Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XDB2

Protein Details
Accession F0XDB2    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-48AATPSKKSAKVSKKSKKEESSSESEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-40KVKKSAEAAAPKTVKAAATPSKKSAKVSKKSKK
357-409DRGGRGGRGRGGGFGGGRGGGGGFGGRGRGGGDRGGRGRGGFGGRGGGGFAGK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKTKEVKVKKSAEAAAPKTVKAAATPSKKSAKVSKKSKKEESSSESESEEESASEASADSEDSDDSESEAEEKPKTKTNGAKAKKEESDSDSDDSDDSADEKEESTDKSDAKKDSDSENDSDDSDESDAEEKKTEEEPSKKRKADDEEPAAAKKAKTEEEGETSSTLFVGNLSWNVDDSVLYDEFKGFDGLTGARVITDRETQRSRGFGYVEFDSVEHAQAAFDKMTGYFLDGRELKIDFSTGRAKSNDANPAASRAKKYGDVTSPESDTLFVGNLSFDADEETVSAFFSEVANVKSLRLPTDMESGRPKGFGYVSFYSLEDSKKAFDTLNGQSCAGRNVRLDYSTPKPRTEFGGDRGGRGGRGRGGGFGGGRGGGGGFGGRGRGGGDRGGRGRGGFGGRGGGGFAGKKTTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.62
3 0.63
4 0.57
5 0.51
6 0.45
7 0.42
8 0.34
9 0.26
10 0.3
11 0.3
12 0.36
13 0.41
14 0.47
15 0.53
16 0.55
17 0.59
18 0.62
19 0.63
20 0.65
21 0.72
22 0.75
23 0.78
24 0.85
25 0.9
26 0.89
27 0.86
28 0.85
29 0.81
30 0.79
31 0.73
32 0.65
33 0.55
34 0.46
35 0.39
36 0.31
37 0.24
38 0.16
39 0.12
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.07
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.08
56 0.1
57 0.12
58 0.14
59 0.15
60 0.18
61 0.21
62 0.28
63 0.31
64 0.36
65 0.42
66 0.49
67 0.57
68 0.62
69 0.69
70 0.67
71 0.71
72 0.69
73 0.65
74 0.59
75 0.53
76 0.52
77 0.47
78 0.43
79 0.36
80 0.31
81 0.28
82 0.24
83 0.19
84 0.12
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.14
94 0.17
95 0.18
96 0.23
97 0.28
98 0.29
99 0.3
100 0.33
101 0.31
102 0.33
103 0.37
104 0.37
105 0.33
106 0.33
107 0.3
108 0.27
109 0.26
110 0.21
111 0.16
112 0.12
113 0.11
114 0.09
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.13
119 0.12
120 0.14
121 0.16
122 0.18
123 0.22
124 0.3
125 0.38
126 0.47
127 0.56
128 0.56
129 0.57
130 0.6
131 0.61
132 0.6
133 0.6
134 0.57
135 0.53
136 0.53
137 0.51
138 0.46
139 0.4
140 0.32
141 0.25
142 0.22
143 0.19
144 0.19
145 0.22
146 0.22
147 0.25
148 0.26
149 0.25
150 0.22
151 0.2
152 0.17
153 0.14
154 0.11
155 0.07
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.12
187 0.13
188 0.17
189 0.19
190 0.22
191 0.23
192 0.24
193 0.24
194 0.21
195 0.21
196 0.17
197 0.18
198 0.16
199 0.15
200 0.14
201 0.12
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.13
220 0.14
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.11
226 0.12
227 0.08
228 0.1
229 0.17
230 0.16
231 0.19
232 0.2
233 0.21
234 0.23
235 0.28
236 0.32
237 0.26
238 0.27
239 0.24
240 0.29
241 0.32
242 0.31
243 0.28
244 0.23
245 0.24
246 0.26
247 0.27
248 0.27
249 0.29
250 0.31
251 0.34
252 0.35
253 0.34
254 0.3
255 0.28
256 0.23
257 0.18
258 0.14
259 0.09
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.14
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.17
290 0.25
291 0.25
292 0.25
293 0.3
294 0.31
295 0.3
296 0.29
297 0.27
298 0.21
299 0.21
300 0.2
301 0.22
302 0.21
303 0.23
304 0.23
305 0.23
306 0.22
307 0.23
308 0.22
309 0.17
310 0.16
311 0.15
312 0.16
313 0.17
314 0.15
315 0.15
316 0.21
317 0.27
318 0.33
319 0.33
320 0.32
321 0.32
322 0.32
323 0.35
324 0.3
325 0.25
326 0.19
327 0.22
328 0.24
329 0.24
330 0.26
331 0.28
332 0.35
333 0.42
334 0.43
335 0.43
336 0.43
337 0.43
338 0.47
339 0.49
340 0.46
341 0.4
342 0.48
343 0.45
344 0.44
345 0.46
346 0.4
347 0.34
348 0.3
349 0.29
350 0.22
351 0.26
352 0.25
353 0.23
354 0.23
355 0.24
356 0.22
357 0.19
358 0.16
359 0.12
360 0.11
361 0.1
362 0.08
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.08
372 0.1
373 0.11
374 0.16
375 0.2
376 0.25
377 0.28
378 0.31
379 0.31
380 0.29
381 0.29
382 0.28
383 0.28
384 0.23
385 0.21
386 0.21
387 0.2
388 0.2
389 0.19
390 0.15
391 0.13
392 0.13
393 0.13