Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XDM9

Protein Details
Accession F0XDM9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
500-522DMAADGRRRRHRRSLLQDQQQQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
508-509RR
Subcellular Location(s) plas 13, nucl 5, mito 5, mito_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSAEKRRASNTDPSKQLVKRPNLGGSGGSGGSSKAGGSGSNALIQVEPRTSGLQAPVMQLSGHADEVFCAKFDPAGHLIASGSMDRSILLWRTYGDCENYGALTGHRGAVLDLQWSRDSDVLFSASADTQLASWDLTSGQRIRRYVGHEEIVNTLDISRRGEELLYSGSDDGSLGIWDPRSKNAADYIQTDFPVTAVAVAEAGHELYSGGIDNDIHVWDVRKKAVVYTLHGHQDTVTGLRVSPDSQSLLSFAMDATARTWDIRPFAPTERHIRTFDGAQTGLDKNLVHASWDPSSRRIAAGSGDGTVVVWSSDNGKLLYKLPGHKGSVNSAEFSPAEDQPITPEEENLDAMNIFRNARLNLRRQGQADTADLEQQQTREAQEMREPQARSSPISSVLRRVGLAGRAPQPTSSPYDGSAGETVSPKTPQFQEDVDSNSPPSRLSQPPSYDDASRQDPLAMPAAAAQRMRSSSAGSTTSGGSGRRQRRRFDGADPAEMRLADMAADGRRRRHRRSLLQDQQQQQQPKKFLFCFPYVQSHQMRAQICRCSVSGLLLLLLLVMYLSLMLTHNIHNNEFSVLLLLVSLAVIVLFCHSLVRIIIMVVHPPTPEEDERFRQRRARAAGSTAMSGPGYGAFPPGTDLFTPGGYAVPRQPIRVVLARDEEAAGVESVAAKAQPPAYGLWRETVVEASLEHRRGGSGDGVVRPPSYASEDGVSYVVEAQPRSIAPTTDVPTLTHPAEEGRVGQPAQW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.62
3 0.66
4 0.65
5 0.63
6 0.62
7 0.63
8 0.65
9 0.58
10 0.56
11 0.47
12 0.4
13 0.35
14 0.27
15 0.22
16 0.16
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.09
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.1
25 0.15
26 0.15
27 0.18
28 0.18
29 0.17
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.16
37 0.16
38 0.18
39 0.19
40 0.21
41 0.21
42 0.23
43 0.22
44 0.21
45 0.2
46 0.18
47 0.19
48 0.16
49 0.15
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.15
54 0.14
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.12
59 0.12
60 0.18
61 0.17
62 0.18
63 0.18
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.17
68 0.12
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.12
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.14
79 0.18
80 0.21
81 0.24
82 0.23
83 0.21
84 0.22
85 0.22
86 0.21
87 0.19
88 0.16
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.13
97 0.13
98 0.16
99 0.15
100 0.18
101 0.19
102 0.19
103 0.2
104 0.19
105 0.19
106 0.15
107 0.16
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.13
125 0.16
126 0.21
127 0.27
128 0.28
129 0.3
130 0.34
131 0.38
132 0.41
133 0.42
134 0.4
135 0.36
136 0.37
137 0.36
138 0.32
139 0.27
140 0.2
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.08
164 0.11
165 0.12
166 0.15
167 0.17
168 0.17
169 0.18
170 0.22
171 0.26
172 0.25
173 0.27
174 0.29
175 0.28
176 0.28
177 0.27
178 0.22
179 0.17
180 0.15
181 0.12
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.09
205 0.12
206 0.15
207 0.16
208 0.18
209 0.18
210 0.19
211 0.25
212 0.25
213 0.26
214 0.27
215 0.31
216 0.33
217 0.33
218 0.31
219 0.25
220 0.23
221 0.2
222 0.17
223 0.14
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.12
249 0.13
250 0.15
251 0.17
252 0.21
253 0.24
254 0.27
255 0.33
256 0.36
257 0.39
258 0.39
259 0.37
260 0.35
261 0.33
262 0.31
263 0.27
264 0.21
265 0.17
266 0.19
267 0.17
268 0.16
269 0.15
270 0.12
271 0.1
272 0.12
273 0.12
274 0.1
275 0.11
276 0.14
277 0.15
278 0.19
279 0.2
280 0.19
281 0.21
282 0.2
283 0.19
284 0.17
285 0.15
286 0.12
287 0.13
288 0.12
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.12
305 0.16
306 0.17
307 0.2
308 0.24
309 0.27
310 0.29
311 0.3
312 0.3
313 0.29
314 0.32
315 0.29
316 0.25
317 0.21
318 0.21
319 0.18
320 0.18
321 0.17
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.13
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.09
335 0.08
336 0.05
