Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R6K3

Protein Details
Accession C4R6K3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-154TQYSQEKYLKRKQEKFLRRFTIHydrophilic
276-299DRLTPPRRSHYLRKKRAADRVNNIHydrophilic
409-428GRGIKSKRLKLDDPKVETRQBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 15, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0016429  F:tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
KEGG ppa:PAS_chr3_1122  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MPGCNIIEEGKHVLVRLPSEAVKVVLLKGDSCISLGKFGTFSVSGVLGYKFGQSFEILENKLVKPVCSLIDDSKPLLLEDSNTFSENNQNLINTGSLVQKLSTQDIEELKKQGKGQDIINQIIAGHDSFGKKTQYSQEKYLKRKQEKFLRRFTIDYLGASEMLQYYRLKDPQRVLDMSNESLGLILSYANIRPGGNYILVDETGGVLLYAMLERMENEGSILVAHENEHPNLIALNYSNYSPELLEKMVSNLNWLQFLEADTQRPQWNNYPQEKIDRLTPPRRSHYLRKKRAADRVNNILDTVEQGNFDGLIYASTLYPPTLIPRILDTLGGSRPVVIYSPFKEILSETFHVLQKDYRILAPSIYETRVRQYQTIIGRIHPLMTTKGGGGYVLHATRVIPKEGGVTAVGRGIKSKRLKLDDPKVETRQPLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.23
4 0.23
5 0.21
6 0.23
7 0.24
8 0.21
9 0.2
10 0.19
11 0.18
12 0.17
13 0.17
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.15
18 0.14
19 0.17
20 0.14
21 0.17
22 0.18
23 0.17
24 0.16
25 0.15
26 0.18
27 0.16
28 0.15
29 0.13
30 0.13
31 0.12
32 0.13
33 0.14
34 0.11
35 0.11
36 0.13
37 0.12
38 0.12
39 0.13
40 0.12
41 0.13
42 0.16
43 0.22
44 0.2
45 0.23
46 0.26
47 0.25
48 0.3
49 0.28
50 0.25
51 0.21
52 0.23
53 0.22
54 0.21
55 0.24
56 0.23
57 0.28
58 0.3
59 0.29
60 0.28
61 0.26
62 0.23
63 0.21
64 0.17
65 0.14
66 0.14
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.19
71 0.18
72 0.25
73 0.24
74 0.23
75 0.19
76 0.18
77 0.18
78 0.19
79 0.18
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.14
87 0.15
88 0.17
89 0.16
90 0.15
91 0.18
92 0.22
93 0.26
94 0.25
95 0.28
96 0.27
97 0.3
98 0.3
99 0.3
100 0.32
101 0.31
102 0.31
103 0.35
104 0.37
105 0.36
106 0.34
107 0.3
108 0.24
109 0.21
110 0.19
111 0.11
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.14
117 0.16
118 0.15
119 0.19
120 0.27
121 0.34
122 0.38
123 0.46
124 0.52
125 0.58
126 0.66
127 0.71
128 0.72
129 0.72
130 0.76
131 0.77
132 0.78
133 0.81
134 0.81
135 0.82
136 0.79
137 0.72
138 0.65
139 0.58
140 0.54
141 0.44
142 0.37
143 0.29
144 0.22
145 0.19
146 0.18
147 0.15
148 0.09
149 0.08
150 0.1
151 0.08
152 0.1
153 0.14
154 0.19
155 0.21
156 0.24
157 0.28
158 0.32
159 0.37
160 0.36
161 0.33
162 0.33
163 0.34
164 0.3
165 0.26
166 0.2
167 0.15
168 0.13
169 0.12
170 0.07
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.06
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.03
200 0.03
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.03
210 0.03
211 0.05
212 0.07
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.11
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.11
245 0.13
246 0.12
247 0.14
248 0.14
249 0.17
250 0.2
251 0.2
252 0.22
253 0.25
254 0.32
255 0.39
256 0.42
257 0.45
258 0.44
259 0.49
260 0.49
261 0.43
262 0.41
263 0.4
264 0.42
265 0.46
266 0.53
267 0.53
268 0.57
269 0.62
270 0.62
271 0.66
272 0.7
273 0.72
274 0.74
275 0.77
276 0.8
277 0.81
278 0.85
279 0.83
280 0.8
281 0.76
282 0.75
283 0.69
284 0.6
285 0.53
286 0.43
287 0.34
288 0.27
289 0.21
290 0.12
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.07
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.1
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.15
312 0.18
313 0.18
314 0.18
315 0.16
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.15
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.14
326 0.16
327 0.21
328 0.22
329 0.22
330 0.22
331 0.22
332 0.23
333 0.25
334 0.23
335 0.2
336 0.24
337 0.27
338 0.26
339 0.27
340 0.26
341 0.23
342 0.26
343 0.25
344 0.22
345 0.23
346 0.23
347 0.22
348 0.22
349 0.22
350 0.22
351 0.23
352 0.24
353 0.22
354 0.27
355 0.32
356 0.33
357 0.3
358 0.29
359 0.34
360 0.36
361 0.43
362 0.38
363 0.34
364 0.37
365 0.36
366 0.34
367 0.29
368 0.25
369 0.21
370 0.21
371 0.21
372 0.17
373 0.18
374 0.16
375 0.15
376 0.13
377 0.13
378 0.16
379 0.15
380 0.15
381 0.14
382 0.15
383 0.22
384 0.25
385 0.25
386 0.2
387 0.2
388 0.23
389 0.23
390 0.25
391 0.18
392 0.16
393 0.14
394 0.18
395 0.18
396 0.15
397 0.2
398 0.21
399 0.29
400 0.36
401 0.42
402 0.48
403 0.54
404 0.63
405 0.69
406 0.77
407 0.78
408 0.78
409 0.8
410 0.77
411 0.75