Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XFT8

Protein Details
Accession F0XFT8    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-42ADSGYKRSSRRQDGDRPQQWDDRDRRNRGRGGRERDHDRERBasic
64-90RDWARDRDRDRERNRDRGNRNRERDSDBasic
95-123RDGDRNRRYRSRSRDHRDRRRSKSPSHGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-119DRRNRGRGGRERDHDRERDRDRGQDRGQERDRDRDRDRDRDWARDRDRDRERNRDRGNRNRERDSDRDRDRDGDRNRRYRSRSRDHRDRRRSKSP
173-190RDKERGGHGRRRSASPRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MADSGYKRSSRRQDGDRPQQWDDRDRRNRGRGGRERDHDRERDRDRGQDRGQERDRDRDRDRDRDWARDRDRDRERNRDRGNRNRERDSDRDRDRDGDRNRRYRSRSRDHRDRRRSKSPSHGATDGVDDRSSGFKDRDGGRTKKAFGGRETEPPRDELLAASAPRQGARDETRDKERGGHGRRRSASPRRDASPPNANGSSSNNAGLPTRTRPADKRQEVIATGTAPMSFRVGAVHDAAYKDENDGDYDGSRDDRGRGRSRRHIDGSPMAEGDDDDDDDDDDNVLVEDDGTMDAMQAMMGFSGFNSTKGKKVAGNNAGGVHKVKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.87
3 0.85
4 0.81
5 0.76
6 0.73
7 0.69
8 0.68
9 0.65
10 0.65
11 0.67
12 0.71
13 0.75
14 0.78
15 0.81
16 0.8
17 0.83
18 0.82
19 0.81
20 0.81
21 0.8
22 0.8
23 0.8
24 0.8
25 0.77
26 0.73
27 0.73
28 0.69
29 0.7
30 0.64
31 0.65
32 0.61
33 0.62
34 0.61
35 0.6
36 0.57
37 0.57
38 0.61
39 0.61
40 0.61
41 0.62
42 0.64
43 0.63
44 0.65
45 0.65
46 0.66
47 0.66
48 0.65
49 0.65
50 0.63
51 0.65
52 0.67
53 0.67
54 0.66
55 0.65
56 0.66
57 0.65
58 0.72
59 0.72
60 0.72
61 0.73
62 0.74
63 0.76
64 0.81
65 0.81
66 0.81
67 0.81
68 0.85
69 0.84
70 0.84
71 0.81
72 0.79
73 0.75
74 0.74
75 0.72
76 0.71
77 0.67
78 0.65
79 0.6
80 0.58
81 0.55
82 0.56
83 0.57
84 0.58
85 0.6
86 0.64
87 0.68
88 0.71
89 0.75
90 0.75
91 0.76
92 0.76
93 0.78
94 0.79
95 0.84
96 0.87
97 0.91
98 0.92
99 0.93
100 0.9
101 0.9
102 0.86
103 0.82
104 0.82
105 0.8
106 0.75
107 0.7
108 0.62
109 0.52
110 0.46
111 0.43
112 0.34
113 0.26
114 0.19
115 0.14
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.11
121 0.11
122 0.17
123 0.2
124 0.27
125 0.33
126 0.35
127 0.39
128 0.42
129 0.43
130 0.43
131 0.44
132 0.4
133 0.34
134 0.36
135 0.32
136 0.38
137 0.41
138 0.38
139 0.34
140 0.33
141 0.32
142 0.27
143 0.24
144 0.15
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.1
154 0.11
155 0.14
156 0.2
157 0.22
158 0.26
159 0.31
160 0.32
161 0.32
162 0.32
163 0.34
164 0.37
165 0.39
166 0.45
167 0.44
168 0.5
169 0.51
170 0.54
171 0.57
172 0.58
173 0.58
174 0.58
175 0.57
176 0.52
177 0.55
178 0.53
179 0.5
180 0.5
181 0.45
182 0.41
183 0.37
184 0.35
185 0.3
186 0.31
187 0.28
188 0.19
189 0.18
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.14
196 0.16
197 0.17
198 0.2
199 0.23
200 0.32
201 0.42
202 0.43
203 0.42
204 0.42
205 0.43
206 0.4
207 0.38
208 0.3
209 0.2
210 0.17
211 0.14
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.18
242 0.25
243 0.34
244 0.41
245 0.49
246 0.58
247 0.63
248 0.68
249 0.68
250 0.64
251 0.61
252 0.6
253 0.55
254 0.47
255 0.41
256 0.32
257 0.27
258 0.23
259 0.19
260 0.12
261 0.09
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.09
290 0.09
291 0.12
292 0.17
293 0.19
294 0.24
295 0.26
296 0.29
297 0.3
298 0.37
299 0.45
300 0.47
301 0.49
302 0.47
303 0.48
304 0.47
305 0.43
306 0.38
307 0.32
308 0.29
309 0.28
310 0.3
311 0.35
312 0.42
313 0.51
314 0.58
315 0.63
316 0.68
317 0.74
318 0.78
319 0.76
320 0.72
321 0.65
322 0.57
323 0.55
324 0.52
325 0.46
326 0.42