FuNGI

F0XUD9

Protein Details

Accession

F0XUD9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
190-210	AARDRYSRVRHPTKKNLRLVG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
154-165	GNGPKRAEKRRS

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, cyto 9.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSSASRGGGTGERMVHQDFIARIRFSNTLPPPPNPPKLLDIPNTGLGSSHYTTPGFASRLAREQPLNIEADAELGMPLDLTGMPGVFDGDESSIQALPHPPPIHPHDRALLKPLSSLGKPRTTEASVSFLRRTEYISAGGAKAAASPLRASAGNGPKRAEKRRSPEPDSGTPAYVKRKIEKSFEAAQMAARDRYSRVRHPTKKNLRLVGAYPLLPDLGAFPDSGAYVTLKFSNNPVTAGTGVYDTRLLSGIFKPIEQSDEERAAFEAALKVWERDPQRNPRPQNRMQYDFFLPDTATAGESFRGVFDSASGEGDGDRFSFSRVRAYESAEEKELSHTTKYSEEILLAFADNALVSAPDLGGRVTGGPGAALYYPVMQRTVVRSQRGKPMMRDDEVGGHPMDRLQVSVHEPPEDMLQHIARIRADPLHFHEAEEDAEGEEDDGGHRRYQHHDDDDDDDDDDRNGSVTPGRTNGKSRGHVVEDEDDAEGEEED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.26
3	0.24
4	0.21
5	0.23
6	0.21
7	0.24
8	0.28
9	0.26
10	0.26
11	0.28
12	0.3
13	0.27
14	0.36
15	0.36
16	0.41
17	0.44
18	0.46
19	0.52
20	0.58
21	0.64
22	0.57
23	0.54
24	0.51
25	0.53
26	0.58
27	0.53
28	0.5
29	0.47
30	0.49
31	0.46
32	0.4
33	0.33
34	0.27
35	0.28
36	0.23
37	0.21
38	0.18
39	0.18
40	0.18
41	0.21
42	0.24
43	0.19
44	0.22
45	0.24
46	0.25
47	0.32
48	0.34
49	0.35
50	0.32
51	0.33
52	0.34
53	0.32
54	0.31
55	0.24
56	0.22
57	0.18
58	0.18
59	0.16
60	0.11
61	0.08
62	0.06
63	0.06
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.04
68	0.05
69	0.05
70	0.05
71	0.05
72	0.05
73	0.06
74	0.05
75	0.05
76	0.05
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.09
81	0.09
82	0.09
83	0.11
84	0.13
85	0.13
86	0.21
87	0.22
88	0.21
89	0.25
90	0.32
91	0.39
92	0.39
93	0.4
94	0.39
95	0.43
96	0.44
97	0.44
98	0.4
99	0.32
100	0.3
101	0.3
102	0.27
103	0.23
104	0.29
105	0.28
106	0.33
107	0.33
108	0.35
109	0.37
110	0.35
111	0.36
112	0.32
113	0.32
114	0.28
115	0.3
116	0.3
117	0.25
118	0.25
119	0.23
120	0.24
121	0.2
122	0.19
123	0.17
124	0.18
125	0.18
126	0.17
127	0.16
128	0.14
129	0.11
130	0.09
131	0.09
132	0.08
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.09
137	0.09
138	0.1
139	0.17
140	0.26
141	0.3
142	0.32
143	0.34
144	0.38
145	0.45
146	0.53
147	0.53
148	0.52
149	0.54
150	0.63
151	0.7
152	0.7
153	0.71
154	0.69
155	0.66
156	0.64
157	0.59
158	0.49
159	0.42
160	0.39
161	0.38
162	0.36
163	0.33
164	0.32
165	0.38
166	0.41
167	0.44
168	0.44
169	0.44
170	0.45
171	0.46
172	0.41
173	0.34
174	0.31
175	0.29
176	0.27
177	0.22
178	0.16
179	0.14
180	0.14
181	0.22
182	0.25
183	0.29
184	0.37
185	0.47
186	0.56
187	0.65
188	0.74
189	0.77
190	0.82
191	0.81
192	0.76
193	0.68
194	0.61
195	0.53
196	0.47
197	0.38
198	0.29
199	0.22
200	0.18
201	0.15
202	0.13
203	0.11
204	0.06
205	0.05
206	0.06
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.06
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.1
220	0.15
221	0.15
222	0.15
223	0.15
224	0.14
225	0.14
226	0.13
227	0.12
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.07
237	0.07
238	0.11
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.12
244	0.12
245	0.14
246	0.13
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.16
251	0.15
252	0.13
253	0.11
254	0.09
255	0.06
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.13
261	0.16
262	0.22
263	0.29
264	0.38
265	0.47
266	0.55
267	0.61
268	0.66
269	0.72
270	0.72
271	0.75
272	0.71
273	0.69
274	0.62
275	0.59
276	0.51
277	0.44
278	0.37
279	0.27
280	0.21
281	0.15
282	0.14
283	0.1
284	0.09
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.1
308	0.11
309	0.17
310	0.18
311	0.23
312	0.24
313	0.28
314	0.32
315	0.33
316	0.35
317	0.3
318	0.3
319	0.24
320	0.26
321	0.23
322	0.19
323	0.16
324	0.15
325	0.15
326	0.16
327	0.17
328	0.17
329	0.15
330	0.14
331	0.13
332	0.14
333	0.12
334	0.1
335	0.09
336	0.06
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.04
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.04
345	0.04
346	0.05
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.08
361	0.09
362	0.1
363	0.11
364	0.1
365	0.12
366	0.17
367	0.26
368	0.29
369	0.36
370	0.4
371	0.44
372	0.54
373	0.6
374	0.59
375	0.54
376	0.59
377	0.58
378	0.55
379	0.53
380	0.44
381	0.42
382	0.39
383	0.36
384	0.26
385	0.2
386	0.18
387	0.16
388	0.17
389	0.11
390	0.11
391	0.09
392	0.12
393	0.17
394	0.23
395	0.23
396	0.22
397	0.22
398	0.22
399	0.26
400	0.23
401	0.19
402	0.17
403	0.17
404	0.19
405	0.2
406	0.22
407	0.19
408	0.19
409	0.2
410	0.22
411	0.23
412	0.25
413	0.3
414	0.35
415	0.34
416	0.33
417	0.33
418	0.28
419	0.28
420	0.25
421	0.18
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.09
426	0.08
427	0.07
428	0.07
429	0.1
430	0.12
431	0.13
432	0.16
433	0.19
434	0.26
435	0.33
436	0.41
437	0.43
438	0.44
439	0.46
440	0.48
441	0.48
442	0.43
443	0.37
444	0.29
445	0.23
446	0.21
447	0.18
448	0.13
449	0.1
450	0.09
451	0.09
452	0.13
453	0.15
454	0.18
455	0.24
456	0.28
457	0.31
458	0.37
459	0.45
460	0.49
461	0.51
462	0.53
463	0.54
464	0.54
465	0.53
466	0.52
467	0.47
468	0.4
469	0.37
470	0.32
471	0.25
472	0.21

F0XUD9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer