86
156 0.89
157 0.87
158 0.85
159 0.84
160 0.83
161 0.83
162 0.82
163 0.78
164 0.72
165 0.65
166 0.6
167 0.49
168 0.39
169 0.28
170 0.18
171 0.11
172 0.08
173 0.07
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05