FuNGI

F0XFL6

Protein Details

Accession

F0XFL6

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-61	AQTPRKGPPNPMLRRKRVVDPLVARKKPLQRPPSVRNTSV	Hydrophilic
221-243	AKEANAKKPPPNQKKEKQFQFYF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-48	RKGPPNPMLRRKRVVDPLVARKK
501-563	SKAKAEAKEKEKEKEKEKEKEKAGTTGGTPKGSTTPSGKHRTVEAKVGEGAKKSKSLKRPGSP
575-581	RKKVKKH

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSANPTGQASQANGAARPPNSAQTPRKGPPNPMLRRKRVVDPLVARKKPLQRPPSVRNTSVLSGAIRNGVTSLSLPSEARTVNLSNTEDEAKKVSFEAQRSLNGGWTDPAPTTAYRDFPVVTTKRALREGIRYHVMRFAKGGKGGDAEGEIDPTNQDDFTRPVSLHRRDPRQPAPGRAVKEQEAPAAAATVDETEAEKAAQQRADREAQRQVDLAQIAPVAKEANAKKPPPNQKKEKQFQFYFPKNTAEQKKESEIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYISALSEANVALVISGSAFRMVPLEKFYRFTPKPPFQAYSIEQAEEIMSKKMSASRWAMRDTEKRKQEDELEETRRTIGGRSRVKQESSTFRSAPRSEKMEHDDIDMEGDEFQDDDENINLEPDNDEDSKVTRERLRRNHLGANLFGDADEKEVDKAEEEDKVEKKTRQLGKHLRKALAKREDHLEYLEYVDSDTNSEKEDFLDLSSDDEDDEADSEKKDEESKAKAEAKEKEKEKEKEKEKEKAGTTGGTPKGSTTPSGKHRTVEAKVGEGAKKSKSLKRPGSPNLSESSGNESTRKKVKKHAMGSVRPSRSTTPMTGQPRSLVKGGALSDGEGTAGEMSDGTTGGKNRIKFVKKSGGAINTPTGSRASSPNAIANTNVNTASQGQLAGRPRSPIGGSLPSRAASPNGGKVDAAEIISMLLSVPEGITVSGLLRMFGNRVGDGPNQMNRKDWIKLVKDNAVFGEDKLLRARVSKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.27
3	0.25
4	0.28
5	0.27
6	0.29
7	0.34
8	0.42
9	0.46
10	0.5
11	0.59
12	0.59
13	0.67
14	0.66
15	0.67
16	0.67
17	0.71
18	0.72
19	0.74
20	0.79
21	0.77
22	0.81
23	0.79
24	0.79
25	0.78
26	0.73
27	0.72
28	0.7
29	0.73
30	0.76
31	0.72
32	0.66
33	0.64
34	0.69
35	0.69
36	0.7
37	0.68
38	0.68
39	0.76
40	0.82
41	0.85
42	0.82
43	0.74
44	0.68
45	0.64
46	0.55
47	0.48
48	0.4
49	0.31
50	0.26
51	0.25
52	0.24
53	0.19
54	0.17
55	0.15
56	0.13
57	0.12
58	0.11
59	0.12
60	0.11
61	0.13
62	0.13
63	0.13
64	0.17
65	0.16
66	0.16
67	0.18
68	0.17
69	0.18
70	0.23
71	0.24
72	0.22
73	0.24
74	0.28
75	0.25
76	0.25
77	0.26
78	0.21
79	0.2
80	0.19
81	0.24
82	0.24
83	0.26
84	0.31
85	0.31
86	0.33
87	0.36
88	0.35
89	0.33
90	0.28
91	0.26
92	0.22
93	0.19
94	0.18
95	0.15
96	0.16
97	0.14
98	0.14
99	0.19
100	0.2
101	0.22
102	0.21
103	0.22
104	0.21
105	0.2
106	0.29
107	0.26
108	0.26
109	0.3
110	0.32
111	0.35
112	0.37
113	0.39
114	0.34
115	0.41
116	0.43
117	0.44
118	0.47
119	0.44
120	0.42
121	0.47
122	0.44
123	0.35
124	0.33
125	0.31
126	0.28
127	0.3
128	0.3
129	0.24
130	0.25
131	0.24
132	0.22
133	0.18
134	0.16
135	0.12
136	0.13
137	0.12
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.11
142	0.09
143	0.09
144	0.1
145	0.12
146	0.15
147	0.17
148	0.16
149	0.23
150	0.32
151	0.37
152	0.45
153	0.51
154	0.56
155	0.61
156	0.69
157	0.7
158	0.71
159	0.71
160	0.67
161	0.68
162	0.65
163	0.62
164	0.58
165	0.55
166	0.47
167	0.47
168	0.42
169	0.34
170	0.29
171	0.25
172	0.21
173	0.17
174	0.14
175	0.09
176	0.08
177	0.06
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.08
185	0.1
186	0.14
187	0.16
188	0.17
189	0.2
190	0.24
191	0.31
192	0.32
193	0.33
194	0.38
195	0.37
196	0.37
197	0.35
198	0.31
199	0.27
200	0.25
201	0.21
202	0.14
203	0.13
204	0.11
205	0.11
206	0.11
207	0.07
208	0.07
209	0.14
210	0.15
211	0.23
212	0.3
213	0.33
214	0.38
215	0.47
216	0.58
217	0.62
218	0.7
219	0.71
220	0.74
221	0.83
222	0.87
223	0.87
224	0.85
225	0.77
226	0.76
227	0.76
228	0.74
229	0.69
230	0.61
231	0.55
232	0.49
233	0.54
234	0.53
235	0.48
236	0.45
237	0.43
238	0.47
239	0.49
240	0.48
241	0.45
242	0.4
243	0.37
244	0.35
245	0.33
246	0.27
247	0.24
248	0.24
249	0.19
250	0.17
251	0.15
252	0.12
253	0.11
254	0.11
255	0.12
256	0.13
257	0.13
258	0.12
259	0.12
260	0.12
261	0.12
262	0.11
263	0.09
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.04
275	0.04
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.05
286	0.06
287	0.07
288	0.11
289	0.14
290	0.14
291	0.16
292	0.18
293	0.26
294	0.26
295	0.31
296	0.37
297	0.41
298	0.46
299	0.48
300	0.49
301	0.41
302	0.46
303	0.42
304	0.39
305	0.34
306	0.28
307	0.24
308	0.22
309	0.2
310	0.16
311	0.15
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.11
317	0.11
318	0.15
319	0.19
320	0.23
321	0.26
322	0.28
323	0.3
324	0.32
325	0.4
326	0.42
327	0.45
328	0.46
329	0.46
330	0.45
331	0.46
332	0.46
333	0.42
334	0.42
335	0.41
336	0.4
337	0.38
338	0.37
339	0.34
340	0.3
341	0.25
342	0.2
343	0.18
344	0.22
345	0.28
346	0.3
347	0.37
348	0.39
349	0.4
350	0.41
351	0.41
352	0.41
353	0.4
354	0.42
355	0.36
356	0.36
357	0.4
358	0.39
359	0.38
360	0.33
361	0.31
362	0.27
363	0.3
364	0.33
365	0.32
366	0.3
367	0.27
368	0.24
369	0.2
370	0.19
371	0.15
372	0.1
373	0.07
374	0.06
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.08
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.13
395	0.13
396	0.16
397	0.17
398	0.24
399	0.32
400	0.41
401	0.48
402	0.52
403	0.55
404	0.57
405	0.57
406	0.52
407	0.44
408	0.37
409	0.3
410	0.23
411	0.19
412	0.14
413	0.1
414	0.09
415	0.08
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.07
420	0.06
421	0.08
422	0.08
423	0.1
424	0.11
425	0.15
426	0.17
427	0.21
428	0.25
429	0.25
430	0.27
431	0.34
432	0.4
433	0.4
434	0.49
435	0.56
436	0.62
437	0.69
438	0.72
439	0.68
440	0.66
441	0.66
442	0.65
443	0.64
444	0.55
445	0.48
446	0.48
447	0.45
448	0.4
449	0.36
450	0.27
451	0.18
452	0.18
453	0.16
454	0.11
