FuNGI

F0XBV4

Protein Details

Accession

F0XBV4

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
118-144	GDGKAQKAREARRDKKRRPVAGKEEEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
106-141	RGLKSAKRKRSAGDGKAQKAREARRDKKRRPVAGKE
152-174	TKSDGPKRSRRPHGGENVARRKK
191-195	RKRAL
197-197	R
202-212	AIRNPNKRRRK
460-468	KAKQRNKKK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035441 TFIIS/LEDGF_dom_sf IPR017923 TFIIS_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003746 F:translation elongation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF08711 Med26
PROSITE	View protein in PROSITE PS51319 TFIIS_N

Amino Acid Sequences

MADTEPVRSPLSTPDAEAGEHGSPELAPPTSNKAASDREEGEEVEGEDDNSKSRPKADDNDEGGDGDGNSEDDLLSDVDEDQFEDYDPATAYIEERPITIDEEAARGLKSAKRKRSAGDGKAQKAREARRDKKRRPVAGKEEEEGDVAPGITKSDGPKRSRRPHGGENVARRKKSQSPEVNEEDLSPEERRKRALDRAINLAIRNPNKRRRKQDEEDLEQAADEEIAQLKIRMEKACMADIDARAEGKPAVSKLQLLPQVMSVLNRNDIQETVLDPETNFLQSVKFFLEPLNDGSLPSYTIQRDIFTCLTKLPIEKDALLSSGIGKVVLFYTRSKRAEPTIKRMAERLVGEWSRPILKKTDDFKKRYVETRDYDYRAAKIAEQGTQSQYTLTERPISRFELDKELQLAPPVVNPNRAQPVGLPQSYTIAPKSTFDGNRTGGEFRPIGASSMEAFRRMTQKAKQRNKKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.27
3	0.26
4	0.26
5	0.23
6	0.18
7	0.17
8	0.15
9	0.12
10	0.11
11	0.12
12	0.14
13	0.11
14	0.1
15	0.13
16	0.21
17	0.25
18	0.26
19	0.27
20	0.29
21	0.34
22	0.37
23	0.42
24	0.37
25	0.35
26	0.35
27	0.34
28	0.31
29	0.27
30	0.23
31	0.18
32	0.15
33	0.13
34	0.13
35	0.13
36	0.13
37	0.13
38	0.16
39	0.16
40	0.19
41	0.24
42	0.29
43	0.38
44	0.44
45	0.51
46	0.53
47	0.55
48	0.52
49	0.47
50	0.4
51	0.32
52	0.25
53	0.15
54	0.11
55	0.07
56	0.07
57	0.07
58	0.06
59	0.05
60	0.07
61	0.06
62	0.06
63	0.06
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.08
68	0.07
69	0.07
70	0.08
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.09
78	0.1
79	0.11
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.13
84	0.13
85	0.15
86	0.14
87	0.14
88	0.12
89	0.13
90	0.14
91	0.13
92	0.12
93	0.1
94	0.13
95	0.15
96	0.24
97	0.32
98	0.41
99	0.48
100	0.51
101	0.53
102	0.61
103	0.68
104	0.64
105	0.65
106	0.65
107	0.64
108	0.68
109	0.66
110	0.59
111	0.56
112	0.56
113	0.56
114	0.58
115	0.61
116	0.65
117	0.76
118	0.8
119	0.84
120	0.87
121	0.87
122	0.85
123	0.86
124	0.85
125	0.84
126	0.79
127	0.7
128	0.62
129	0.52
130	0.44
131	0.33
132	0.23
133	0.13
134	0.09
135	0.08
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.07
140	0.1
141	0.18
142	0.26
143	0.3
144	0.4
145	0.5
146	0.59
147	0.68
148	0.73
149	0.72
150	0.74
151	0.78
152	0.78
153	0.74
154	0.75
155	0.76
156	0.74
157	0.67
158	0.59
159	0.56
160	0.53
161	0.53
162	0.53
163	0.52
164	0.53
165	0.6
