FuNGI

F0XNC4

Protein Details

Accession

F0XNC4

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
148-170	QDASPSKNGKRNKSPAKPKIVAA	Hydrophilic
565-592	VVLNGDSPKKDKKKKEKKQKEDVSAEAG	Hydrophilic
597-634	AEAEVEKPKKEKKDKKDKKEKKEKKDRKDKTVETPVSA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
155-166	NGKRNKSPAKPK
450-456	KKAKKAK
492-497	KKSKKK
572-584	PKKDKKKKEKKQK
602-626	EKPKKEKKDKKDKKEKKEKKDRKDK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.499, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MVGPRAPIGSLTAHVKGINGWMGSRPSETPKASLSSLGGAGGALDDSDGDSDSSSSDDDSDGGNTASFLQKVSNAVRGGSANAMPPAAGKIQVKSKANGISTPAHKAAVKKSESSAVSDSSDSSDSSDSSDSSDSDSSDSDSESKSGQDASPSKNGKRNKSPAKPKIVAATEKTRSESSSSNSSSDDDDEEPEKGDGEEKEDGQDAEEEDAPQREAASKAVAVATQAEPANPDRDITSEFASQGFQLRKANDEIDASDVAKIFRQAQREGKQLWYFTAPSSVPITVVEKMQIPLDRAQKGLPILNHDGQDYSLSFDDALSSKTIKLMIPNKAGDKYSMHRTIDQTMHLKRVTHFSHDDDEAGPAEAAAGRPLTTAPKPPRAQPPGLKTRFLPIGVSKTATPKPSPSVATSVSSTTSASRKRKLAAQDGADAESDSTSVTSAASSAEPDPKKAKKAKPAATTTTTTRVTPIVPPVPTLAVAQEADATPISGAKKSKKKAAATPVSAVAATPSTARKQSAILPPPVLGVTPTVPSTLKTAAAWEPSSSQMALPLSSQSFQIDTPSKVVLNGDSPKKDKKKKEKKQKEDVSAEAGAPEEAEAEVEKPKKEKKDKKDKKEKKEKKDRKDKTVETPVSAGPKKVTPVPIPHH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.2
3	0.19
4	0.21
5	0.22
6	0.18
7	0.17
8	0.19
9	0.22
10	0.23
11	0.25
12	0.25
13	0.28
14	0.35
15	0.36
16	0.34
17	0.35
18	0.37
19	0.36
20	0.35
21	0.29
22	0.24
23	0.23
24	0.2
25	0.16
26	0.12
27	0.11
28	0.09
29	0.07
30	0.04
31	0.04
32	0.03
33	0.04
34	0.05
35	0.05
36	0.05
37	0.06
38	0.06
39	0.07
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.1
49	0.1
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.13
58	0.18
59	0.2
60	0.24
61	0.22
62	0.22
63	0.24
64	0.24
65	0.23
66	0.21
67	0.2
68	0.16
69	0.16
70	0.15
71	0.13
72	0.13
73	0.14
74	0.12
75	0.15
76	0.14
77	0.17
78	0.25
79	0.33
80	0.35
81	0.34
82	0.39
83	0.41
84	0.41
85	0.39
86	0.36
87	0.36
88	0.36
89	0.4
90	0.36
91	0.32
92	0.32
93	0.34
94	0.38
95	0.39
96	0.39
97	0.35
98	0.36
99	0.41
100	0.4
101	0.41
102	0.35
103	0.29
104	0.28
105	0.26
106	0.24
107	0.2
108	0.2
109	0.15
110	0.15
111	0.13
112	0.12
113	0.13
114	0.14
115	0.11
116	0.13
117	0.13
118	0.12
119	0.14
120	0.15
121	0.13
122	0.13
123	0.14
124	0.13
125	0.13
126	0.13
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.12
132	0.11
133	0.12
134	0.12
135	0.17
136	0.21
137	0.25
138	0.33
139	0.38
140	0.41
141	0.47
142	0.53
143	0.55
144	0.61
145	0.67
146	0.69
147	0.75
148	0.82
149	0.83
150	0.86
151	0.8
152	0.72
153	0.7
154	0.64
155	0.58
156	0.52
157	0.52
158	0.47
159	0.45
160	0.46
161	0.39
162	0.34
163	0.33
164	0.31
165	0.26
166	0.3
167	0.3
168	0.29
169	0.29
170	0.28
171	0.27
172	0.24
173	0.23
174	0.15
175	0.16
176	0.16
177	0.15
178	0.15
179	0.14
180	0.13
181	0.11
182	0.13
183	0.11
184	0.13
185	0.15
186	0.14
187	0.15
188	0.16
189	0.16
190	0.13
191	0.14
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.1
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.1
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.09
206	0.09
207	0.1
208	0.1
209	0.08
210	0.1
211	0.09
212	0.11
213	0.11
214	0.1
215	0.11
216	0.13
217	0.15
218	0.12
219	0.12
220	0.1
221	0.11
222	0.13
223	0.13
224	0.14
225	0.13
226	0.14
227	0.14
228	0.14
229	0.13
230	0.16
231	0.15
232	0.15
233	0.17
234	0.18
235	0.2
236	0.21
237	0.22
238	0.17
239	0.17
240	0.15
241	0.14
242	0.15
243	0.12
244	0.11
245	0.11
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.12