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.08
460	0.07
461	0.09
462	0.1
463	0.09
464	0.09
465	0.11
466	0.09
467	0.09
468	0.1
469	0.08
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.08
483	0.09
484	0.11
485	0.13
486	0.16
487	0.19
488	0.21
489	0.28
490	0.33
491	0.35
492	0.39
493	0.45
494	0.47
495	0.51
496	0.53
497	0.53
498	0.58
499	0.61
500	0.63
501	0.65
502	0.68
503	0.69
504	0.72
505	0.73
506	0.69
507	0.7
508	0.64
509	0.58
510	0.51
511	0.43
512	0.37
513	0.37
514	0.34
515	0.28
516	0.26
517	0.22
518	0.23
519	0.22
520	0.23
521	0.19
522	0.23
523	0.31
524	0.39
525	0.39
526	0.38
527	0.42
528	0.46
529	0.45
530	0.45
531	0.37
532	0.32
533	0.33
534	0.36
535	0.33
536	0.29
537	0.29
538	0.24
539	0.29
540	0.32
541	0.37
542	0.42
543	0.5
544	0.57
545	0.62
546	0.7
547	0.72
548	0.76
549	0.72
550	0.65
551	0.58
552	0.51
553	0.44
554	0.36
555	0.35
556	0.29
557	0.28
558	0.29
559	0.28
560	0.31
561	0.39
562	0.45
563	0.4
564	0.46
565	0.56
566	0.61
567	0.66
568	0.7
569	0.71
570	0.72
571	0.78
572	0.78
573	0.72
574	0.63
575	0.59
576	0.52
577	0.47
578	0.43
579	0.37
580	0.33
581	0.38
582	0.44
583	0.44
584	0.42
585	0.41
586	0.41
587	0.4
588	0.36
589	0.28
590	0.21
591	0.23
592	0.22
593	0.21
594	0.17
595	0.14
596	0.14
597	0.13
598	0.13
599	0.08
600	0.08
601	0.05
602	0.05
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.05
607	0.05
608	0.06
609	0.08
610	0.09
611	0.16
612	0.2
613	0.21
614	0.26
615	0.36
616	0.41
617	0.43
618	0.5
619	0.54
620	0.53
621	0.56
622	0.58
623	0.54
624	0.5
625	0.49
626	0.45
627	0.36
628	0.34
629	0.3
630	0.24
631	0.19
632	0.19
633	0.19
634	0.2
635	0.22
636	0.24
637	0.28
638	0.29
639	0.28
640	0.28
641	0.27
642	0.25
643	0.23
644	0.22
645	0.17
646	0.17
647	0.17
648	0.18
649	0.15
650	0.13
651	0.11
652	0.17
653	0.23
654	0.26
655	0.27
656	0.28
657	0.28
658	0.3
659	0.3
660	0.28
661	0.27
662	0.32
663	0.32
664	0.33
665	0.35
666	0.32
667	0.32
668	0.3
669	0.27
670	0.23
671	0.25
672	0.29
673	0.29
674	0.3
675	0.28
676	0.28
677	0.29
678	0.24
679	0.2
680	0.13
681	0.1
682	0.09
683	0.09
684	0.09
685	0.06
686	0.04
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.04
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.06
696	0.1
697	0.1
698	0.1
699	0.1
700	0.12
701	0.13
702	0.15
703	0.17
704	0.14
705	0.16
706	0.19
707	0.2
708	0.25
709	0.29
710	0.33
711	0.36
712	0.36
713	0.39
714	0.39
715	0.42
716	0.4
717	0.41
718	0.43
719	0.45
720	0.52
721	0.55
722	0.59
723	0.56
724	0.55
725	0.5
726	0.44
727	0.38
728	0.3
729	0.33
730	0.26
731	0.26
732	0.27
733	0.28
734	0.25

F0XFL6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer