Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XDA9

Protein Details
Accession F0XDA9    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123TQKGRVSKPTAKKRARDLDDHydrophilic
135-155AGPPKRPKLIVRKSMKPKPASHydrophilic
312-334MHDCIHRRFRKRLSKKEIKDKEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-153PPKRPKLIVRKSMKPKP
319-328RFRKRLSKKE
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 10.833, nucl 6.5, cyto_nucl 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MASPPLPPAKPSRPVTLKLKPPGSFSNSSNARPSSISSLPLVGTPTAMSPPPVSAGGTKIILKRSQPSTPAAVSDRASSFSGATATPNVARTPASAFPSSMTMTQKGRVSKPTAKKRARDLDDSEDENKPESTTAGPPKRPKLIVRKSMKPKPASIVLKQIPKEIPPHSRGEGYDSEEEDREPDPTIEEEFVLRMLPGEHCDYLRRMTEERKIGVPVKEGGADFQMKWLPGVERRALVTVNGTRFVGVLVDLPTITEGMKTWDKRNFMKSADICQMLLVFATVADDAEAKSLPLPAMVTKDYRWPHGLTPPMHDCIHRRFRKRLSKKEIKDKEAELQRLLNEDRIAVETKWELIDDGRAATATTTTAGAGGAGAGGEFDDGEMEEGEEDAYGEVDEDYFGQHQDSAAPDIDDAELEAMFMEEDGDGDTAAAAETPTTQTAATGAGKPSGGNGAAGAESEASDADADEDDDEEDDDDDDDMDEDQLAQAEQVKGVREDINELKKQLQLLDKNLAATQNMLLRKRIEENKKRVMSELRLKQASIGEVDEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.69
3 0.7
4 0.71
5 0.71
6 0.74
7 0.66
8 0.65
9 0.66
10 0.64
11 0.6
12 0.52
13 0.53
14 0.5
15 0.51
16 0.52
17 0.45
18 0.4
19 0.36
20 0.37
21 0.34
22 0.31
23 0.3
24 0.25
25 0.26
26 0.24
27 0.24
28 0.23
29 0.16
30 0.14
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.13
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.16
43 0.17
44 0.19
45 0.22
46 0.23
47 0.27
48 0.29
49 0.31
50 0.36
51 0.38
52 0.42
53 0.41
54 0.42
55 0.43
56 0.4
57 0.42
58 0.37
59 0.35
60 0.31
61 0.31
62 0.28
63 0.25
64 0.25
65 0.22
66 0.19
67 0.16
68 0.17
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.16
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.18
80 0.2
81 0.23
82 0.22
83 0.22
84 0.22
85 0.24
86 0.25
87 0.23
88 0.22
89 0.22
90 0.23
91 0.27
92 0.3
93 0.32
94 0.35
95 0.37
96 0.42
97 0.48
98 0.57
99 0.63
100 0.7
101 0.73
102 0.75
103 0.79
104 0.82
105 0.78
106 0.75
107 0.7
108 0.68
109 0.65
110 0.63
111 0.56
112 0.48
113 0.42
114 0.37
115 0.31
116 0.22
117 0.17
118 0.15
119 0.14
120 0.18
121 0.28
122 0.34
123 0.4
124 0.46
125 0.52
126 0.57
127 0.59
128 0.59
129 0.61
130 0.63
131 0.67
132 0.68
133 0.72
134 0.76
135 0.8
136 0.81
137 0.73
138 0.66
139 0.61
140 0.63
141 0.59
142 0.51
143 0.53
144 0.5
145 0.53
146 0.5
147 0.5
148 0.41
149 0.38
150 0.4
151 0.35
152 0.37
153 0.34
154 0.38
155 0.35
156 0.37
157 0.35
158 0.35
159 0.33
160 0.3
161 0.29
162 0.26
163 0.25
164 0.23
165 0.23
166 0.19
167 0.17
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.08
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.14
189 0.15
190 0.17
191 0.18
192 0.19
193 0.19
194 0.23
195 0.29
196 0.32
197 0.32
198 0.31
199 0.32
200 0.34
201 0.33
202 0.3
203 0.24
204 0.21
205 0.21
206 0.19
207 0.16
208 0.14
209 0.14
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.11
217 0.14
218 0.18
219 0.17
220 0.17
221 0.18
222 0.19
223 0.17
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.15
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.09
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.04
244 0.04
245 0.08
246 0.13
247 0.14
248 0.19
249 0.23
250 0.26
251 0.29
252 0.34
253 0.33
254 0.3
255 0.36
256 0.33
257 0.33
258 0.33
259 0.31
260 0.26
261 0.23
262 0.21
263 0.14
264 0.12
265 0.07
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.17
288 0.18
289 0.2
290 0.22
291 0.21
292 0.22
293 0.26
294 0.32
295 0.26
296 0.31
297 0.31
298 0.32
299 0.31
300 0.3
301 0.28
302 0.31
303 0.41
304 0.42
305 0.45
306 0.49
307 0.58
308 0.69
309 0.76
310 0.78
311 0.78
312 0.82
313 0.84
314 0.87
315 0.86
316 0.79
317 0.73
318 0.65
319 0.62
320 0.58
321 0.53
322 0.43
323 0.36
324 0.32
325 0.31
326 0.29
327 0.23
328 0.16
329 0.14
330 0.13
331 0.14
332 0.15
333 0.12
334 0.13
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.07
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.03
359 0.03
360 0.02
361 0.02
362 0.02
363 0.02
364 0.02
365 0.02
366 0.02
367 0.03
368 0.03
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.03
377 0.04
378 0.03
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.08
391 0.09
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.08
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.11
428 0.12
429 0.14
430 0.14
431 0.15
432 0.15
433 0.15
434 0.15
435 0.15
436 0.13
437 0.1
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.1
475 0.1
476 0.12
477 0.14
478 0.16
479 0.16
480 0.19
481 0.21
482 0.18
483 0.24
484 0.3
485 0.37
486 0.38
487 0.39
488 0.39
489 0.38
490 0.39
491 0.38
492 0.39
493 0.36
494 0.39
495 0.44
496 0.42
497 0.41
498 0.42
499 0.38
500 0.29
501 0.25
502 0.22
503 0.21
504 0.26
505 0.26
506 0.28
507 0.29
508 0.33
509 0.4
510 0.47
511 0.53
512 0.57
513 0.65
514 0.72
515 0.76
516 0.74
517 0.71
518 0.69
519 0.68
520 0.68
521 0.68
522 0.66
523 0.62
524 0.6
525 0.57
526 0.52
527 0.45
528 0.37
529 0.29