Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0XDF6

Protein Details
Accession F0XDF6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-33MSLFHTSERRAGRRRRRFSNVRAAEMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-24RAGRRRRR
Subcellular Location(s) mito 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000851  Ribosomal_S5  
IPR005324  Ribosomal_S5_C  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR014721  Ribosomal_S5_D2-typ_fold_subgr  
IPR013810  Ribosomal_S5_N  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00333  Ribosomal_S5  
PF03719  Ribosomal_S5_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50881  S5_DSRBD  
Amino Acid Sequences MAAWMPQMSLFHTSERRAGRRRRRFSNVRAAEMGLVDEDAISRFSKEYFPSYSTEDKEALRDKYTAAQLAAVEAGEAAVDVRDLTVQGRLRTDGKTTGLQYVEDFSQVQPVIDKRARTDAAEAEKPAVTSAAAAAIGSRFMGEEAFGLDLMRWLESFVPTDVNLAGLTDEQLRAVAEEHGPKDEDLMRWWFDRPALVQRDGRTPVPAGATGGWGLAPSLGTRLPGVTEHYQRQEDPEDEGLDEAGDYRELKRQTGLQVQEMMKLAVKTLVIRHVHNQTRLGKVRSVSVMVIAGNGEGRLGLGMAKAKELPLATSKAKVMAVRNMLPVPRYENRTVFGTVQAKVGGTVVQLSARPPGFGLRVPHRIFEMARAVGITDLAASIPRSRNPMNTVKAAYQALMQQPNPEDIAIGRGKKLVDVRKVYYGGAVY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.43
3 0.49
4 0.54
5 0.63
6 0.69
7 0.75
8 0.82
9 0.85
10 0.87
11 0.89
12 0.89
13 0.89
14 0.85
15 0.8
16 0.72
17 0.64
18 0.54
19 0.44
20 0.35
21 0.24
22 0.17
23 0.11
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.07
29 0.08
30 0.09
31 0.1
32 0.15
33 0.17
34 0.21
35 0.24
36 0.26
37 0.28
38 0.33
39 0.38
40 0.37
41 0.37
42 0.35
43 0.31
44 0.35
45 0.38
46 0.36
47 0.32
48 0.3
49 0.28
50 0.32
51 0.35
52 0.31
53 0.25
54 0.24
55 0.21
56 0.21
57 0.2
58 0.13
59 0.1
60 0.07
61 0.06
62 0.04
63 0.04
64 0.03
65 0.03
66 0.03
67 0.03
68 0.03
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.11
73 0.14
74 0.16
75 0.18
76 0.21
77 0.23
78 0.24
79 0.27
80 0.25
81 0.25
82 0.27
83 0.27
84 0.29
85 0.27
86 0.26
87 0.24
88 0.23
89 0.2
90 0.16
91 0.16
92 0.11
93 0.15
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.22
99 0.24
100 0.25
101 0.22
102 0.3
103 0.31
104 0.29
105 0.31
106 0.29
107 0.32
108 0.34
109 0.33
110 0.27
111 0.27
112 0.25
113 0.22
114 0.17
115 0.1
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.15
170 0.16
171 0.14
172 0.14
173 0.16
174 0.16
175 0.17
176 0.18
177 0.16
178 0.14
179 0.15
180 0.14
181 0.19
182 0.22
183 0.24
184 0.26
185 0.27
186 0.32
187 0.33
188 0.31
189 0.25
190 0.21
191 0.19
192 0.17
193 0.16
194 0.11
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.1
213 0.13
214 0.17
215 0.19
216 0.23
217 0.24
218 0.23
219 0.25
220 0.24
221 0.21
222 0.2
223 0.19
224 0.16
225 0.15
226 0.15
227 0.12
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.06
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.16
240 0.2
241 0.26
242 0.27
243 0.24
244 0.3
245 0.3
246 0.31
247 0.29
248 0.25
249 0.19
250 0.17
251 0.16
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.17
257 0.17
258 0.18
259 0.23
260 0.3
261 0.34
262 0.36
263 0.41
264 0.38
265 0.45
266 0.49
267 0.47
268 0.41
269 0.37
270 0.38
271 0.33
272 0.3
273 0.22
274 0.18
275 0.16
276 0.13
277 0.12
278 0.09
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.05
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.18
299 0.18
300 0.2
301 0.2
302 0.21
303 0.23
304 0.24
305 0.23
306 0.25
307 0.29
308 0.29
309 0.31
310 0.31
311 0.3
312 0.28
313 0.26
314 0.27
315 0.27
316 0.31
317 0.32
318 0.32
319 0.34
320 0.36
321 0.37
322 0.31
323 0.33
324 0.31
325 0.27
326 0.27
327 0.25
328 0.21
329 0.19
330 0.18
331 0.12
332 0.08
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.14
342 0.17
343 0.18
344 0.21
345 0.27
346 0.29
347 0.38
348 0.39
349 0.4
350 0.39
351 0.39
352 0.36
353 0.35
354 0.34
355 0.25
356 0.23
357 0.22
358 0.21
359 0.18
360 0.17
361 0.12
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.07
367 0.13
368 0.16
369 0.19
370 0.25
371 0.27
372 0.33
373 0.38
374 0.46
375 0.46
376 0.48
377 0.49
378 0.45
379 0.48
380 0.43
381 0.37
382 0.29
383 0.29
384 0.3
385 0.32
386 0.31
387 0.31
388 0.32
389 0.34
390 0.33
391 0.28
392 0.22
393 0.16
394 0.22
395 0.23
396 0.23
397 0.22
398 0.24
399 0.24
400 0.28
401 0.36
402 0.38
403 0.42
404 0.47
405 0.5
406 0.55
407 0.56
408 0.52