Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XJQ6

Protein Details
Accession F0XJQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
314-342DTPTEPRIRTPARNRKKPRPSVARDSGDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-278RRKKAAQFERYRLRASRRRR
323-333TPARNRKKPRP
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 12, nucl 5.5, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019481  TFIIIC_triple_barrel  
Pfam View protein in Pfam  
PF10419  TFIIIC_sub6  
Amino Acid Sequences MGTHLVTLDLSVPEFLRRREDYVVHHTRGGFRAWMNPLLAGDDDEPVEKRRPSNGLDDGTVAATTTALHGARNGHAVGDASDAEDENRNDNDTAANSAKIQILDLHSAQPIVSYRGTVFAGVWTETVGTEMLFVDAKSSSSTTTKTTTPLPLPHVRRLPQDVDLLGASTARIACTPIELRRRQNKTAARPTASSSNTPRRQFAIPVAGGATEQRQRQAAFLERLMAAKHGRGERDVVTVQAVETRQDTVQDDVEEERLRRKKAAQFERYRLRASRRRRGEEGLGVGVGVGLADGVEVRVRTEAATTMEAMTATDTPTEPRIRTPARNRKKPRPSVARDSGDVGRGQDDDGSESEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.27
4 0.29
5 0.33
6 0.37
7 0.41
8 0.42
9 0.49
10 0.56
11 0.5
12 0.51
13 0.48
14 0.47
15 0.46
16 0.41
17 0.34
18 0.27
19 0.31
20 0.32
21 0.34
22 0.3
23 0.28
24 0.26
25 0.24
26 0.23
27 0.18
28 0.15
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.16
34 0.21
35 0.21
36 0.23
37 0.27
38 0.31
39 0.33
40 0.4
41 0.43
42 0.41
43 0.39
44 0.38
45 0.34
46 0.3
47 0.26
48 0.18
49 0.11
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.1
57 0.12
58 0.13
59 0.16
60 0.15
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.1
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.17
79 0.13
80 0.17
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.15
85 0.17
86 0.15
87 0.15
88 0.12
89 0.13
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.12
103 0.13
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.11
129 0.12
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.18
134 0.21
135 0.22
136 0.24
137 0.28
138 0.33
139 0.36
140 0.41
141 0.44
142 0.42
143 0.42
144 0.43
145 0.4
146 0.35
147 0.32
148 0.26
149 0.21
150 0.19
151 0.16
152 0.11
153 0.09
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.07
162 0.09
163 0.14
164 0.22
165 0.25
166 0.33
167 0.42
168 0.48
169 0.48
170 0.54
171 0.56
172 0.58
173 0.65
174 0.62
175 0.55
176 0.51
177 0.5
178 0.49
179 0.44
180 0.38
181 0.34
182 0.39
183 0.44
184 0.44
185 0.43
186 0.39
187 0.39
188 0.37
189 0.34
190 0.3
191 0.23
192 0.22
193 0.21
194 0.18
195 0.16
196 0.15
197 0.14
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.18
205 0.22
206 0.21
207 0.2
208 0.22
209 0.2
210 0.2
211 0.2
212 0.18
213 0.13
214 0.12
215 0.16
216 0.16
217 0.17
218 0.18
219 0.2
220 0.19
221 0.23
222 0.21
223 0.17
224 0.15
225 0.14
226 0.13
227 0.14
228 0.13
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.14
235 0.13
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.16
241 0.17
242 0.16
243 0.23
244 0.26
245 0.28
246 0.29
247 0.35
248 0.39
249 0.48
250 0.58
251 0.6
252 0.63
253 0.71
254 0.78
255 0.75
256 0.72
257 0.67
258 0.66
259 0.64
260 0.65
261 0.66
262 0.67
263 0.71
264 0.71
265 0.72
266 0.69
267 0.66
268 0.6
269 0.51
270 0.41
271 0.33
272 0.28
273 0.21
274 0.14
275 0.08
276 0.04
277 0.02
278 0.02
279 0.02
280 0.02
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.12
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.16
304 0.21
305 0.2
306 0.23
307 0.32
308 0.37
309 0.47
310 0.56
311 0.62
312 0.69
313 0.79
314 0.85
315 0.87
316 0.92
317 0.93
318 0.92
319 0.92
320 0.9
321 0.9
322 0.9
323 0.85
324 0.76
325 0.7
326 0.62
327 0.54
328 0.46
329 0.37
330 0.28
331 0.23
332 0.21
333 0.18
334 0.16
335 0.16