Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4XZC4

Protein Details
Accession C4XZC4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27SLIAEERPKRVRRSPRLVLDAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 11.5, mito 8.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR030841  NTH1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000703  F:oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG clu:CLUG_01306  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPSKRSLIAEERPKRVRRSPRLVLDAETLKTEPEIKIESSLDKPLKEVFSDKSVTTTSFKHEVDDAKVKVEIEASVSGNTDTFASPEIESKSNVFQCVSPSDILPGQPKNWNLIYNEVVKMRALIVTPVDTMGCERIPETIAPGLIRRDPRAYRFRLLVSLMLSSQTKDEVTYVAVENLNNFYKTKGFDGLCIEAILKSTEAEIDFCIQKVGFHRRKAVYIKKASELLNEKFNADIPKNIKDTISLPGVGPKMGHLLLQAGWRINSGIGVDVHLHRLAQMWGWVPKSDKPESTRLALEDWLPKKYWSDINPLLVGFGQTVCVPNAGNCDVCTLAAGLCSKANKKLSNAAVTEARLAKLAKQRGDISGLIKLKHELQMLKKDSNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.76
3 0.78
4 0.77
5 0.79
6 0.8
7 0.81
8 0.82
9 0.77
10 0.7
11 0.66
12 0.59
13 0.5
14 0.42
15 0.33
16 0.25
17 0.24
18 0.24
19 0.18
20 0.17
21 0.19
22 0.18
23 0.21
24 0.23
25 0.26
26 0.25
27 0.33
28 0.33
29 0.3
30 0.3
31 0.32
32 0.32
33 0.3
34 0.31
35 0.26
36 0.28
37 0.3
38 0.29
39 0.27
40 0.26
41 0.27
42 0.26
43 0.25
44 0.25
45 0.29
46 0.29
47 0.28
48 0.31
49 0.32
50 0.36
51 0.42
52 0.37
53 0.32
54 0.33
55 0.31
56 0.28
57 0.25
58 0.18
59 0.13
60 0.15
61 0.14
62 0.13
63 0.14
64 0.13
65 0.12
66 0.12
67 0.1
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.1
72 0.1
73 0.13
74 0.16
75 0.17
76 0.18
77 0.19
78 0.24
79 0.24
80 0.25
81 0.22
82 0.2
83 0.21
84 0.23
85 0.23
86 0.18
87 0.16
88 0.17
89 0.17
90 0.18
91 0.2
92 0.2
93 0.2
94 0.24
95 0.25
96 0.27
97 0.28
98 0.29
99 0.26
100 0.28
101 0.28
102 0.27
103 0.28
104 0.25
105 0.23
106 0.2
107 0.19
108 0.15
109 0.13
110 0.1
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.12
131 0.13
132 0.15
133 0.17
134 0.17
135 0.22
136 0.24
137 0.31
138 0.38
139 0.4
140 0.39
141 0.4
142 0.39
143 0.35
144 0.34
145 0.28
146 0.21
147 0.17
148 0.14
149 0.13
150 0.12
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.15
175 0.16
176 0.19
177 0.2
178 0.18
179 0.17
180 0.16
181 0.11
182 0.11
183 0.09
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.13
198 0.23
199 0.27
200 0.3
201 0.37
202 0.38
203 0.44
204 0.5
205 0.54
206 0.53
207 0.54
208 0.54
209 0.49
210 0.52
211 0.47
212 0.44
213 0.42
214 0.34
215 0.32
216 0.3
217 0.28
218 0.24
219 0.26
220 0.24
221 0.19
222 0.22
223 0.2
224 0.24
225 0.26
226 0.26
227 0.24
228 0.22
229 0.23
230 0.21
231 0.2
232 0.16
233 0.14
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.15
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.1
252 0.09
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.09
266 0.11
267 0.12
268 0.15
269 0.17
270 0.19
271 0.19
272 0.23
273 0.29
274 0.3
275 0.33
276 0.34
277 0.4
278 0.42
279 0.43
280 0.4
281 0.35
282 0.33
283 0.29
284 0.28
285 0.29
286 0.28
287 0.27
288 0.26
289 0.25
290 0.26
291 0.29
292 0.32
293 0.27
294 0.34
295 0.36
296 0.39
297 0.4
298 0.37
299 0.34
300 0.27
301 0.24
302 0.16
303 0.11
304 0.08
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.15
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.15
319 0.11
320 0.09
321 0.11
322 0.12
323 0.11
324 0.13
325 0.17
326 0.19
327 0.26
328 0.33
329 0.34
330 0.37
331 0.45
332 0.49
333 0.52
334 0.51
335 0.48
336 0.45
337 0.42
338 0.43
339 0.36
340 0.3
341 0.25
342 0.25
343 0.27
344 0.32
345 0.38
346 0.37
347 0.41
348 0.43
349 0.43
350 0.47
351 0.43
352 0.37
353 0.38
354 0.37
355 0.33
356 0.32
357 0.31
358 0.3
359 0.33
360 0.35
361 0.33
362 0.38
363 0.47
364 0.51