250	0.14
251	0.17
252	0.21
253	0.29
254	0.33
255	0.38
256	0.38
257	0.39
258	0.39
259	0.36
260	0.33
261	0.27
262	0.23
263	0.19
264	0.21
265	0.15
266	0.14
267	0.16
268	0.14
269	0.12
270	0.12
271	0.14
272	0.11
273	0.11
274	0.1
275	0.1
276	0.1
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.16
281	0.21
282	0.22
283	0.21
284	0.21
285	0.21
286	0.21
287	0.21
288	0.17
289	0.16
290	0.2
291	0.21
292	0.22
293	0.2
294	0.19
295	0.17
296	0.17
297	0.12
298	0.1
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.09
311	0.08
312	0.13
313	0.18
314	0.23
315	0.26
316	0.28
317	0.29
318	0.3
319	0.3
320	0.25
321	0.22
322	0.2
323	0.24
324	0.28
325	0.27
326	0.27
327	0.29
328	0.32
329	0.31
330	0.31
331	0.29
332	0.25
333	0.28
334	0.26
335	0.26
336	0.22
337	0.28
338	0.27
339	0.26
340	0.26
341	0.25
342	0.27
343	0.27
344	0.27
345	0.19
346	0.19
347	0.14
348	0.13
349	0.1
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.08
360	0.09
361	0.17
362	0.21
363	0.3
364	0.32
365	0.37
366	0.46
367	0.48
368	0.53
369	0.52
370	0.56
371	0.58
372	0.59
373	0.55
374	0.46
375	0.44
376	0.41
377	0.35
378	0.28
379	0.2
380	0.22
381	0.22
382	0.23
383	0.19
384	0.22
385	0.25
386	0.25
387	0.24
388	0.21
389	0.24
390	0.26
391	0.28
392	0.24
393	0.25
394	0.25
395	0.25
396	0.24
397	0.21
398	0.18
399	0.17
400	0.15
401	0.14
402	0.17
403	0.24
404	0.28
405	0.32
406	0.34
407	0.36
408	0.41
409	0.45
410	0.49
411	0.47
412	0.45
413	0.44
414	0.42
415	0.41
416	0.36
417	0.29
418	0.2
419	0.14
420	0.11
421	0.06
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.05
429	0.05
430	0.07
431	0.08
432	0.16
433	0.16
434	0.19
435	0.26
436	0.29
437	0.37
438	0.44
439	0.5
440	0.52
441	0.62
442	0.67
443	0.7
444	0.73
445	0.71
446	0.67
447	0.63
448	0.56
449	0.53
450	0.45
451	0.36
452	0.31
453	0.26
454	0.23
455	0.22
456	0.25
457	0.23
458	0.22
459	0.23
460	0.23
461	0.23
462	0.22
463	0.2
464	0.14
465	0.11
466	0.11
467	0.1
468	0.1
469	0.09
470	0.1
471	0.09
472	0.09
473	0.06
474	0.09
475	0.1
476	0.12
477	0.16
478	0.24
479	0.33
480	0.37
481	0.46
482	0.51
483	0.56
484	0.61
485	0.68
486	0.68
487	0.64
488	0.62
489	0.56
490	0.49
491	0.43
492	0.34
493	0.24
494	0.15
495	0.11
496	0.1
497	0.11
498	0.13
499	0.16
500	0.17
501	0.17
502	0.18
503	0.26
504	0.34
505	0.38
506	0.38
507	0.37
508	0.36
509	0.36
510	0.34
511	0.27
512	0.18
513	0.13
514	0.11
515	0.11
516	0.11
517	0.12
518	0.12
519	0.13
520	0.16
521	0.16
522	0.16
523	0.14
524	0.17
525	0.19
526	0.23
527	0.23
528	0.2
529	0.2
530	0.21
531	0.23
532	0.2
533	0.16
534	0.16
535	0.16
536	0.15
537	0.14
538	0.15
539	0.15
540	0.15
541	0.16
542	0.13
543	0.14
544	0.13
545	0.19
546	0.2
547	0.2
548	0.22
549	0.23
550	0.22
551	0.22
552	0.23
553	0.18
554	0.21
555	0.27
556	0.31
557	0.35
558	0.39
559	0.49
560	0.58
561	0.66
562	0.7
563	0.75
564	0.79
565	0.85
566	0.92
567	0.94
568	0.94
569	0.96
570	0.95
571	0.94
572	0.89
573	0.82
574	0.76
575	0.66
576	0.56
577	0.45
578	0.35
579	0.24
580	0.17
581	0.13
582	0.08
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.14
588	0.17
589	0.2
590	0.25
591	0.33
592	0.43
593	0.54
594	0.63
595	0.68
596	0.76
597	0.85
598	0.91
599	0.95
600	0.95
601	0.95
602	0.96
603	0.96
604	0.96
605	0.96
606	0.95
607	0.95
608	0.96
609	0.94
610	0.94
611	0.94
612	0.9
613	0.89
614	0.89
615	0.82
616	0.74
617	0.67
618	0.6
619	0.58
620	0.53
621	0.45
622	0.37
623	0.36
624	0.36
625	0.39
626	0.42
627	0.39

F0XNC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer