Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R470

Protein Details
Accession C4R470    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
393-413PQTPHFVKAERKRKLDRELVPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 6E.R. 6, mito 4, plas 4, cyto_nucl 4, cyto 2, pero 2, vacu 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008949  Isoprenoid_synthase_dom_sf  
IPR002060  Squ/phyt_synthse  
IPR006449  Squal_synth-like  
IPR019845  Squalene/phytoene_synthase_CS  
IPR044844  Trans_IPPS_euk-type  
IPR033904  Trans_IPPS_HH  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0004310  F:farnesyl-diphosphate farnesyltransferase activity  
GO:0051996  F:squalene synthase activity  
GO:0006696  P:ergosterol biosynthetic process  
KEGG ppa:PAS_chr3_0317  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00494  SQS_PSY  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01044  SQUALEN_PHYTOEN_SYN_1  
PS01045  SQUALEN_PHYTOEN_SYN_2  
CDD cd00683  Trans_IPPS_HH  
Amino Acid Sequences MGKLAQLVLHPLELRAAIQFKFFKQSLHPRQPTNERETLKHCYELLALTSRSFCTVILELNPELRNAIMIFYLVLRALDTVEDDMTIKPDIKIPLLRSFDEKLNLKSWSFDGNSPDEKDRQVLVDFTDVLEEYHRLKPVYQDVIKDITHKMGNGMADYITDEEFNLNGVATVKDYDLYCHYVAGLVGEGLTHLIVEAGFGDPKLEDNMQLSESMGLFLQKTNIIRDYREDLDDGRSFWPKEIWSKYADSLSDFSKRENYEKGLDCISELVLNTMDHIKDVLVYLSSVYDFSSYNFCVIPQVMAIATLATVFRNEKVFETNVKIRKGTTCYLILKARTFEGACEIFSYYLRQIHHSCPITDANYIKIGIKCGELEQFLESLNPAPHVPPGATIPQTPHFVKAERKRKLDRELVPTLAIESLKCDVFLSLVALGFLGVIYSISS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.18
4 0.16
5 0.22
6 0.24
7 0.25
8 0.32
9 0.32
10 0.3
11 0.36
12 0.47
13 0.52
14 0.6
15 0.65
16 0.62
17 0.71
18 0.78
19 0.77
20 0.74
21 0.71
22 0.63
23 0.62
24 0.63
25 0.63
26 0.56
27 0.51
28 0.43
29 0.36
30 0.34
31 0.31
32 0.28
33 0.26
34 0.23
35 0.21
36 0.23
37 0.21
38 0.22
39 0.2
40 0.17
41 0.15
42 0.16
43 0.17
44 0.18
45 0.21
46 0.2
47 0.25
48 0.25
49 0.21
50 0.2
51 0.17
52 0.16
53 0.13
54 0.13
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.15
77 0.16
78 0.18
79 0.23
80 0.25
81 0.33
82 0.35
83 0.36
84 0.36
85 0.37
86 0.37
87 0.39
88 0.39
89 0.33
90 0.33
91 0.35
92 0.3
93 0.29
94 0.27
95 0.26
96 0.25
97 0.25
98 0.25
99 0.28
100 0.31
101 0.33
102 0.34
103 0.3
104 0.29
105 0.28
106 0.25
107 0.22
108 0.19
109 0.17
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.13
114 0.13
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.14
121 0.16
122 0.16
123 0.17
124 0.21
125 0.26
126 0.33
127 0.32
128 0.3
129 0.31
130 0.34
131 0.34
132 0.32
133 0.26
134 0.22
135 0.2
136 0.19
137 0.17
138 0.15
139 0.15
140 0.13
141 0.13
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.09
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.07
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.17
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.19
217 0.16
218 0.19
219 0.19
220 0.18
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.17
226 0.14
227 0.2
228 0.22
229 0.22
230 0.22
231 0.24
232 0.25
233 0.25
234 0.24
235 0.19
236 0.17
237 0.17
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.22
242 0.23
243 0.24
244 0.26
245 0.27
246 0.28
247 0.29
248 0.31
249 0.26
250 0.24
251 0.22
252 0.19
253 0.16
254 0.11
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.07
287 0.08
288 0.06
289 0.07
290 0.06
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.04
296 0.05
297 0.06
298 0.08
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.16
303 0.18
304 0.2
305 0.26
306 0.32
307 0.36
308 0.38
309 0.37
310 0.35
311 0.39
312 0.4
313 0.36
314 0.33
315 0.33
316 0.33
317 0.37
318 0.4
319 0.38
320 0.35
321 0.34
322 0.31
323 0.27
324 0.25
325 0.2
326 0.22
327 0.2
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.14
332 0.15
333 0.17
334 0.14
335 0.17
336 0.18
337 0.21
338 0.24
339 0.27
340 0.36
341 0.35
342 0.34
343 0.34
344 0.36
345 0.34
346 0.34
347 0.31
348 0.24
349 0.24
350 0.24
351 0.25
352 0.22
353 0.22
354 0.2
355 0.2
356 0.19
357 0.18
358 0.21
359 0.17
360 0.17
361 0.16
362 0.15
363 0.14
364 0.14
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.13
369 0.12
370 0.12
371 0.14
372 0.15
373 0.15
374 0.13
375 0.16
376 0.2
377 0.21
378 0.22
379 0.25
380 0.28
381 0.33
382 0.32
383 0.33
384 0.31
385 0.33
386 0.42
387 0.48
388 0.55
389 0.58
390 0.65
391 0.71
392 0.76
393 0.81
394 0.8
395 0.78
396 0.76
397 0.73
398 0.67
399 0.59
400 0.51
401 0.42
402 0.35
403 0.27
404 0.19
405 0.16
406 0.16
407 0.15
408 0.15
409 0.14
410 0.12
411 0.12
412 0.13
413 0.12
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.07
421 0.05
422 0.03