Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XMC6

Protein Details
Accession F0XMC6    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-222EYDPEERQNRRQNQRRDDRRGGSBasic
275-302RTWSRSQSRSRSRSRSRRHDVSRRSQADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-292RSRSRSRR
344-351RGRGRNGR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDFDIEMEDAAGGYPGEAAPYEATHHPDDMPRDDTDDILGTDADIDTRDGQEPGEIDEAVQAIDAADVAAEAIVPNKVHLRGLDTLTPDDLKAYFAEHAGGSGGFDRVEWIDDSSANLIFGSESSAAAAVTALCAMPIADATLLPMGELLPAKPYTAKAKSAADMATTSGPGLQVRFAVTSDKKQAGAASRSRFYLLHPEYDPEERQNRRQNQRRDDRRGGSGRGRDRDYRSKYRSYREEDDRAADIRNNSFDVNLYDDDAPALAARTSQTSRSRTWSRSQSRSRSRSRSRRHDVSRRSQADRELFPGKSKELFPHKVGGEGSTEDGRTTPTIVATAASGGRNRGRGRNGRLRSRSASPLHDDDDDYDGRRADARAIASSEAALRNRDKARTLKDRLSTTKPASESGSLELFPRKTIGMAQMDLLGGRDGAAALTSRLSDRITRPSNGEISKVTANGDANGSGSTFNIRGISRQQPGGGVGLSIKGAATARELFPDKFGGEGGNGNGHGSSSGRNAGKEIFSDRLENRTRPRQRAEDLFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.06
4 0.06
5 0.07
6 0.08
7 0.09
8 0.13
9 0.14
10 0.19
11 0.2
12 0.22
13 0.22
14 0.26
15 0.3
16 0.31
17 0.32
18 0.29
19 0.31
20 0.3
21 0.28
22 0.25
23 0.22
24 0.17
25 0.15
26 0.14
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.08
31 0.07
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.13
36 0.12
37 0.13
38 0.14
39 0.14
40 0.16
41 0.16
42 0.14
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.11
47 0.1
48 0.07
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.03
58 0.03
59 0.04
60 0.06
61 0.06
62 0.08
63 0.11
64 0.13
65 0.14
66 0.15
67 0.19
68 0.21
69 0.25
70 0.28
71 0.27
72 0.27
73 0.27
74 0.27
75 0.22
76 0.19
77 0.16
78 0.13
79 0.11
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.12
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.13
142 0.19
143 0.23
144 0.25
145 0.26
146 0.28
147 0.29
148 0.3
149 0.28
150 0.22
151 0.19
152 0.17
153 0.14
154 0.12
155 0.11
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.14
166 0.15
167 0.2
168 0.24
169 0.25
170 0.25
171 0.24
172 0.26
173 0.27
174 0.31
175 0.33
176 0.32
177 0.32
178 0.32
179 0.33
180 0.31
181 0.26
182 0.31
183 0.26
184 0.26
185 0.25
186 0.26
187 0.27
188 0.3
189 0.3
190 0.24
191 0.3
192 0.29
193 0.37
194 0.44
195 0.51
196 0.59
197 0.67
198 0.72
199 0.75
200 0.83
201 0.85
202 0.85
203 0.84
204 0.77
205 0.76
206 0.7
207 0.64
208 0.6
209 0.57
210 0.54
211 0.5
212 0.5
213 0.47
214 0.49
215 0.54
216 0.56
217 0.58
218 0.57
219 0.61
220 0.63
221 0.65
222 0.67
223 0.64
224 0.64
225 0.61
226 0.62
227 0.54
228 0.51
229 0.45
230 0.38
231 0.31
232 0.26
233 0.2
234 0.16
235 0.16
236 0.14
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.11
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.05
250 0.05
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.07
255 0.07
256 0.13
257 0.18
258 0.21
259 0.23
260 0.3
261 0.34
262 0.35
263 0.41
264 0.46
265 0.48
266 0.55
267 0.61
268 0.64
269 0.69
270 0.75
271 0.76
272 0.76
273 0.79
274 0.8
275 0.82
276 0.83
277 0.81
278 0.83
279 0.84
280 0.84
281 0.82
282 0.81
283 0.82
284 0.76
285 0.72
286 0.64
287 0.6
288 0.55
289 0.48
290 0.42
291 0.35
292 0.3
293 0.29
294 0.28
295 0.24
296 0.22
297 0.21
298 0.23
299 0.27
300 0.31
301 0.3
302 0.34
303 0.33
304 0.33
305 0.32
306 0.27
307 0.21
308 0.17
309 0.17
310 0.12
311 0.12
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.1
328 0.12
329 0.17
330 0.19
331 0.24
332 0.3
333 0.37
334 0.45
335 0.53
336 0.58
337 0.62
338 0.65
339 0.66
340 0.63
341 0.59
342 0.58
343 0.51
344 0.49
345 0.44
346 0.42
347 0.39
348 0.35
349 0.31
350 0.25
351 0.25
352 0.22
353 0.19
354 0.17
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.14
359 0.12
360 0.14
361 0.14
362 0.15
363 0.16
364 0.16
365 0.14
366 0.14
367 0.15
368 0.15
369 0.14
370 0.16
371 0.15
372 0.22
373 0.25
374 0.27
375 0.3
376 0.34
377 0.41
378 0.49
379 0.54
380 0.54
381 0.57
382 0.61
383 0.63
384 0.63
385 0.61
386 0.55
387 0.54
388 0.48
389 0.44
390 0.4
391 0.36
392 0.3
393 0.26
394 0.24
395 0.18
396 0.19
397 0.22
398 0.19
399 0.17
400 0.17
401 0.14
402 0.13
403 0.15
404 0.2
405 0.19
406 0.19
407 0.19
408 0.19
409 0.19
410 0.18
411 0.17
412 0.1
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.08
425 0.1
426 0.14
427 0.17
428 0.27
429 0.31
430 0.33
431 0.36
432 0.39
433 0.44
434 0.41
435 0.4
436 0.32
437 0.31
438 0.31
439 0.28
440 0.24
441 0.21
442 0.2
443 0.19
444 0.19
445 0.15
446 0.14
447 0.13
448 0.12
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.09
453 0.1
454 0.13
455 0.13
456 0.15
457 0.21
458 0.29
459 0.3
460 0.32
461 0.31
462 0.29
463 0.3
464 0.3
465 0.24
466 0.16
467 0.13
468 0.12
469 0.11
470 0.1
471 0.08
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.11
476 0.13
477 0.14
478 0.19
479 0.23
480 0.22
481 0.24
482 0.26
483 0.23
484 0.2
485 0.2
486 0.16
487 0.14
488 0.15
489 0.15
490 0.16
491 0.15
492 0.15
493 0.15
494 0.14
495 0.13
496 0.12
497 0.13
498 0.12
499 0.2
500 0.21
501 0.22
502 0.24
503 0.27
504 0.27
505 0.28
506 0.29
507 0.26
508 0.26
509 0.32
510 0.32
511 0.37
512 0.42
513 0.46
514 0.5
515 0.57
516 0.64
517 0.67
518 0.74
519 0.73
520 0.74