Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XC16

Protein Details
Accession F0XC16    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-127EESERWDKRVRKKEIHRDNNAFBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MAKKDNTDISAEKPADTPKEQQKEDTKMEPIDRMARFRALQARAKTSTEQNLKAAAAETQKLTGDASELSSLRRKRTVATHNIMKAEVEDAGGDFERKRAWDWTAEESERWDKRVRKKEIHRDNNAFQDYRQEAHRVYKRQLKHNLSAPDLEQYTRDKLSAVERAAAAGTLEIVETADGELIAVDKDGTFFSAAESTSFAENRPSREAVDRLVNDQRKADEAAQRKKRERLAKNGDDADVTYINEKNKHFNQKLARFYNKYTAEIRESFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.37
4 0.4
5 0.42
6 0.5
7 0.5
8 0.55
9 0.59
10 0.61
11 0.64
12 0.6
13 0.55
14 0.5
15 0.52
16 0.47
17 0.42
18 0.42
19 0.39
20 0.38
21 0.36
22 0.35
23 0.33
24 0.36
25 0.4
26 0.38
27 0.44
28 0.45
29 0.49
30 0.48
31 0.5
32 0.48
33 0.45
34 0.49
35 0.47
36 0.45
37 0.4
38 0.39
39 0.36
40 0.33
41 0.29
42 0.22
43 0.18
44 0.17
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.11
51 0.09
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.12
57 0.19
58 0.22
59 0.24
60 0.27
61 0.27
62 0.28
63 0.37
64 0.44
65 0.47
66 0.52
67 0.55
68 0.55
69 0.55
70 0.52
71 0.43
72 0.34
73 0.25
74 0.18
75 0.1
76 0.07
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.12
87 0.14
88 0.18
89 0.21
90 0.26
91 0.3
92 0.3
93 0.28
94 0.29
95 0.35
96 0.3
97 0.29
98 0.3
99 0.32
100 0.42
101 0.52
102 0.56
103 0.59
104 0.68
105 0.77
106 0.81
107 0.84
108 0.83
109 0.79
110 0.74
111 0.72
112 0.64
113 0.53
114 0.42
115 0.39
116 0.31
117 0.26
118 0.24
119 0.19
120 0.17
121 0.25
122 0.31
123 0.28
124 0.31
125 0.37
126 0.4
127 0.47
128 0.55
129 0.53
130 0.51
131 0.55
132 0.54
133 0.49
134 0.46
135 0.37
136 0.3
137 0.25
138 0.21
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.11
145 0.12
146 0.16
147 0.2
148 0.18
149 0.17
150 0.16
151 0.17
152 0.16
153 0.15
154 0.11
155 0.06
156 0.05
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.1
187 0.17
188 0.19
189 0.22
190 0.26
191 0.26
192 0.26
193 0.31
194 0.32
195 0.27
196 0.33
197 0.31
198 0.31
199 0.39
200 0.41
201 0.37
202 0.38
203 0.36
204 0.3
205 0.32
206 0.32
207 0.31
208 0.36
209 0.46
210 0.53
211 0.61
212 0.64
213 0.68
214 0.72
215 0.75
216 0.73
217 0.74
218 0.75
219 0.74
220 0.76
221 0.71
222 0.64
223 0.54
224 0.47
225 0.39
226 0.3
227 0.22
228 0.18
229 0.18
230 0.21
231 0.25
232 0.26
233 0.3
234 0.38
235 0.48
236 0.48
237 0.53
238 0.61
239 0.65
240 0.73
241 0.73
242 0.74
243 0.68
244 0.7
245 0.71
246 0.64
247 0.59
248 0.53
249 0.49
250 0.47
251 0.45
252 0.44
253 0.41
254 0.4
255 0.36