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.09
343 0.1
344 0.16
345 0.2
346 0.24
347 0.29
348 0.33
349 0.36
350 0.35
351 0.37
352 0.33
353 0.3
354 0.26
355 0.22
356 0.18
357 0.16
358 0.15
359 0.13
360 0.12
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.11
367 0.11
368 0.15
369 0.19
370 0.22
371 0.27
372 0.27
373 0.25
374 0.29
375 0.29
376 0.26
377 0.23
378 0.2
379 0.2
380 0.24
381 0.24
382 0.22
383 0.23
384 0.22
385 0.2
386 0.2
387 0.16
388 0.14
389 0.15
390 0.16
391 0.18
392 0.19
393 0.19
394 0.19
395 0.18
396 0.18
397 0.22
398 0.2
399 0.16
400 0.15
401 0.17
402 0.17
403 0.17
404 0.16
405 0.11
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.11
411 0.1
412 0.12
413 0.13
414 0.13
415 0.15
416 0.15
417 0.16
418 0.16
419 0.22
420 0.2
421 0.19
422 0.19
423 0.18
424 0.17
425 0.15
426 0.15
427 0.16
428 0.18
429 0.22
430 0.27
431 0.29
432 0.33
433 0.36
434 0.36
435 0.31
436 0.3
437 0.3
438 0.27
439 0.24
440 0.21
441 0.18
442 0.17
443 0.17
444 0.18
445 0.14
446 0.1
447 0.13
448 0.14
449 0.15
450 0.14
451 0.13
452 0.12
453 0.13
454 0.15
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.14
459 0.15
460 0.14
461 0.15
462 0.13
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.16
467 0.23
468 0.32
469 0.41
470 0.46
471 0.48
472 0.54
473 0.61
474 0.6
475 0.57
476 0.58
477 0.51
478 0.54
479 0.51
480 0.45
481 0.37
482 0.34
483 0.28
484 0.17
485 0.14
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.08
490 0.13
491 0.15
492 0.22
493 0.32
494 0.39
495 0.45
496 0.54
497 0.62
498 0.68
499 0.76
500 0.8
501 0.8
502 0.83
503 0.84
504 0.78
505 0.76
506 0.71
507 0.68
508 0.63
509 0.59
510 0.54
511 0.5
512 0.52
513 0.46
514 0.46
515 0.44
516 0.41
517 0.4
518 0.38
519 0.43
520 0.39
521 0.44
522 0.4
523 0.39
524 0.38
525 0.4
526 0.39
527 0.36
528 0.38
529 0.37
530 0.36
531 0.34
532 0.32
533 0.28
534 0.26
535 0.23
536 0.19
537 0.14
538 0.13
539 0.1
540 0.1
541 0.07
542 0.07
543 0.04
544 0.03
545 0.02
546 0.02
547 0.02
548 0.02
549 0.02
550 0.03
551 0.04
552 0.06
553 0.08
554 0.13
555 0.15
556 0.16
557 0.16
558 0.17
559 0.17
560 0.15
561 0.14
562 0.1
563 0.08
564 0.07
565 0.07
566 0.06
567 0.05
568 0.04
569 0.04
570 0.02
571 0.02
572 0.02
573 0.02
574 0.03
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.05
579 0.06
580 0.06
581 0.07
582 0.07
583 0.06
584 0.08
585 0.08
586 0.11
587 0.11
588 0.12
589 0.11
590 0.12
591 0.14
592 0.17
593 0.19
594 0.22
595 0.27
596 0.34
597 0.44
598 0.49
599 0.52
600 0.53
601 0.55
602 0.59
603 0.6
604 0.6
605 0.53
606 0.52
607 0.53
608 0.48
609 0.45
610 0.37
611 0.31
612 0.23
613 0.19
614 0.15
615 0.1
616 0.09
617 0.08
618 0.09
619 0.08
620 0.08
621 0.11
622 0.11
623 0.12
624 0.12
625 0.14
626 0.13
627 0.13
628 0.14
629 0.11
630 0.13
631 0.11
632 0.13
633 0.15
634 0.23
635 0.24
636 0.25
637 0.26
638 0.27
639 0.32
640 0.36
641 0.35
642 0.3
643 0.34
644 0.34
645 0.33
646 0.31
647 0.26
648 0.2
649 0.18
650 0.14
651 0.09
652 0.08
653 0.07
654 0.07
655 0.08
656 0.07
657 0.06
658 0.09
659 0.1
660 0.11
661 0.12
662 0.14
663 0.19
664 0.24
665 0.24
666 0.24
667 0.24
668 0.24
669 0.23
670 0.22
671 0.18
672 0.14
673 0.13
674 0.15
675 0.2
676 0.21
677 0.21
678 0.19
679 0.19
680 0.19
681 0.21
682 0.2
683 0.18
684 0.21
685 0.24
686 0.27
687 0.28
688 0.27
689 0.25
690 0.23
691 0.21
692 0.22
693 0.19
694 0.19
695 0.19
696 0.2
697 0.2
698 0.2
699 0.18
700 0.13
701 0.13
702 0.13
703 0.13
704 0.13
705 0.13
706 0.15
707 0.15
708 0.2
709 0.2
710 0.19
711 0.2
712 0.28
713 0.3
714 0.33
715 0.33
716 0.3
717 0.32
718 0.36
719 0.33
720 0.25
721 0.22
722 0.2
723 0.21
724 0.21
725 0.21
726 0.18
727 0.22