Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XSM1

Protein Details
Accession F0XSM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-167KSTATTHLRHPQSKKRWTKRKSQELLNAHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-135RRSEPGRRPSRPSPV
147-159RHPQSKKRWTKRK
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 11.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PF13812  PPR_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MQACPCTRVRLLWQCQRNWHPPRSFSTAPGARNLSQVAESSAHSDDPALDRYIPGNPEKSAPELLDEQPNKASNSEQGGAIWSNYDELWGAAAAAVEGVENGVQALRQESSSIAENREPIRRSEPGRRPSRPSPVRDTKSTATTHLRHPQSKKRWTKRKSQELLNAHGFFRRAVSPEDYLRANAAFWLWKKQLSETWQMLESSQLPRAESESNMLRWLLEHKDGGKSMHKLRETWSKLSPERRRDLWPSIMVSALRSHPGRAHIIFSATFDAAHIPYYAVQDTIHHFCRQLAEKPSTDGSMHPTADEVYELLKMVLENSSSNYLRLRQSTIFFLVKATKTTESVDNLYHLLVKHGHPLHKFTRLQMASRVARNAAFKMPTVEMLQAALSATDLDINTPQGAALCTTILSVEGSEGTATTDGQPSLTPAEMFEQLLRCGLEPNLITYTTIIRGLCLKGELEAAQQVLQLMINNQTEPDEYVYSTMMNGAKLRGDFSVLRRVAETAAAQRINHPIVWNDFIQSIYSTAFAEARANPAIKRPRVVPSFPLMLQTYSKIFALEPLRTILPDAGSGGGLTSSHAQGRQTDALHGRWEFAAQLGPTVHALPKLEPGEIVEPTSLTLTTMILGYIQGVSNPYDVIAFYSHFRRLLQAGDPVATGLVRDQGTLVHDVVVMALCEYEGMLRVALDVVGDMLRDAATDLQHGDSEAADYQPQHPPPSVYTWSILLNGFMFHRQVRQGERILHMMRDRGVEPNQVTWNTLMAGYARLQNVKKTAVTLQRLERAGFEPDDFTFRAFSYLGDKSAILRYMETRKTAAAAASSGPKSKIAGQQYDQMAEEERQAQAGTPSPPHASSSERGLGLGHGVESQSGRRPADAVTNELRMLENEVEEIAKMMDEEQRDSATASF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.73
3 0.78
4 0.78
5 0.76
6 0.76
7 0.75
8 0.72
9 0.73
10 0.73
11 0.66
12 0.59
13 0.6
14 0.57
15 0.51
16 0.52
17 0.51
18 0.43
19 0.43
20 0.41
21 0.32
22 0.27
23 0.26
24 0.23
25 0.19
26 0.19
27 0.19
28 0.19
29 0.17
30 0.16
31 0.16
32 0.15
33 0.17
34 0.19
35 0.18
36 0.17
37 0.18
38 0.19
39 0.24
40 0.25
41 0.26
42 0.26
43 0.25
44 0.29
45 0.3
46 0.32
47 0.3
48 0.27
49 0.27
50 0.27
51 0.29
52 0.36
53 0.34
54 0.33
55 0.35
56 0.38
57 0.35
58 0.31
59 0.3
60 0.25
61 0.3
62 0.29
63 0.25
64 0.22
65 0.24
66 0.24
67 0.22
68 0.19
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.03
87 0.03
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.12
98 0.18
99 0.2
100 0.21
101 0.23
102 0.27
103 0.3
104 0.37
105 0.36
106 0.33
107 0.37
108 0.4
109 0.44
110 0.51
111 0.57
112 0.6
113 0.68
114 0.7
115 0.73
116 0.75
117 0.8
118 0.77
119 0.74
120 0.74
121 0.75
122 0.75
123 0.72
124 0.71
125 0.63
126 0.61
127 0.56
128 0.51
129 0.49
130 0.46
131 0.49
132 0.52
133 0.55
134 0.57
135 0.63
136 0.68
137 0.7
138 0.78
139 0.81
140 0.83
141 0.86
142 0.84
143 0.87
144 0.88
145 0.88
146 0.86
147 0.84
148 0.83
149 0.78
150 0.8
151 0.77
152 0.68
153 0.57
154 0.51
155 0.42
156 0.32
157 0.29
158 0.24
159 0.18
160 0.19
161 0.23
162 0.24
163 0.26
164 0.29
165 0.27
166 0.25
167 0.25
168 0.21
169 0.17
170 0.14
171 0.12
172 0.14
173 0.14
174 0.22
175 0.22
176 0.24
177 0.25
178 0.28
179 0.32
180 0.33
181 0.4
182 0.35
183 0.36
184 0.35
185 0.34
186 0.31
187 0.28
188 0.25
189 0.2