166	0.63
167	0.6
168	0.52
169	0.46
170	0.38
171	0.29
172	0.24
173	0.17
174	0.17
175	0.2
176	0.2
177	0.23
178	0.24
179	0.28
180	0.34
181	0.42
182	0.44
183	0.42
184	0.47
185	0.48
186	0.47
187	0.42
188	0.37
189	0.34
190	0.32
191	0.37
192	0.38
193	0.44
194	0.53
195	0.62
196	0.69
197	0.72
198	0.78
199	0.77
200	0.8
201	0.79
202	0.75
203	0.7
204	0.61
205	0.51
206	0.41
207	0.34
208	0.23
209	0.14
210	0.07
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.05
217	0.08
218	0.1
219	0.11
220	0.11
221	0.15
222	0.16
223	0.17
224	0.17
225	0.16
226	0.16
227	0.16
228	0.17
229	0.13
230	0.12
231	0.1
232	0.11
233	0.09
234	0.07
235	0.08
236	0.07
237	0.09
238	0.09
239	0.1
240	0.11
241	0.16
242	0.19
243	0.18
244	0.18
245	0.16
246	0.17
247	0.16
248	0.16
249	0.13
250	0.11
251	0.12
252	0.13
253	0.13
254	0.12
255	0.12
256	0.12
257	0.1
258	0.1
259	0.11
260	0.1
261	0.1
262	0.09
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.09
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.11
276	0.12
277	0.14
278	0.16
279	0.14
280	0.14
281	0.14
282	0.14
283	0.13
284	0.12
285	0.13
286	0.1
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.14
291	0.17
292	0.19
293	0.17
294	0.17
295	0.15
296	0.17
297	0.17
298	0.18
299	0.16
300	0.17
301	0.18
302	0.18
303	0.19
304	0.18
305	0.17
306	0.16
307	0.14
308	0.1
309	0.1
310	0.09
311	0.08
312	0.07
313	0.06
314	0.07
315	0.08
316	0.09
317	0.11
318	0.17
319	0.26
320	0.28
321	0.29
322	0.32
323	0.38
324	0.47
325	0.5
326	0.53
327	0.54
328	0.56
329	0.55
330	0.54
331	0.49
332	0.44
333	0.39
334	0.32
335	0.3
336	0.26
337	0.26
338	0.26
339	0.25
340	0.26
341	0.26
342	0.26
343	0.23
344	0.26
345	0.34
346	0.4
347	0.49
348	0.52
349	0.55
350	0.59
351	0.63
352	0.64
353	0.64
354	0.64
355	0.62
356	0.57
357	0.61
358	0.63
359	0.58
360	0.58
361	0.51
362	0.45
363	0.4
364	0.37
365	0.29
366	0.27
367	0.26
368	0.25
369	0.25
370	0.27
371	0.27
372	0.27
373	0.26
374	0.21
375	0.2
376	0.2
377	0.2
378	0.19
379	0.24
380	0.24
381	0.27
382	0.3
383	0.33
384	0.32
385	0.34
386	0.35
387	0.36
388	0.36
389	0.35
390	0.35
391	0.33
392	0.31
393	0.28
394	0.27
395	0.18
396	0.21
397	0.26
398	0.25
399	0.29
400	0.29
401	0.34
402	0.39
403	0.39
404	0.36
405	0.3
406	0.37
407	0.39
408	0.39
409	0.34
410	0.27
411	0.3
412	0.31
413	0.32
414	0.24
415	0.2
416	0.2
417	0.2
418	0.23
419	0.28
420	0.3
421	0.31
422	0.36
423	0.35
424	0.37
425	0.38
426	0.38
427	0.3
428	0.32
429	0.3
430	0.24
431	0.26
432	0.23
433	0.22
434	0.19
435	0.19
436	0.16
437	0.23
438	0.23
439	0.21
440	0.21
441	0.25
442	0.3
443	0.32
444	0.37
445	0.39
446	0.48
447	0.58
448	0.68

F0XBV4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer