Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XMK0

Protein Details
Accession F0XMK0    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-39MAKAPKAEKKAKPAKKAVSEKKEKKTKKQEAAPSSPPPQHydrophilic
418-446LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-29KAPKAEKKAKPAKKAVSEKKEKKTKKQ
174-198PAKAAKATKADKPAETPKANPLKRK
423-436GKGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKAPKAEKKAKPAKKAVSEKKEKKTKKQEAAPSSPPPQLLDLVETFLSDNDFAKAHDEFKQQREMKGWLTPKKGAAASGAFAAADAPNQSLVGVFEKWETTLQNGEAASKRKPVDKKAAAATSSDSDSGSESDSESSSSSESESDSDDDSDDDVDMKDAAPAAETESEAEAKPAKAAKATKADKPAETPKANPLKRKASSSSSSSSDDSSDSSSSESDSDSSSSDDGKHKTKKAKLAAEASSSSSSSEEEDSDSESSSDSESDSSDSSDSDSSSSSDSDASAEVAAASAVALPESGSSSGSDSDSDSSSSSSSSSSSSSAGDKSKATALSTAKSESSDTSATVGKTSPELTAAAPAKFPPFPPDPAVKLNNRGRGTPKGDGASERFSRIKQDVYVDPRLASNAFNAHDWGRKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGFIDTGARNGVKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.84
3 0.88
4 0.88
5 0.88
6 0.9
7 0.9
8 0.91
9 0.92
10 0.9
11 0.9
12 0.91
13 0.9
14 0.9
15 0.9
16 0.89
17 0.88
18 0.88
19 0.85
20 0.81
21 0.74
22 0.67
23 0.58
24 0.49
25 0.42
26 0.36
27 0.29
28 0.26
29 0.21
30 0.21
31 0.2
32 0.18
33 0.16
34 0.14
35 0.14
36 0.11
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.13
42 0.14
43 0.15
44 0.21
45 0.29
46 0.33
47 0.37
48 0.47
49 0.47
50 0.49
51 0.51
52 0.49
53 0.43
54 0.46
55 0.5
56 0.47
57 0.5
58 0.5
59 0.48
60 0.49
61 0.47
62 0.39
63 0.35
64 0.28
65 0.23
66 0.21
67 0.19
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.08
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.14
90 0.14
91 0.16
92 0.15
93 0.18
94 0.21
95 0.24
96 0.24
97 0.27
98 0.28
99 0.33
100 0.39
101 0.43
102 0.49
103 0.52
104 0.55
105 0.56
106 0.59
107 0.52
108 0.47
109 0.42
110 0.34
111 0.29
112 0.24
113 0.16
114 0.12
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.15
164 0.17
165 0.21
166 0.3
167 0.32
168 0.35
169 0.41
170 0.43
171 0.4
172 0.43
173 0.45
174 0.43
175 0.42
176 0.39
177 0.4
178 0.47
179 0.49
180 0.5
181 0.49
182 0.51
183 0.52
184 0.55
185 0.5
186 0.46
187 0.47
188 0.45
189 0.42
190 0.36
191 0.36
192 0.32
193 0.28
194 0.23
195 0.2
196 0.16
197 0.15
198 0.12
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.1
213 0.13
214 0.15
215 0.21
216 0.26
217 0.3
218 0.38
219 0.42
220 0.48
221 0.51
222 0.55
223 0.53
224 0.53
225 0.5
226 0.45
227 0.42
228 0.36
229 0.29
230 0.23
231 0.18
232 0.13
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.15
308 0.16
309 0.17
310 0.16
311 0.17
312 0.2
313 0.19
314 0.19
315 0.21
316 0.21
317 0.21
318 0.23
319 0.23
320 0.2
321 0.2
322 0.2
323 0.16
324 0.17
325 0.15
326 0.14
327 0.14
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.15
332 0.12
333 0.13
334 0.14
335 0.12
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.17
340 0.19
341 0.18
342 0.18
343 0.19
344 0.2
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.21
349 0.24
350 0.28
351 0.32
352 0.34
353 0.39
354 0.45
355 0.43
356 0.49
357 0.52
358 0.56
359 0.53
360 0.52
361 0.51
362 0.53
363 0.56
364 0.51
365 0.48
366 0.42
367 0.42
368 0.43
369 0.42
370 0.4
371 0.36
372 0.35
373 0.33
374 0.31
375 0.35
376 0.34
377 0.34
378 0.29
379 0.33
380 0.36
381 0.41
382 0.47
383 0.42
384 0.4
385 0.37
386 0.36
387 0.31
388 0.24
389 0.2
390 0.18
391 0.18
392 0.18
393 0.2
394 0.21
395 0.25
396 0.26
397 0.26
398 0.27
399 0.28
400 0.3
401 0.32
402 0.34
403 0.31
404 0.32
405 0.36
406 0.37
407 0.34
408 0.34
409 0.34
410 0.32
411 0.37
412 0.4
413 0.42
414 0.49
415 0.59
416 0.68
417 0.75
418 0.82
419 0.84
420 0.9
421 0.91
422 0.9
423 0.91
424 0.88
425 0.86
426 0.85
427 0.8
428 0.69
429 0.59
430 0.57
431 0.47
432 0.42
433 0.35
434 0.27
435 0.22