190 0.22
191 0.2
192 0.19
193 0.19
194 0.22
195 0.21
196 0.19
197 0.21
198 0.2
199 0.2
200 0.21
201 0.2
202 0.17
203 0.16
204 0.19
205 0.18
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.22
210 0.24
211 0.26
212 0.28
213 0.3
214 0.34
215 0.39
216 0.39
217 0.37
218 0.4
219 0.48
220 0.48
221 0.47
222 0.46
223 0.46
224 0.5
225 0.6
226 0.64
227 0.61
228 0.62
229 0.61
230 0.62
231 0.6
232 0.61
233 0.56
234 0.51
235 0.45
236 0.4
237 0.38
238 0.31
239 0.26
240 0.23
241 0.18
242 0.18
243 0.16
244 0.16
245 0.17
246 0.2
247 0.24
248 0.23
249 0.24
250 0.2
251 0.22
252 0.21
253 0.2
254 0.19
255 0.14
256 0.13
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.07
263 0.08
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.14
270 0.18
271 0.19
272 0.18
273 0.19
274 0.19
275 0.24
276 0.27
277 0.3
278 0.31
279 0.33
280 0.33
281 0.35
282 0.36
283 0.32
284 0.28
285 0.22
286 0.22
287 0.22
288 0.21
289 0.19
290 0.18
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.1
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.13
307 0.13
308 0.14
309 0.15
310 0.17
311 0.19
312 0.21
313 0.23
314 0.21
315 0.22
316 0.24
317 0.27
318 0.25
319 0.22
320 0.22
321 0.22
322 0.21
323 0.2
324 0.2
325 0.17
326 0.17
327 0.2
328 0.21
329 0.19
330 0.2
331 0.19
332 0.18
333 0.17
334 0.16
335 0.15
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.18
341 0.21
342 0.25
343 0.25
344 0.3
345 0.32
346 0.38
347 0.38
348 0.32
349 0.39
350 0.36
351 0.36
352 0.35
353 0.39
354 0.34
355 0.35
356 0.35
357 0.26
358 0.27
359 0.27
360 0.24
361 0.2
362 0.17
363 0.16
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.16
368 0.14
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.07
373 0.07
374 0.05
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.08
413 0.07
414 0.06
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.1
422 0.1
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.09
435 0.1
436 0.08
437 0.07
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.11
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.09
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.08
479 0.1
480 0.11
481 0.13
482 0.22
483 0.21
484 0.21
485 0.21
486 0.21
487 0.19
488 0.18
489 0.17
490 0.1
491 0.14
492 0.15
493 0.14
494 0.15
495 0.18
496 0.18
497 0.18
498 0.15
499 0.13
500 0.14
501 0.17
502 0.15
503 0.13
504 0.13
505 0.12
506 0.12
507 0.11
508 0.09
509 0.07
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.08
517 0.1
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.19
522 0.26
523 0.26
524 0.27
525 0.27
526 0.33
527 0.37
528 0.38
529 0.34
530 0.31
531 0.33
532 0.31
533 0.32
534 0.24
535 0.21
536 0.2
537 0.19
538 0.16
539 0.13
540 0.13
541 0.1
542 0.09
543 0.14
544 0.16
545 0.15
546 0.15
547 0.16
548 0.16
549 0.15
550 0.16
551 0.12
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.06
557 0.06
558 0.05
559 0.05
560 0.04
561 0.05
562 0.06
