Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XTB5

Protein Details
Accession F0XTB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MGSSTRKKNEKKKDFQKTKLKVGKARAKPTNFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-28RKKNEKKKDFQKTKLKVGKARAK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSSTRKKNEKKKDFQKTKLKVGKARAKPTNFTDTSFRSKSIVVNQQSLSETAPEAAVQFRHNLSLAASSRSDNQRRDALAYLTSQISGGMNDRNSGNGSGSTSHNPVGTVGVLSKLLPLISDPAAPVRTQLLKLFRALPPDEVRPMAAKILLYVRAGITNLSSAVRDDALSTLEWLLEVAGEDLVSSPGGWLKTLNGFGAMMGWVAPPPPGSAGAGGVGSGWSSAPKSSFAAIATKSGSSSGGRRLATGGQAYARQIAALAKFLEIGLRREQPSPYDPKVLWDSLYRPPAATATIAKTNPFGHLNIFGAPRDEDSEMYADREDRQRVFAKRWQPTITTGVEEARKEGGAVGRAAATLRDVLETGMSDYDSTTIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.94
3 0.94
4 0.91
5 0.91
6 0.88
7 0.86
8 0.82
9 0.82
10 0.82
11 0.8
12 0.82
13 0.8
14 0.77
15 0.75
16 0.73
17 0.73
18 0.64
19 0.57
20 0.54
21 0.5
22 0.53
23 0.5
24 0.45
25 0.36
26 0.36
27 0.38
28 0.4
29 0.44
30 0.39
31 0.43
32 0.42
33 0.43
34 0.43
35 0.39
36 0.31
37 0.22
38 0.19
39 0.14
40 0.13
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.14
47 0.14
48 0.15
49 0.16
50 0.15
51 0.14
52 0.2
53 0.2
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.27
58 0.36
59 0.41
60 0.37
61 0.39
62 0.42
63 0.42
64 0.44
65 0.4
66 0.33
67 0.29
68 0.27
69 0.25
70 0.2
71 0.18
72 0.15
73 0.13
74 0.11
75 0.09
76 0.1
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.16
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.16
95 0.14
96 0.12
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.14
117 0.14
118 0.18
119 0.2
120 0.21
121 0.23
122 0.26
123 0.24
124 0.27
125 0.27
126 0.27
127 0.26
128 0.27
129 0.27
130 0.23
131 0.23
132 0.19
133 0.19
134 0.15
135 0.12
136 0.1
137 0.09
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.1
228 0.12
229 0.16
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.22
234 0.22
235 0.23
236 0.22
237 0.17
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.12
243 0.1
244 0.09
245 0.11
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.13
253 0.12
254 0.14
255 0.17
256 0.21
257 0.23
258 0.25
259 0.26
260 0.27
261 0.31
262 0.36
263 0.35
264 0.36
265 0.34
266 0.36
267 0.4
268 0.37
269 0.32
270 0.27
271 0.28
272 0.3
273 0.34
274 0.29
275 0.25
276 0.25
277 0.24
278 0.23
279 0.21
280 0.16
281 0.17
282 0.22
283 0.23
284 0.22
285 0.24
286 0.24
287 0.25
288 0.24
289 0.21
290 0.17
291 0.19
292 0.2
293 0.21
294 0.22
295 0.19
296 0.19
297 0.19
298 0.18
299 0.18
300 0.18
301 0.15
302 0.15
303 0.18
304 0.16
305 0.17
306 0.17
307 0.15
308 0.18
309 0.24
310 0.26
311 0.25
312 0.3
313 0.36
314 0.4
315 0.45
316 0.49
317 0.52
318 0.56
319 0.61
320 0.59
321 0.54
322 0.54
323 0.53
324 0.48
325 0.41
326 0.34
327 0.33
328 0.33
329 0.31
330 0.28
331 0.24
332 0.22
333 0.19
334 0.21
335 0.2
336 0.19
337 0.19
338 0.18
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.14
343 0.12
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.1