563 0.06
564 0.07
565 0.08
566 0.09
567 0.1
568 0.15
569 0.17
570 0.16
571 0.19
572 0.21
573 0.22
574 0.24
575 0.23
576 0.2
577 0.17
578 0.16
579 0.13
580 0.1
581 0.12
582 0.08
583 0.1
584 0.09
585 0.1
586 0.1
587 0.11
588 0.11
589 0.1
590 0.11
591 0.1
592 0.15
593 0.16
594 0.15
595 0.14
596 0.16
597 0.17
598 0.17
599 0.17
600 0.11
601 0.1
602 0.1
603 0.11
604 0.08
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.06
609 0.06
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.06
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.08
627 0.09
628 0.13
629 0.14
630 0.15
631 0.15
632 0.16
633 0.16
634 0.18
635 0.19
636 0.2
637 0.19
638 0.19
639 0.19
640 0.16
641 0.15
642 0.12
643 0.1
644 0.06
645 0.09
646 0.08
647 0.09
648 0.09
649 0.1
650 0.12
651 0.14
652 0.13
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.07
659 0.05
660 0.04
661 0.04
662 0.03
663 0.04
664 0.03
665 0.04
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.05
670 0.06
671 0.06
672 0.05
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.05
682 0.06
683 0.06
684 0.07
685 0.08
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.07
691 0.09
692 0.09
693 0.08
694 0.09
695 0.1
696 0.12
697 0.18
698 0.2
699 0.21
700 0.22
701 0.23
702 0.25
703 0.3
704 0.31
705 0.26
706 0.26
707 0.26
708 0.25
709 0.25
710 0.23
711 0.17
712 0.13
713 0.12
714 0.12
715 0.12
716 0.12
717 0.11
718 0.15
719 0.17
720 0.22
721 0.26
722 0.31
723 0.34
724 0.37
725 0.39
726 0.43
727 0.41
728 0.4
729 0.37
730 0.34
731 0.31
732 0.29
733 0.28
734 0.26
735 0.27
736 0.29
737 0.28
738 0.31
739 0.34
740 0.31
741 0.32
742 0.27
743 0.25
744 0.2
745 0.18
746 0.14
747 0.1
748 0.11
749 0.11
750 0.15
751 0.16
752 0.2
753 0.21
754 0.25
755 0.28
756 0.29
757 0.29
758 0.27
759 0.33
760 0.36
761 0.41
762 0.43
763 0.45
764 0.48
765 0.49
766 0.47
767 0.42
768 0.36
769 0.35
770 0.3
771 0.25
772 0.21
773 0.2
774 0.23
775 0.21
776 0.19
777 0.16
778 0.15
779 0.16
780 0.14
781 0.14
782 0.16
783 0.18
784 0.18
785 0.18
786 0.18
787 0.18
788 0.23
789 0.25
790 0.2
791 0.19
792 0.23
793 0.31
794 0.34
795 0.35
796 0.32
797 0.29
798 0.3
799 0.3
800 0.26
801 0.19
802 0.16
803 0.16
804 0.22
805 0.23
806 0.24
807 0.23
808 0.23
809 0.23
810 0.28
811 0.33
812 0.34
813 0.39
814 0.39
815 0.46
816 0.48
817 0.48
818 0.43
819 0.36
820 0.32
821 0.25
822 0.26
823 0.2
824 0.18
825 0.17
826 0.16
827 0.16
828 0.15
829 0.19
830 0.19
831 0.2
832 0.23
833 0.25
834 0.26
835 0.27
836 0.27
837 0.27
838 0.27
839 0.31
840 0.33
841 0.3
842 0.29
843 0.27
844 0.26
845 0.23
846 0.21
847 0.14
848 0.1
849 0.1
850 0.11
851 0.12
852 0.14
853 0.2
854 0.24
855 0.24
856 0.24
857 0.25
858 0.26
859 0.34
860 0.33
861 0.32
862 0.32
863 0.34
864 0.33
865 0.33
866 0.32
867 0.23
868 0.25
869 0.21
870 0.17
871 0.14
872 0.15
873 0.14
874 0.14
875 0.14
876 0.09
877 0.08
878 0.07
879 0.08
880 0.12
881 0.13
882 0.16
883 0.18
884 0.19
885 0.19